RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		11.9	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		11.9	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	POTEA	Q6S8J7	498 aa		11.9	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		11.89	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	CABP4	P57796	275 aa		11.89	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		11.89	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	RXRB	P28702	533 aa		11.89	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	BTBD11	A6QL63	1104 aa		11.88	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM182B	Q5T319	152 aa		11.88	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRC1	P22897	1456 aa		11.87	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		11.87	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		11.87	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNQ3	O43525	872 aa		11.87	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRT24	Q2M2I5	525 aa		11.87	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC39A6	Q13433	755 aa		11.86	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		11.86	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		11.86	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	TSPYL6	Q8N831	410 aa		11.85	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		11.85	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	PIGB	Q92521	554 aa		11.85	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF790	Q6PG37	636 aa		11.85	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		11.84	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNQ2	O43526	872 aa		11.84	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		11.84	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		11.84	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	BCL9	O00512	1426 aa		11.83	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	RGS12	O14924	1447 aa		11.83	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		11.83	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		11.83	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		11.83	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		11.83	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	ITGB4	P16144	1822 aa		11.83	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	VAMP4	O75379	141 aa		11.82	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		11.82	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATG3	Q9NT62	314 aa		11.81	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		11.81	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		11.8	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		11.8	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		11.8	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	11.8	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		11.8	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	BCAR3	O75815	825 aa		11.79	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		11.79	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	NECTIN2	Q92692	538 aa		11.78	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	PAPPA	Q13219	1627 aa		11.78	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		11.78	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF428	Q96B54	188 aa		11.78	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		11.78	□□□□□ -0.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	HOXB7	P09629	217 aa		11.77	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		11.77	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		11.77	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	SBF2	Q86WG5	1849 aa		11.77	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	NHS	Q6T4R5	1651 aa		11.76	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRIM37	O94972	964 aa		11.76	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		11.76	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		11.76	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	USP16	Q9Y5T5	823 aa		11.76	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	PALLD	Q8WX93	1383 aa		11.76	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		11.76	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLIN1	O60240	522 aa		11.75	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	BTAF1	O14981	1849 aa		11.75	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		11.74	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		11.74	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC4A2	P04920	1241 aa		11.74	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	SIK1	P57059	783 aa		11.74	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		11.74	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	STK31	Q9BXU1	1019 aa		11.74	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	C5	P01031	1676 aa		11.74	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		11.74	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		11.74	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		11.73	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANXA1	P04083	346 aa		11.73	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP6V1A	P38606	617 aa		11.73	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	PROSER3	Q2NL68	480 aa		11.72	□□□□□ -0.53
EFTUD2-223	ENST00000592576	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms