RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626257.2

CCZ1B-215, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, human

TSL 2 BASIC

Gene CCZ1B, Length 2,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCZ1B-215	ENST00000626257	PSME1	Q06323	249 aa		32.5	■■■□□ 2.79
CCZ1B-215	ENST00000626257	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		32.5	■■■□□ 2.79
CCZ1B-215	ENST00000626257	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		32.5	■■■□□ 2.79
CCZ1B-215	ENST00000626257	NBPF4	Q96M43	638 aa		32.5	■■■□□ 2.79
CCZ1B-215	ENST00000626257	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		32.5	■■■□□ 2.79
CCZ1B-215	ENST00000626257	TRAK2	O60296	914 aa		32.49	■■■□□ 2.79
CCZ1B-215	ENST00000626257	PDE1A	P54750	535 aa		32.49	■■■□□ 2.79
CCZ1B-215	ENST00000626257	RABEP1	Q15276	862 aa		32.49	■■■□□ 2.79
CCZ1B-215	ENST00000626257	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
CCZ1B-215	ENST00000626257	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		32.49	■■■□□ 2.79
CCZ1B-215	ENST00000626257	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		32.49	■■■□□ 2.79
CCZ1B-215	ENST00000626257	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		32.49	■■■□□ 2.79
CCZ1B-215	ENST00000626257	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		32.49	■■■□□ 2.79
CCZ1B-215	ENST00000626257	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CCZ1B-215	ENST00000626257	ATP8B2	P98198	1209 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CCZ1B-215	ENST00000626257	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CCZ1B-215	ENST00000626257	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CCZ1B-215	ENST00000626257	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
CCZ1B-215	ENST00000626257	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CCZ1B-215	ENST00000626257	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		32.45	■■■□□ 2.79
CCZ1B-215	ENST00000626257	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		32.44	■■■□□ 2.78
CCZ1B-215	ENST00000626257	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		32.44	■■■□□ 2.78
CCZ1B-215	ENST00000626257	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
CCZ1B-215	ENST00000626257	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
CCZ1B-215	ENST00000626257	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
CCZ1B-215	ENST00000626257	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
CCZ1B-215	ENST00000626257	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CCZ1B-215	ENST00000626257	LGR6	Q9HBX8	967 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CCZ1B-215	ENST00000626257	USP44	Q9H0E7	712 aa		32.42	■■■□□ 2.78
CCZ1B-215	ENST00000626257	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
CCZ1B-215	ENST00000626257	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
CCZ1B-215	ENST00000626257	REC8	O95072	547 aa		32.41	■■■□□ 2.78
CCZ1B-215	ENST00000626257	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
CCZ1B-215	ENST00000626257	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
CCZ1B-215	ENST00000626257	GBP4	Q96PP9	640 aa		32.4	■■■□□ 2.78
CCZ1B-215	ENST00000626257	ERC2	O15083	957 aa		32.39	■■■□□ 2.78
CCZ1B-215	ENST00000626257	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
CCZ1B-215	ENST00000626257	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
CCZ1B-215	ENST00000626257	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		32.38	■■■□□ 2.77
CCZ1B-215	ENST00000626257	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
CCZ1B-215	ENST00000626257	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
CCZ1B-215	ENST00000626257	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		32.37	■■■□□ 2.77
CCZ1B-215	ENST00000626257	MX1	P20591	662 aa		32.36	■■■□□ 2.77
CCZ1B-215	ENST00000626257	FSD2	A1L4K1	749 aa		32.36	■■■□□ 2.77
CCZ1B-215	ENST00000626257	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		32.35	■■■□□ 2.77
CCZ1B-215	ENST00000626257	HOXB7	P09629	217 aa		32.35	■■■□□ 2.77
CCZ1B-215	ENST00000626257	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		32.35	■■■□□ 2.77
CCZ1B-215	ENST00000626257	ORAI2	Q96SN7	254 aa		32.35	■■■□□ 2.77
CCZ1B-215	ENST00000626257	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
