RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594693.5

ZNF548-204, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF548, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-204ENST00000594693 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.23■■□□□ 1.31
ZNF548-204ENST00000594693 TEFQ10587 303 aa23.22■■□□□ 1.31
ZNF548-204ENST00000594693 PROM2Q8N271 834 aa23.21■■□□□ 1.31
ZNF548-204ENST00000594693 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
ZNF548-204ENST00000594693 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
ZNF548-204ENST00000594693 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
ZNF548-204ENST00000594693 SCN11AQ9UI33 1791 aa23.21■■□□□ 1.31
ZNF548-204ENST00000594693 MRC1P22897 1456 aa23.2■■□□□ 1.3
ZNF548-204ENST00000594693 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
ZNF548-204ENST00000594693 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
ZNF548-204ENST00000594693 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
ZNF548-204ENST00000594693 CCDC27Q2M243 656 aa23.19■■□□□ 1.3
ZNF548-204ENST00000594693 ITGB4P16144 1822 aa23.18■■□□□ 1.3
ZNF548-204ENST00000594693 TXNRD1Q16881 649 aa23.17■■□□□ 1.3
ZNF548-204ENST00000594693 BTAF1O14981 1849 aa23.17■■□□□ 1.3
ZNF548-204ENST00000594693 PALLDQ8WX93 1383 aa23.16■■□□□ 1.3
ZNF548-204ENST00000594693 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.16■■□□□ 1.3
ZNF548-204ENST00000594693 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.16■■□□□ 1.3
ZNF548-204ENST00000594693 SLC39A6Q13433 755 aa23.16■■□□□ 1.3
ZNF548-204ENST00000594693 NGEFQ8N5V2 710 aa23.16■■□□□ 1.3
ZNF548-204ENST00000594693 BTBD11A6QL63 1104 aa23.15■■□□□ 1.3
ZNF548-204ENST00000594693 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
ZNF548-204ENST00000594693 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.14■■□□□ 1.3
ZNF548-204ENST00000594693 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.14■■□□□ 1.29
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF790Q6PG37 636 aa23.14■■□□□ 1.29
ZNF548-204ENST00000594693 WWC1Q8IX03 1113 aa23.14■■□□□ 1.29
ZNF548-204ENST00000594693 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.13■■□□□ 1.29
ZNF548-204ENST00000594693 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.13■■□□□ 1.29
ZNF548-204ENST00000594693 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.12■■□□□ 1.29
ZNF548-204ENST00000594693 SIK1P57059 783 aa23.12■■□□□ 1.29
ZNF548-204ENST00000594693 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.12■■□□□ 1.29
ZNF548-204ENST00000594693 KCNQ3O43525 872 aa23.11■■□□□ 1.29
ZNF548-204ENST00000594693 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.11■■□□□ 1.29
ZNF548-204ENST00000594693 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
ZNF548-204ENST00000594693 CHL1O00533 1208 aa23.1■■□□□ 1.29
ZNF548-204ENST00000594693 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
ZNF548-204ENST00000594693 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
ZNF548-204ENST00000594693 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF853P0CG23 659 aa23.09■■□□□ 1.29
ZNF548-204ENST00000594693 KCNQ4P56696 695 aa23.09■■□□□ 1.29
ZNF548-204ENST00000594693 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.09■■□□□ 1.29
ZNF548-204ENST00000594693 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
ZNF548-204ENST00000594693 CFAP44Q96MT7 982 aa23.08■■□□□ 1.29
ZNF548-204ENST00000594693 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
ZNF548-204ENST00000594693 ATP6V1AP38606 617 aa23.07■■□□□ 1.28
ZNF548-204ENST00000594693 WDR63Q8IWG1 891 aa23.07■■□□□ 1.28
ZNF548-204ENST00000594693 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.07■■□□□ 1.28
ZNF548-204ENST00000594693 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
ZNF548-204ENST00000594693 ITPK1Q13572 414 aa23.06■■□□□ 1.28
ZNF548-204ENST00000594693 IFT57Q9NWB7 429 aa23.06■■□□□ 1.28
ZNF548-204ENST00000594693 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.06■■□□□ 1.28
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF521Q96K83 1311 aa23.06■■□□□ 1.28
ZNF548-204ENST00000594693 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.05■■□□□ 1.28
ZNF548-204ENST00000594693 IL16Q14005 1332 aa23.05■■□□□ 1.28
ZNF548-204ENST00000594693 LY75O60449 1722 aa23.05■■□□□ 1.28
ZNF548-204ENST00000594693 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
ZNF548-204ENST00000594693 GNAI1P63096 354 aa23.04■■□□□ 1.28
ZNF548-204ENST00000594693 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
ZNF548-204ENST00000594693 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.03■■□□□ 1.28
ZNF548-204ENST00000594693 PAPPAQ13219 1627 aa23.03■■□□□ 1.28
ZNF548-204ENST00000594693 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.02■■□□□ 1.28
ZNF548-204ENST00000594693 RREB1Q92766 1687 aa23.01■■□□□ 1.27
ZNF548-204ENST00000594693 NBPF14Q5TI25 921 aa23.01■■□□□ 1.27
ZNF548-204ENST00000594693 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.01■■□□□ 1.27
ZNF548-204ENST00000594693 AKT1S1Q96B36 256 aa23.01■■□□□ 1.27
ZNF548-204ENST00000594693 MBIPQ9NS73 344 aa23.01■■□□□ 1.27
ZNF548-204ENST00000594693 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
ZNF548-204ENST00000594693 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23■■□□□ 1.27
ZNF548-204ENST00000594693 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
ZNF548-204ENST00000594693 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ZNF548-204ENST00000594693 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.98■■□□□ 1.27
ZNF548-204ENST00000594693 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ZNF548-204ENST00000594693 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.97■■□□□ 1.27
ZNF548-204ENST00000594693 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ZNF548-204ENST00000594693 SLC15A2Q16348 729 aa22.97■■□□□ 1.27
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF827Q17R98 1081 aa22.97■■□□□ 1.27
ZNF548-204ENST00000594693 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ZNF548-204ENST00000594693 STK32BQ9NY57 414 aa22.97■■□□□ 1.27
ZNF548-204ENST00000594693 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.96■■□□□ 1.27
ZNF548-204ENST00000594693 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
ZNF548-204ENST00000594693 USP16Q9Y5T5 823 aa22.96■■□□□ 1.27
ZNF548-204ENST00000594693 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
ZNF548-204ENST00000594693 STARD3NLO95772 234 aa22.95■■□□□ 1.26
ZNF548-204ENST00000594693 GOLGA2Q08379 1002 aa22.95■■□□□ 1.26
ZNF548-204ENST00000594693 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.95■■□□□ 1.26
ZNF548-204ENST00000594693 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
ZNF548-204ENST00000594693 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.95■■□□□ 1.26
ZNF548-204ENST00000594693 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.94■■□□□ 1.26
ZNF548-204ENST00000594693 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ZNF548-204ENST00000594693 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ZNF548-204ENST00000594693 KRT24Q2M2I5 525 aa22.93■■□□□ 1.26
ZNF548-204ENST00000594693 AK7Q96M32 723 aa22.92■■□□□ 1.26
ZNF548-204ENST00000594693 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.92■■□□□ 1.26
ZNF548-204ENST00000594693 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.92■■□□□ 1.26
ZNF548-204ENST00000594693 SLFN5Q08AF3 891 aa22.91■■□□□ 1.26
ZNF548-204ENST00000594693 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.91■■□□□ 1.26
ZNF548-204ENST00000594693 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.9■■□□□ 1.26
ZNF548-204ENST00000594693 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms