RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614927.1

NPIPB11-202, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B11, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB11, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB11-202ENST00000614927 KAT6BQ8WYB5 2073 aa19.22■□□□□ 0.67
NPIPB11-202ENST00000614927 GNAI1P63096 354 aa19.22■□□□□ 0.67
NPIPB11-202ENST00000614927 GOLGA2Q08379 1002 aa19.22■□□□□ 0.67
NPIPB11-202ENST00000614927 ASAP1Q9ULH1 1129 aa19.22■□□□□ 0.67
NPIPB11-202ENST00000614927 ZBED9Q6R2W3 1325 aa19.22■□□□□ 0.67
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF521Q96K83 1311 aa19.22■□□□□ 0.67
NPIPB11-202ENST00000614927 KCNQ3O43525 872 aa19.21■□□□□ 0.67
NPIPB11-202ENST00000614927 TTC5Q8N0Z6 440 aa19.21■□□□□ 0.67
NPIPB11-202ENST00000614927 CDCA7LQ96GN5 454 aa19.21■□□□□ 0.67
NPIPB11-202ENST00000614927 CFAP44Q96MT7 982 aa19.21■□□□□ 0.67
NPIPB11-202ENST00000614927 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
NPIPB11-202ENST00000614927 IFT57Q9NWB7 429 aa19.21■□□□□ 0.67
NPIPB11-202ENST00000614927 DOT1LQ8TEK3 1739 aa19.2■□□□□ 0.66
NPIPB11-202ENST00000614927 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa19.2■□□□□ 0.66
NPIPB11-202ENST00000614927 CHL1O00533 1208 aa19.2■□□□□ 0.66
NPIPB11-202ENST00000614927 APBA3O96018 575 aa19.2■□□□□ 0.66
NPIPB11-202ENST00000614927 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
NPIPB11-202ENST00000614927 ATG3Q9NT62 314 aa19.2■□□□□ 0.66
NPIPB11-202ENST00000614927 IL16Q14005 1332 aa19.2■□□□□ 0.66
NPIPB11-202ENST00000614927 SCN11AQ9UI33 1791 aa19.19■□□□□ 0.66
NPIPB11-202ENST00000614927 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
NPIPB11-202ENST00000614927 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
NPIPB11-202ENST00000614927 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
NPIPB11-202ENST00000614927 MBIPQ9NS73 344 aa19.19■□□□□ 0.66
NPIPB11-202ENST00000614927 MRC1P22897 1456 aa19.18■□□□□ 0.66
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF853P0CG23 659 aa19.18■□□□□ 0.66
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF790Q6PG37 636 aa19.18■□□□□ 0.66
NPIPB11-202ENST00000614927 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
NPIPB11-202ENST00000614927 MYH16Q9H6N6 1097 aa19.18■□□□□ 0.66
NPIPB11-202ENST00000614927 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa19.17■□□□□ 0.66
NPIPB11-202ENST00000614927 E9PSI1 815 aa19.16■□□□□ 0.66
NPIPB11-202ENST00000614927 BABAM1Q9NWV8 329 aa19.16■□□□□ 0.66
NPIPB11-202ENST00000614927 SLFN5Q08AF3 891 aa19.15■□□□□ 0.66
NPIPB11-202ENST00000614927 PALLDQ8WX93 1383 aa19.15■□□□□ 0.66
NPIPB11-202ENST00000614927 NHSQ6T4R5 1651 aa19.14■□□□□ 0.66
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 FMNL2Q96PY5 1086 aa19.14■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 FANCIQ9NVI1 1328 aa19.14■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 KRT24Q2M2I5 525 aa19.13■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 ITGB4P16144 1822 aa19.13■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 KCNQ4P56696 695 aa19.12■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 SBF2Q86WG5 1849 aa19.11■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa19.11■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 BAG6P46379 1132 aa19.11■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 SIK1P57059 783 aa19.11■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 CCDC125Q86Z20 511 aa19.11■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP19.11■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 ATP6V1AP38606 617 aa19.1■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 DEFB132Q7Z7B7 95 aa19.1■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 C8orf58Q8NAV2 365 aa19.1■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 PLSCR1O15162 318 aa19.09■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 DUSP27Q5VZP5 1158 aa19.09■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 SLC4A9Q96Q91 983 aa19.09■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 BTAF1O14981 1849 aa19.09■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
NPIPB11-202ENST00000614927 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa19.08■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 TXNRD1Q16881 649 aa19.08■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 TSPYL6Q8N831 410 aa19.08■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 HEG1Q9ULI3 1381 aa19.07■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 DNAJC10Q8IXB1 793 aa19.07■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 KCPQ6ZWJ8 1503 aa19.06■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 VSIG10Q8N0Z9 540 aa19.06■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 NECTIN2Q92692 538 aa19.06■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 EP400Q96L91 3159 aa19.06■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 ITPK1Q13572 414 aa19.05■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 PROM2Q8N271 834 aa19.05■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 CAMKK2Q96RR4 588 aa19.05■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 USP16Q9Y5T5 823 aa19.05■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 SLC27A3Q5K4L6 730 aa19.04■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 LRRC4BQ9NT99 713 aa19.04■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 KDM3BQ7LBC6 1761 aa19.03■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 PAPPAQ13219 1627 aa19.03■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 STARD3NLO95772 234 aa19.02■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa19.02■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 LINC00116Q8NCU8 138 aa19.02■□□□□ 0.64
NPIPB11-202ENST00000614927 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.63
NPIPB11-202ENST00000614927 VAMP4O75379 141 aa19.01■□□□□ 0.63
NPIPB11-202ENST00000614927 A1BGP04217 495 aa19■□□□□ 0.63
NPIPB11-202ENST00000614927 HOXB7P09629 217 aa19■□□□□ 0.63
NPIPB11-202ENST00000614927 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
NPIPB11-202ENST00000614927 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
NPIPB11-202ENST00000614927 CANXP27824 592 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
NPIPB11-202ENST00000614927 CRKLP46109 303 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
NPIPB11-202ENST00000614927 CCDC87Q9NVE4 849 aa18.98■□□□□ 0.63
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
NPIPB11-202ENST00000614927 UBR2Q8IWV8 1755 aa18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.8 ms