RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589585.1

CTIF-207, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-207ENST00000589585 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CTIF-207ENST00000589585 PTGER2P43116 358 aa18.3■□□□□ 0.52
CTIF-207ENST00000589585 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CTIF-207ENST00000589585 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CTIF-207ENST00000589585 LY75O60449 1722 aa18.29■□□□□ 0.52
CTIF-207ENST00000589585 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CTIF-207ENST00000589585 DCAF8L1A6NGE4 600 aa18.29■□□□□ 0.52
CTIF-207ENST00000589585 ATP6V1AP38606 617 aa18.29■□□□□ 0.52
CTIF-207ENST00000589585 GNAT3A8MTJ3 354 aa18.28■□□□□ 0.52
CTIF-207ENST00000589585 SLC52A2Q9HAB3 445 aa18.28■□□□□ 0.52
CTIF-207ENST00000589585 QSER1Q2KHR3 1735 aa18.28■□□□□ 0.52
CTIF-207ENST00000589585 MSH5O43196 834 aa18.27■□□□□ 0.52
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CTIF-207ENST00000589585 AK7Q96M32 723 aa18.27■□□□□ 0.52
CTIF-207ENST00000589585 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa18.27■□□□□ 0.52
CTIF-207ENST00000589585 MAP3K5Q99683 1374 aa18.27■□□□□ 0.51
CTIF-207ENST00000589585 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa18.26■□□□□ 0.51
CTIF-207ENST00000589585 ITPK1Q13572 414 aa18.26■□□□□ 0.51
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CTIF-207ENST00000589585 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
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CTIF-207ENST00000589585 TEFQ10587 303 aa18.24■□□□□ 0.51
CTIF-207ENST00000589585 IL17REQ8NFR9 667 aa18.24■□□□□ 0.51
CTIF-207ENST00000589585 SLC4A9Q96Q91 983 aa18.24■□□□□ 0.51
CTIF-207ENST00000589585 SLC39A6Q13433 755 aa18.23■□□□□ 0.51
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CTIF-207ENST00000589585 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CTIF-207ENST00000589585 COL24A1Q17RW2 1714 aa18.22■□□□□ 0.51
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CTIF-207ENST00000589585 SMIM5Q71RC9 77 aa18.21■□□□□ 0.51
CTIF-207ENST00000589585 SLC16A10Q8TF71 515 aa18.21■□□□□ 0.51
CTIF-207ENST00000589585 C5P01031 1676 aa18.21■□□□□ 0.51
CTIF-207ENST00000589585 CHD4Q14839 1912 aa18.21■□□□□ 0.51
CTIF-207ENST00000589585 UTRNP46939 3433 aa18.21■□□□□ 0.51
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CTIF-207ENST00000589585 FLAD1Q8NFF5 587 aa18.2■□□□□ 0.5
CTIF-207ENST00000589585 PLEKHF1Q96S99 279 aa18.2■□□□□ 0.5
CTIF-207ENST00000589585 SYT17Q9BSW7 474 aa18.2■□□□□ 0.5
CTIF-207ENST00000589585 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa18.2■□□□□ 0.5
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CTIF-207ENST00000589585 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP18.19■□□□□ 0.5
CTIF-207ENST00000589585 AMIGO3Q86WK7 504 aa18.19■□□□□ 0.5
CTIF-207ENST00000589585 TTC5Q8N0Z6 440 aa18.19■□□□□ 0.5
CTIF-207ENST00000589585 MRC1P22897 1456 aa18.19■□□□□ 0.5
CTIF-207ENST00000589585 C4BP0C0L5 1744 aa18.18■□□□□ 0.5
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CTIF-207ENST00000589585 POLD1P28340 1107 aa18.17■□□□□ 0.5
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CTIF-207ENST00000589585 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa18.15■□□□□ 0.5
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CTIF-207ENST00000589585 TRAPPC3LQ5T215 181 aa18.14■□□□□ 0.49
CTIF-207ENST00000589585 RPS6KA4O75676 772 aa18.13■□□□□ 0.49
CTIF-207ENST00000589585 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
CTIF-207ENST00000589585 ADAMTS8Q9UP79 889 aa18.13■□□□□ 0.49
CTIF-207ENST00000589585 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
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CTIF-207ENST00000589585 VSIG10Q8N0Z9 540 aa18.12■□□□□ 0.49
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CTIF-207ENST00000589585 FMNL2Q96PY5 1086 aa18.11■□□□□ 0.49
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CTIF-207ENST00000589585 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
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CTIF-207ENST00000589585 UBR3Q6ZT12 1888 aa18.09■□□□□ 0.49
CTIF-207ENST00000589585 STARD3NLO95772 234 aa18.09■□□□□ 0.49
CTIF-207ENST00000589585 ADRA2BP18089 450 aa18.09■□□□□ 0.49
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CTIF-207ENST00000589585 NEUROD2Q15784 382 aa18.09■□□□□ 0.49
CTIF-207ENST00000589585 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CTIF-207ENST00000589585 HEG1Q9ULI3 1381 aa18.08■□□□□ 0.49
CTIF-207ENST00000589585 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
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