RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 TMX1Q9H3N1 280 aa21.09■□□□□ 0.97
GLIS1-202ENST00000628545 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.09■□□□□ 0.97
GLIS1-202ENST00000628545 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.09■□□□□ 0.97
GLIS1-202ENST00000628545 REC8O95072 547 aa21.09■□□□□ 0.97
GLIS1-202ENST00000628545 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
GLIS1-202ENST00000628545 SDSP20132 328 aa21.08■□□□□ 0.97
GLIS1-202ENST00000628545 IFT57Q9NWB7 429 aa21.08■□□□□ 0.97
GLIS1-202ENST00000628545 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 CUL4AQ13619 759 aa21.08■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa21.07■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 ABCA6Q8N139 1617 aa21.07■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 TCHHQ07283 1943 aa21.06■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 ICE2Q659A1 982 aa21.06■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.06■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 KIF1BPQ96EK5 621 aa21.06■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 FUCA2Q9BTY2 467 aa21.06■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 IL16Q14005 1332 aa21.05■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 NCAPGQ9BPX3 1015 aa21.05■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.05■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 LRMPQ12912 555 aa21.05■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 CTR9Q6PD62 1173 aa21.05■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 MCM2P49736 904 aa21.04■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 CNPY2Q9Y2B0 182 aa21.04■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 TMEM87AQ8NBN3 555 aa21.04■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 ERC2O15083 957 aa21.03■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF446Q9NWS9 450 aa21.03■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP21.03■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 V9GYY5 206 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 PTPRTO14522 1441 aa21.03■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.03■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 EP400NLQ6ZTU2 488 aa21.03■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.03■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.03■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa21.02■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC186Q7Z3E2 898 aa21.02■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF592Q92610 1267 aa21.02■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 GYS2P54840 703 aa21.02■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.02■□□□□ 0.96
GLIS1-202ENST00000628545 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.01■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 DEPDC5O75140 1603 aa21.01■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 UBE2HP62256 183 aa21.01■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.01■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 MUM1L1Q5H9M0 696 aa21■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 POLKQ9UBT6 870 aa21■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 PIK3R4Q99570 1358 aa21■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 DCTPP1Q9H773 170 aa21■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 CASQ1P31415 396 aa21■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 SYT10Q6XYQ8 523 aa21■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 TRIM66O15016 1216 aa20.99■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 KIF3BO15066 747 aa20.99■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 GUCY2CP25092 1073 aa20.99■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 CEP135Q66GS9 1140 aa20.99■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 C10orf67Q8IYJ2 551 aa20.98■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 BANK1Q8NDB2 785 aa20.98■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 ELF2Q15723 593 aa20.98■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 DRC7Q8IY82 874 aa20.98■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 MROH1Q8NDA8 1641 aa20.97■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 PTCH1Q13635 1447 aa20.97■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 MYO1CO00159 1063 aa20.97■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.97■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 NRBP1Q9UHY1 535 aa20.97■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 ATAD2Q6PL18 1390 aa20.97■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.97■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 CARD10Q9BWT7 1032 aa20.96■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 APBB1O00213 710 aa20.96■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 FIBPO43427 364 aa20.96■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.96■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.96■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 ABCC4O15439 1325 aa20.96■□□□□ 0.95
GLIS1-202ENST00000628545 NEK11Q8NG66 645 aa20.95■□□□□ 0.94
GLIS1-202ENST00000628545 LCMT1Q9UIC8 334 aa20.95■□□□□ 0.94
GLIS1-202ENST00000628545 PALD1Q9ULE6 856 aa20.95■□□□□ 0.94
GLIS1-202ENST00000628545 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.95■□□□□ 0.94
GLIS1-202ENST00000628545 GTF3C6Q969F1 213 aa20.95■□□□□ 0.94
GLIS1-202ENST00000628545 MYOM2P54296 1465 aa20.94■□□□□ 0.94
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC192P0DO97 292 aa20.94■□□□□ 0.94
GLIS1-202ENST00000628545 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
GLIS1-202ENST00000628545 SLFNL1Q499Z3 407 aa20.94■□□□□ 0.94
GLIS1-202ENST00000628545 CEP83Q9Y592 693 aa20.94■□□□□ 0.94
GLIS1-202ENST00000628545 RTL1A6NKG5 1358 aa20.93■□□□□ 0.94
GLIS1-202ENST00000628545 KNDC1Q76NI1 1749 aa20.93■□□□□ 0.94
GLIS1-202ENST00000628545 ATG3Q9NT62 314 aa20.93■□□□□ 0.94
GLIS1-202ENST00000628545 FAM200AQ8TCP9 573 aa20.93■□□□□ 0.94
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF428Q96B54 188 aa20.93■□□□□ 0.94
GLIS1-202ENST00000628545 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms