RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593438.1

HOXA-AS2-211, HOXA cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXA-AS2, Length 629 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS2-211ENST00000593438 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RIPK4P57078 832 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXA-AS2-211ENST00000593438 DCTN1Q14203 1278 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SLC27A3Q5K4L6 730 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TMPOP42166 694 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
HOXA-AS2-211ENST00000593438 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
HOXA-AS2-211ENST00000593438 FAM9BQ8IZU0 186 aa19.59■□□□□ 0.73
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
HOXA-AS2-211ENST00000593438 LRRC4BQ9NT99 713 aa19.59■□□□□ 0.73
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RREB1Q92766 1687 aa19.59■□□□□ 0.73
HOXA-AS2-211ENST00000593438 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa19.57■□□□□ 0.72
HOXA-AS2-211ENST00000593438 APAF1O14727 1248 aa19.57■□□□□ 0.72
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SIK1P57059 783 aa19.57■□□□□ 0.72
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SLC39A6Q13433 755 aa19.57■□□□□ 0.72
HOXA-AS2-211ENST00000593438 DLG5Q8TDM6 1919 aa19.57■□□□□ 0.72
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa19.57■□□□□ 0.72
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NUP188Q5SRE5 1749 aa19.56■□□□□ 0.72
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa19.56■□□□□ 0.72
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ATP6V1AP38606 617 aa19.56■□□□□ 0.72
HOXA-AS2-211ENST00000593438 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
HOXA-AS2-211ENST00000593438 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
HOXA-AS2-211ENST00000593438 STK32BQ9NY57 414 aa19.56■□□□□ 0.72
HOXA-AS2-211ENST00000593438 LY75O60449 1722 aa19.56■□□□□ 0.72
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MRC1P22897 1456 aa19.55■□□□□ 0.72
HOXA-AS2-211ENST00000593438 BTBD11A6QL63 1104 aa19.55■□□□□ 0.72
HOXA-AS2-211ENST00000593438 LMOD3Q0VAK6 560 aa19.55■□□□□ 0.72
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TTC5Q8N0Z6 440 aa19.55■□□□□ 0.72
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MIER1Q8N108 512 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CCER2I3L3R5 266 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
HOXA-AS2-211ENST00000593438 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SLC15A2Q16348 729 aa19.52■□□□□ 0.72
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ITPK1Q13572 414 aa19.51■□□□□ 0.71
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ZNF790Q6PG37 636 aa19.51■□□□□ 0.71
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MIS18AQ9NYP9 233 aa19.51■□□□□ 0.71
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ZNF827Q17R98 1081 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SLC4A9Q96Q91 983 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TRIM35Q9UPQ4 493 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXA-AS2-211ENST00000593438 LINC00116Q8NCU8 138 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
HOXA-AS2-211ENST00000593438 KCNQ3O43525 872 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXA-AS2-211ENST00000593438 AKT1S1Q96B36 256 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
HOXA-AS2-211ENST00000593438 AK7Q96M32 723 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXA-AS2-211ENST00000593438 FMNL2Q96PY5 1086 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXA-AS2-211ENST00000593438 C5P01031 1676 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
HOXA-AS2-211ENST00000593438 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PAPPAQ13219 1627 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXA-AS2-211ENST00000593438 DNAJC10Q8IXB1 793 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TAF1LQ8IZX4 1826 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 KCPQ6ZWJ8 1503 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 VSIG10Q8N0Z9 540 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TSPYL4Q9UJ04 414 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 C4BP0C0L5 1744 aa19.43■□□□□ 0.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 GNPATO15228 680 aa19.43■□□□□ 0.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MSH5O43196 834 aa19.43■□□□□ 0.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 HEG1Q9ULI3 1381 aa19.43■□□□□ 0.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PHF14O94880 888 aa19.42■□□□□ 0.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 STARD3NLO95772 234 aa19.41■□□□□ 0.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CRKLP46109 303 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP19.41■□□□□ 0.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 UBR2Q8IWV8 1755 aa19.41■□□□□ 0.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ZNF831Q5JPB2 1677 aa19.4■□□□□ 0.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SMIM5Q71RC9 77 aa19.4■□□□□ 0.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 BABAM1Q9NWV8 329 aa19.4■□□□□ 0.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa19.4■□□□□ 0.7
HOXA-AS2-211ENST00000593438 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CCDC27Q2M243 656 aa19.39■□□□□ 0.69
HOXA-AS2-211ENST00000593438 WWC1Q8IX03 1113 aa19.39■□□□□ 0.69
HOXA-AS2-211ENST00000593438 FLAD1Q8NFF5 587 aa19.39■□□□□ 0.69
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa19.39■□□□□ 0.69
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TJP1Q07157 1748 aa19.39■□□□□ 0.69
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CHL1O00533 1208 aa19.38■□□□□ 0.69
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ZBTB7AO95365 584 aa19.38■□□□□ 0.69
HOXA-AS2-211ENST00000593438 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CFAP44Q96MT7 982 aa19.38■□□□□ 0.69
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CCDC87Q9NVE4 849 aa19.38■□□□□ 0.69
HOXA-AS2-211ENST00000593438 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa19.37■□□□□ 0.69
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RPS6KA4O75676 772 aa19.37■□□□□ 0.69
HOXA-AS2-211ENST00000593438 GNAI1P63096 354 aa19.37■□□□□ 0.69
HOXA-AS2-211ENST00000593438 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
HOXA-AS2-211ENST00000593438 AMIGO3Q86WK7 504 aa19.37■□□□□ 0.69
HOXA-AS2-211ENST00000593438 USP16Q9Y5T5 823 aa19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms