RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589497.5

GIPC1-210, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 853 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-210ENST00000589497 MTFR1LQ9H019 292 aa25.18■■□□□ 1.62
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GIPC1-210ENST00000589497 LRP5O75197 1615 aa25.18■■□□□ 1.62
GIPC1-210ENST00000589497 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.17■■□□□ 1.62
GIPC1-210ENST00000589497 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.16■■□□□ 1.62
GIPC1-210ENST00000589497 PAPPAQ13219 1627 aa25.15■■□□□ 1.62
GIPC1-210ENST00000589497 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.15■■□□□ 1.62
GIPC1-210ENST00000589497 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.15■■□□□ 1.62
GIPC1-210ENST00000589497 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.15■■□□□ 1.62
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GIPC1-210ENST00000589497 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
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GIPC1-210ENST00000589497 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.12■■□□□ 1.61
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GIPC1-210ENST00000589497 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.08■■□□□ 1.61
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GIPC1-210ENST00000589497 KCPQ6ZWJ8 1503 aa24.87■■□□□ 1.57
GIPC1-210ENST00000589497 ZPR1O75312 459 aa24.87■■□□□ 1.57
GIPC1-210ENST00000589497 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
GIPC1-210ENST00000589497 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
GIPC1-210ENST00000589497 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
GIPC1-210ENST00000589497 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.85■■□□□ 1.57
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