RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608306.5

LINC00635-217, long intergenic non-protein coding RNA 635, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00635, Length 873 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00635-217ENST00000608306 WNK3Q9BYP7 1800 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00635-217ENST00000608306 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
LINC00635-217ENST00000608306 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
LINC00635-217ENST00000608306 SLC15A2Q16348 729 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00635-217ENST00000608306 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00635-217ENST00000608306 CGNL1Q0VF96 1302 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00635-217ENST00000608306 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
LINC00635-217ENST00000608306 TATP17735 454 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
LINC00635-217ENST00000608306 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
LINC00635-217ENST00000608306 RTL1A6NKG5 1358 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00635-217ENST00000608306 FLT4P35916 1363 aa11.73□□□□□ -0.53
LINC00635-217ENST00000608306 PSEN1P49768 467 aa11.73□□□□□ -0.53
LINC00635-217ENST00000608306 INSRP06213 1382 aa11.72□□□□□ -0.53
LINC00635-217ENST00000608306 KCNQ4P56696 695 aa11.72□□□□□ -0.53
LINC00635-217ENST00000608306 PANK3Q9H999 370 aa11.72□□□□□ -0.53
LINC00635-217ENST00000608306 KAT6BQ8WYB5 2073 aa11.71□□□□□ -0.53
LINC00635-217ENST00000608306 LRRC4BQ9NT99 713 aa11.71□□□□□ -0.53
LINC00635-217ENST00000608306 MEGF6O75095 1541 aa11.7□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 ZNF827Q17R98 1081 aa11.69□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 SLC27A3Q5K4L6 730 aa11.69□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa11.69□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 POLKQ9UBT6 870 aa11.69□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 NHSQ6T4R5 1651 aa11.68□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 KIF24Q5T7B8 1368 aa11.68□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 WASHC2AQ641Q2 1341 aa11.68□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa11.68□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa11.68□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 POTEJP0CG39 1038 aa11.68□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa11.68□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 MTFR1LQ9H019 292 aa11.68□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa11.68□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 KIF20BQ96Q89 1820 aa11.67□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 RGPD2P0DJD1 1756 aa11.67□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 PTGER2P43116 358 aa11.67□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 EYA1Q99502 592 aa11.67□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 MYOM1P52179 1685 aa11.66□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 CYP27B1O15528 508 aa11.66□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 MORC1Q86VD1 984 aa11.66□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 OTUD5Q96G74 571 aa11.66□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 SPG7Q9UQ90 795 aa11.66□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 KNSTRNQ9Y448 316 aa11.66□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 BTAF1O14981 1849 aa11.65□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
LINC00635-217ENST00000608306 SEC24BO95487 1268 aa11.64□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 NSD2O96028 1365 aa11.64□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 ARXQ96QS3 562 aa11.63□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 SYT17Q9BSW7 474 aa11.63□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 YY1P25490 414 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 POLD1P28340 1107 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 CASZ1Q86V15 1759 aa11.62□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 DOT1LQ8TEK3 1739 aa11.61□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 IFNL2Q8IZJ0 200 aa11.61□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 SLC16A10Q8TF71 515 aa11.61□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 PIGBQ92521 554 aa11.61□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 OCEL1Q9H607 264 aa11.61□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 PALLDQ8WX93 1383 aa11.61□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 KIF7Q2M1P5 1343 aa11.6□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 PHKG2P15735 406 aa11.6□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 PLCG2P16885 1265 aa11.6□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP11.6□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 TMOD3Q9NYL9 352 aa11.6□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 MSL1Q68DK7 614 aa11.59□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 MAMSTRQ6ZN01 415 aa11.59□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 SHANK3Q9BYB0 1731 aa11.59□□□□□ -0.55
LINC00635-217ENST00000608306 PAPPAQ13219 1627 aa11.58□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 GOLGA2Q08379 1002 aa11.58□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 AK7Q96M32 723 aa11.58□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 ASAP1Q9ULH1 1129 aa11.58□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 PHF14O94880 888 aa11.57□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 GPR162Q16538 588 aa11.57□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 SULT6B1Q6IMI4 303 aa11.57□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 AEBP1Q8IUX7 1158 aa11.57□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 IGSF1Q8N6C5 1336 aa11.57□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa11.56□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 ATP6V1AP38606 617 aa11.56□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 SIK1P57059 783 aa11.56□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 NCAPD2Q15021 1401 aa11.56□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 SMIM5Q71RC9 77 aa11.56□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms