RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636540.1

SRP54-AS1-205, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

BASIC

Gene SRP54-AS1, Length 565 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-205ENST00000636540 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SRP54-AS1-205ENST00000636540 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.92□□□□□ -0.02
SRP54-AS1-205ENST00000636540 ERVV-2B6SEH9 535 aa14.91□□□□□ -0.02
SRP54-AS1-205ENST00000636540 KCNQ4P56696 695 aa14.91□□□□□ -0.02
SRP54-AS1-205ENST00000636540 AKAP4Q5JQC9 854 aa14.91□□□□□ -0.02
SRP54-AS1-205ENST00000636540 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SRP54-AS1-205ENST00000636540 AKT1S1Q96B36 256 aa14.91□□□□□ -0.02
SRP54-AS1-205ENST00000636540 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.91□□□□□ -0.02
SRP54-AS1-205ENST00000636540 MAP3K5Q99683 1374 aa14.9□□□□□ -0.02
SRP54-AS1-205ENST00000636540 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SRP54-AS1-205ENST00000636540 RALBP1Q15311 655 aa14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-205ENST00000636540 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-205ENST00000636540 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-205ENST00000636540 KCPQ6ZWJ8 1503 aa14.88□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-205ENST00000636540 PRKAR2BP31323 418 aa14.88□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-205ENST00000636540 NUDCQ9Y266 331 aa14.88□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-205ENST00000636540 C4AP0C0L4 1744 aa14.88□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-205ENST00000636540 ATG3Q9NT62 314 aa14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-205ENST00000636540 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-205ENST00000636540 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-205ENST00000636540 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.86□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-205ENST00000636540 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-205ENST00000636540 SIK1P57059 783 aa14.86□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-205ENST00000636540 CABP4P57796 275 aa14.86□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-205ENST00000636540 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.032e-6■□□□□ 8.5
SRP54-AS1-205ENST00000636540 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.86□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-205ENST00000636540 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-205ENST00000636540 RNMTO43148 476 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-205ENST00000636540 SLC52A2Q9HAB3 445 aa14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-205ENST00000636540 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-205ENST00000636540 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.84□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-205ENST00000636540 LGR6Q9HBX8 967 aa14.84□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-205ENST00000636540 SPON1Q9HCB6 807 aa14.84□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-205ENST00000636540 FCHSD2O94868 740 aa14.83□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-205ENST00000636540 ZBTB7AO95365 584 aa14.83□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-205ENST00000636540 ITPK1Q13572 414 aa14.83□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-205ENST00000636540 LINC00116Q8NCU8 138 aa14.83□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-205ENST00000636540 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.83□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-205ENST00000636540 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa14.83□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-205ENST00000636540 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-205ENST00000636540 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.82□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-205ENST00000636540 MTFR1LQ9H019 292 aa14.82□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-205ENST00000636540 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-205ENST00000636540 KDM3BQ7LBC6 1761 aa14.82□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-205ENST00000636540 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-205ENST00000636540 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.81□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-205ENST00000636540 PTGER2P43116 358 aa14.81□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-205ENST00000636540 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.81□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-205ENST00000636540 ATP6V1AP38606 617 aa14.8□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-205ENST00000636540 AK7Q96M32 723 aa14.8□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-205ENST00000636540 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.8□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-205ENST00000636540 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.8□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-205ENST00000636540 IL17REQ8NFR9 667 aa14.79□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-205ENST00000636540 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.79□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-205ENST00000636540 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-205ENST00000636540 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa14.79□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-205ENST00000636540 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-205ENST00000636540 SLC16A10Q8TF71 515 aa14.78□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-205ENST00000636540 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-205ENST00000636540 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 SSFA2P28290 1259 aa14.77□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 GNPATO15228 680 aa14.76□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 TEFQ10587 303 aa14.76□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 SLC39A6Q13433 755 aa14.76□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 SCN7AQ01118 1682 aa14.76□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 PHF14O94880 888 aa14.75□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 FLAD1Q8NFF5 587 aa14.75□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.74□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 SMIM5Q71RC9 77 aa14.74□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 MCM10Q7L590 875 aa14.74□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 NEFMP07197 916 aa14.73□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 NFE2L2Q16236 605 aa14.73□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.73□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 BCORQ6W2J9 1755 aa14.73□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 HEG1Q9ULI3 1381 aa14.73□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 DCTN1Q14203 1278 aa14.72□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 ZNF790Q6PG37 636 aa14.72□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 DNAJC10Q8IXB1 793 aa14.72□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 TTC5Q8N0Z6 440 aa14.72□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 VSIG10Q8N0Z9 540 aa14.72□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 MSL1Q68DK7 614 aa14.71□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 ARXQ96QS3 562 aa14.71□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-205ENST00000636540 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa14.7□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-205ENST00000636540 RPS6KA4O75676 772 aa14.7□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-205ENST00000636540 POLD1P28340 1107 aa14.7□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-205ENST00000636540 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-205ENST00000636540 BTBD11A6QL63 1104 aa14.69□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-205ENST00000636540 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-205ENST00000636540 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-205ENST00000636540 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.1 ms