CCZ1B-215	ENST00000626257	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		32.34	■■■□□ 2.77
CCZ1B-215	ENST00000626257	KCNQ3	O43525	872 aa		32.33	■■■□□ 2.77
CCZ1B-215	ENST00000626257	GC	P02774	474 aa		32.33	■■■□□ 2.77
CCZ1B-215	ENST00000626257	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
CCZ1B-215	ENST00000626257	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.77
CCZ1B-215	ENST00000626257	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.77
CCZ1B-215	ENST00000626257	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		32.32	■■■□□ 2.77
CCZ1B-215	ENST00000626257	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		32.32	■■■□□ 2.76
CCZ1B-215	ENST00000626257	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		32.32	■■■□□ 2.76
CCZ1B-215	ENST00000626257	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		32.32	■■■□□ 2.76
CCZ1B-215	ENST00000626257	SSFA2	P28290	1259 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CCZ1B-215	ENST00000626257	TEF	Q10587	303 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CCZ1B-215	ENST00000626257	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CCZ1B-215	ENST00000626257	SSH3	Q8TE77	659 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CCZ1B-215	ENST00000626257	STAP2	Q9UGK3	403 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CCZ1B-215	ENST00000626257	BTBD11	A6QL63	1104 aa		32.3	■■■□□ 2.76
CCZ1B-215	ENST00000626257	ST18	O60284	1047 aa		32.3	■■■□□ 2.76
CCZ1B-215	ENST00000626257	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		32.3	■■■□□ 2.76
CCZ1B-215	ENST00000626257	ARX	Q96QS3	562 aa		32.3	■■■□□ 2.76
CCZ1B-215	ENST00000626257	PLEKHG5	O94827	1062 aa		32.29	■■■□□ 2.76
CCZ1B-215	ENST00000626257	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		32.28	■■■□□ 2.76
CCZ1B-215	ENST00000626257	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		32.28	■■■□□ 2.76
CCZ1B-215	ENST00000626257	SLIT3	O75094	1523 aa		32.28	■■■□□ 2.76
CCZ1B-215	ENST00000626257	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	32.27	■■■□□ 2.76
CCZ1B-215	ENST00000626257	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		32.27	■■■□□ 2.76
CCZ1B-215	ENST00000626257	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		32.27	■■■□□ 2.76
CCZ1B-215	ENST00000626257	PTMS	P20962	102 aa		32.26	■■■□□ 2.76
CCZ1B-215	ENST00000626257	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		32.26	■■■□□ 2.76
CCZ1B-215	ENST00000626257	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		32.26	■■■□□ 2.76
CCZ1B-215	ENST00000626257	NCAPD2	Q15021	1401 aa		32.26	■■■□□ 2.75
CCZ1B-215	ENST00000626257	POLA2	Q14181	598 aa		32.26	■■■□□ 2.75
CCZ1B-215	ENST00000626257	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		32.25	■■■□□ 2.75
CCZ1B-215	ENST00000626257	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		32.25	■■■□□ 2.75
CCZ1B-215	ENST00000626257	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
CCZ1B-215	ENST00000626257	BEND3	Q5T5X7	828 aa		32.25	■■■□□ 2.75
CCZ1B-215	ENST00000626257	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		32.25	■■■□□ 2.75
CCZ1B-215	ENST00000626257	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		32.25	■■■□□ 2.75
CCZ1B-215	ENST00000626257	RILPL2	Q969X0	211 aa		32.25	■■■□□ 2.75
CCZ1B-215	ENST00000626257	PXDN	Q92626	1479 aa		32.25	■■■□□ 2.75
CCZ1B-215	ENST00000626257	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		32.24	■■■□□ 2.75
CCZ1B-215	ENST00000626257	CHML	P26374	656 aa		32.24	■■■□□ 2.75
CCZ1B-215	ENST00000626257	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
CCZ1B-215	ENST00000626257	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		32.24	■■■□□ 2.75
CCZ1B-215	ENST00000626257	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		32.24	■■■□□ 2.75
CCZ1B-215	ENST00000626257	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
CCZ1B-215	ENST00000626257	AOX1	Q06278	1338 aa		32.23	■■■□□ 2.75
CCZ1B-215	ENST00000626257	RAB11FIP3	O75154	756 aa		32.23	■■■□□ 2.75
CCZ1B-215	ENST00000626257	ANXA1	P04083	346 aa		32.23	■■■□□ 2.75
CCZ1B-215	ENST00000626257	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
CCZ1B-215	ENST00000626257	NUCB2	P80303	420 aa		32.2	■■■□□ 2.75
CCZ1B-215	ENST00000626257	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		32.2	■■■□□ 2.75

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms