RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 RAI14Q9P0K7 980 aa24.54■■□□□ 1.52
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PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC69A6NI79 296 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 ANXA1P04083 346 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 DISP1Q96F81 1524 aa24.53■■□□□ 1.52
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PTPRJ-208ENST00000615445 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.47■■□□□ 1.51
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PTPRJ-208ENST00000615445 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.44■■□□□ 1.5
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PTPRJ-208ENST00000615445 MPNDQ8N594 471 aa24.42■■□□□ 1.5
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PTPRJ-208ENST00000615445 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.41■■□□□ 1.5
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PTPRJ-208ENST00000615445 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
PTPRJ-208ENST00000615445 GPS2Q13227 327 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRJ-208ENST00000615445 ZPR1O75312 459 aa24.4■■□□□ 1.5
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PTPRJ-208ENST00000615445 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 PIK3C2GO75747 1445 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 EPS15P42566 896 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 FILIP1LQ4L180 1135 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-208ENST00000615445 CAVIN4Q5BKX8 364 aa24.38■■□□□ 1.49
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