RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619193.4

RDM1-223, Transcript of RAD52 motif containing 1, human

TSL 1 (best)

Gene RDM1, Length 686 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RDM1-223	ENST00000619193	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	MBIP	Q9NS73	344 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	USP54	Q70EL1	1684 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	ATF3	P18847	181 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	BAG6	P46379	1132 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	LNPK	Q9C0E8	428 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	CHD4	Q14839	1912 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	USP31	Q70CQ4	1352 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	HAX1	O00165	279 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	GCC1	Q96CN9	775 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	PANK2	Q9BZ23	570 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	FBXO3	Q9UK99	471 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	KIAA0232	Q92628	1395 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	TRAK2	O60296	914 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	HMOX1	P09601	288 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	GNAI1	P63096	354 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	CFAP44	Q96MT7	982 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	DCTPP1	Q9H773	170 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	CEP350	Q5VT06	3117 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	PTPRU	Q92729	1446 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	CHL1	O00533	1208 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	7.43	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	FAM83G	A6ND36	823 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	FAM182B	Q5T319	152 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	TTC22	Q5TAA0	569 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	ERBB4	Q15303	1308 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	RTL1	A6NKG5	1358 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	KRT24	Q2M2I5	525 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	CEP85	Q6P2H3	762 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	HSCB	Q8IWL3	235 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	IL17RA	Q96F46	866 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	USP6	P35125	1406 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	PIK3C2A	O00443	1686 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	RREB1	Q92766	1687 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	CDC45	O75419	566 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	SSFA2	P28290	1259 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	CLCN1	P35523	988 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	DCTN1	Q14203	1278 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	USP26	Q9BXU7	913 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	ARHGEF10	O15013	1369 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	KDR	P35968	1356 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	DISP2	A7MBM2	1401 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	DCC	P43146	1447 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RDM1-223	ENST00000619193	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		7.4	□□□□□ -1.23
RDM1-223	ENST00000619193	SLIT2	O94813	1529 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RDM1-223	ENST00000619193	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23

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