RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594764.5

RGPD4-AS1-204, Transcript of RGPD4 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 5

Gene RGPD4-AS1, Length 670 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 CABP4P57796 275 aa14.83□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 PAPPAQ13219 1627 aa14.82□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 ERVV-2B6SEH9 535 aa14.82□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.82□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 CFAP53Q96M91 514 aa14.82□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa14.82□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.81□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 SIK1P57059 783 aa14.81□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 ITPK1Q13572 414 aa14.81□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 IFFO2Q5TF58 517 aa14.81□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.81□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 ARXQ96QS3 562 aa14.81□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 MAP3K5Q99683 1374 aa14.81□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 AKAP4Q5JQC9 854 aa14.8□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 LINC00116Q8NCU8 138 aa14.8□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.8□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.8□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 ITGB4P16144 1822 aa14.8□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 ATP6V1AP38606 617 aa14.79□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP14.79□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 LY75O60449 1722 aa14.78□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.78□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 RNMTO43148 476 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 PRKAR2BP31323 418 aa14.78□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.78□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 UTRNP46939 3433 aa14.78□□□□□ -0.04
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 PHF14O94880 888 aa14.77□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 NUDCQ9Y266 331 aa14.77□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 SLC39A6Q13433 755 aa14.76□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 GPR162Q16538 588 aa14.76□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 MSL1Q68DK7 614 aa14.76□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 AK7Q96M32 723 aa14.76□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 IL17REQ8NFR9 667 aa14.75□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 SLC52A2Q9HAB3 445 aa14.75□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 SLC16A10Q8TF71 515 aa14.74□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 GNPATO15228 680 aa14.73□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.72□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 POTEHQ6S545 545 aa14.72□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.72□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 FCHSD2O94868 740 aa14.71□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 RALBP1Q15311 655 aa14.71□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 KLHL34Q8N239 644 aa14.71□□□□□ -0.05
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 C5P01031 1676 aa14.71□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa14.71□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 C4BP0C0L5 1744 aa14.7□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 POLD1P28340 1107 aa14.7□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 DCTN1Q14203 1278 aa14.7□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 MCM10Q7L590 875 aa14.7□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 DNAJC10Q8IXB1 793 aa14.69□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 TAF1LQ8IZX4 1826 aa14.69□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 KCNQ3O43525 872 aa14.68□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 FLAD1Q8NFF5 587 aa14.68□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 SCN11AQ9UI33 1791 aa14.68□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 SSFA2P28290 1259 aa14.67□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 TEFQ10587 303 aa14.67□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.67□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 GRIN3BO60391 1043 aa14.66□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 TRAPPC3LQ5T215 181 aa14.66□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 MRC1P22897 1456 aa14.65□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 RPS6KA4O75676 772 aa14.65□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.65□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 COL24A1Q17RW2 1714 aa14.65□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 QSER1Q2KHR3 1735 aa14.65□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa14.65□□□□□ -0.06
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 BTBD11A6QL63 1104 aa14.64□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 ZNF790Q6PG37 636 aa14.64□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 TTC5Q8N0Z6 440 aa14.64□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.64□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa14.63□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 CCDC146Q8IYE0 955 aa14.63□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 UBR3Q6ZT12 1888 aa14.63□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 KCPQ6ZWJ8 1503 aa14.62□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa14.62□□□□□ -0.07
RGPD4-AS1-204ENST00000594764 RFC4P35249 363 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms