RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
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RABGEF1-209ENST00000607882 PALLDQ8WX93 1383 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 NHSQ6T4R5 1651 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 BCL9O00512 1426 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 PHF14O94880 888 aa16.58■□□□□ 0.25
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RABGEF1-209ENST00000607882 MCM10Q7L590 875 aa16.57■□□□□ 0.24
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RABGEF1-209ENST00000607882 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
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RABGEF1-209ENST00000607882 PKD1L3Q7Z443 1732 aa16.56■□□□□ 0.24
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RABGEF1-209ENST00000607882 SLC4A9Q96Q91 983 aa16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 ITPK1Q13572 414 aa16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP6V1AP38606 617 aa16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 MIS18AQ9NYP9 233 aa16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 ITGB4P16144 1822 aa16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 SIK1P57059 783 aa16.54■□□□□ 0.24
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RABGEF1-209ENST00000607882 AKAP4Q5JQC9 854 aa16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 RNMTO43148 476 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 RALBP1Q15311 655 aa16.53■□□□□ 0.24
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RABGEF1-209ENST00000607882 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC00116Q8NCU8 138 aa16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 KCNQ3O43525 872 aa16.52■□□□□ 0.23
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-209ENST00000607882 GNAT3A8MTJ3 354 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC52A2Q9HAB3 445 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-209ENST00000607882 WWC3Q9ULE0 1092 aa16.5■□□□□ 0.23
RABGEF1-209ENST00000607882 ERVV-2B6SEH9 535 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-209ENST00000607882 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-209ENST00000607882 HOMEZQ8IX15 550 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-209ENST00000607882 AKT1S1Q96B36 256 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-209ENST00000607882 ADAMTS8Q9UP79 889 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-209ENST00000607882 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-209ENST00000607882 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
RABGEF1-209ENST00000607882 GNPATO15228 680 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC27A3Q5K4L6 730 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-209ENST00000607882 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-209ENST00000607882 TEFQ10587 303 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-209ENST00000607882 FCHSD2O94868 740 aa16.47■□□□□ 0.23
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RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-209ENST00000607882 MAP3K5Q99683 1374 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-209ENST00000607882 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-209ENST00000607882 GAS2L2Q8NHY3 880 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAJC10Q8IXB1 793 aa16.46■□□□□ 0.23
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RABGEF1-209ENST00000607882 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-209ENST00000607882 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP16.46■□□□□ 0.23
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RABGEF1-209ENST00000607882 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1-209ENST00000607882 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1-209ENST00000607882 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1-209ENST00000607882 SPON1Q9HCB6 807 aa16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1-209ENST00000607882 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa16.45■□□□□ 0.22
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RABGEF1-209ENST00000607882 NEFMP07197 916 aa16.43■□□□□ 0.22
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RABGEF1-209ENST00000607882 MRS2Q9HD23 443 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-209ENST00000607882 LY75O60449 1722 aa16.42■□□□□ 0.22
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RABGEF1-209ENST00000607882 RIPK4P57078 832 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-209ENST00000607882 TTC5Q8N0Z6 440 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGEF1-209ENST00000607882 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
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RABGEF1-209ENST00000607882 PAPPAQ13219 1627 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-209ENST00000607882 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF790Q6PG37 636 aa16.4■□□□□ 0.22
RABGEF1-209ENST00000607882 SCN11AQ9UI33 1791 aa16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM9BQ8IZU0 186 aa16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 NFE2L2Q16236 605 aa16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 MTFR1LQ9H019 292 aa16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 APAF1O14727 1248 aa16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 C5P01031 1676 aa16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1-209ENST00000607882 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
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