RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 NECTIN2Q92692 538 aa16.47■□□□□ 0.23
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C9orf170-201ENST00000623052 TMX3Q96JJ7 454 aa16.34■□□□□ 0.21
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C9orf170-201ENST00000623052 GOLGA6L22H0YM25 854 aa16.33■□□□□ 0.21
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C9orf170-201ENST00000623052 NUTM1Q86Y26 1132 aa16.32■□□□□ 0.2
C9orf170-201ENST00000623052 IP6K1Q92551 441 aa16.32■□□□□ 0.2
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C9orf170-201ENST00000623052 PI4K2BQ8TCG2 481 aa16.32■□□□□ 0.2
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C9orf170-201ENST00000623052 ZNF445P59923 1031 aa16.32■□□□□ 0.2
C9orf170-201ENST00000623052 CUL4AQ13619 759 aa16.32■□□□□ 0.2
C9orf170-201ENST00000623052 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa16.32■□□□□ 0.2
C9orf170-201ENST00000623052 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
C9orf170-201ENST00000623052 CHPF2Q9P2E5 772 aa16.32■□□□□ 0.2
C9orf170-201ENST00000623052 PHF8Q9UPP1 1060 aa16.32■□□□□ 0.2
C9orf170-201ENST00000623052 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
C9orf170-201ENST00000623052 ADCY9O60503 1353 aa16.31■□□□□ 0.2
C9orf170-201ENST00000623052 AOX1Q06278 1338 aa16.31■□□□□ 0.2
C9orf170-201ENST00000623052 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa16.31■□□□□ 0.2
C9orf170-201ENST00000623052 ANO2Q9NQ90 1003 aa16.31■□□□□ 0.2
C9orf170-201ENST00000623052 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
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