RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589469.5

PSME3-209, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene PSME3, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-209ENST00000589469 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa26.77■■□□□ 1.88
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PSME3-209ENST00000589469 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.76■■□□□ 1.87
PSME3-209ENST00000589469 MTFR1LQ9H019 292 aa26.76■■□□□ 1.87
PSME3-209ENST00000589469 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.76■■□□□ 1.87
PSME3-209ENST00000589469 MRC1P22897 1456 aa26.75■■□□□ 1.87
PSME3-209ENST00000589469 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
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PSME3-209ENST00000589469 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.74■■□□□ 1.87
PSME3-209ENST00000589469 AK7Q96M32 723 aa26.74■■□□□ 1.87
PSME3-209ENST00000589469 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
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PSME3-209ENST00000589469 LINC00116Q8NCU8 138 aa26.73■■□□□ 1.87
PSME3-209ENST00000589469 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
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PSME3-209ENST00000589469 SLC16A10Q8TF71 515 aa26.72■■□□□ 1.87
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PSME3-209ENST00000589469 PTGER2P43116 358 aa26.69■■□□□ 1.86
PSME3-209ENST00000589469 FLAD1Q8NFF5 587 aa26.69■■□□□ 1.86
PSME3-209ENST00000589469 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.69■■□□□ 1.86
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PSME3-209ENST00000589469 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
PSME3-209ENST00000589469 IL17REQ8NFR9 667 aa26.68■■□□□ 1.86
PSME3-209ENST00000589469 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
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PSME3-209ENST00000589469 SSFA2P28290 1259 aa26.64■■□□□ 1.86
PSME3-209ENST00000589469 SLC39A6Q13433 755 aa26.64■■□□□ 1.86
PSME3-209ENST00000589469 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
PSME3-209ENST00000589469 SGIP1Q9BQI5 828 aa26.64■■□□□ 1.86
PSME3-209ENST00000589469 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.63■■□□□ 1.85
PSME3-209ENST00000589469 PHF14O94880 888 aa26.63■■□□□ 1.85
PSME3-209ENST00000589469 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
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PSME3-209ENST00000589469 AMIGO3Q86WK7 504 aa26.61■■□□□ 1.85
PSME3-209ENST00000589469 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.61■■□□□ 1.85
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PSME3-209ENST00000589469 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.6■■□□□ 1.85
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PSME3-209ENST00000589469 ARXQ96QS3 562 aa26.59■■□□□ 1.85
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PSME3-209ENST00000589469 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
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PSME3-209ENST00000589469 ZNF790Q6PG37 636 aa26.56■■□□□ 1.84
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PSME3-209ENST00000589469 TJP1Q07157 1748 aa26.55■■□□□ 1.84
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PSME3-209ENST00000589469 RPS6KA4O75676 772 aa26.54■■□□□ 1.84
PSME3-209ENST00000589469 ADRA2BP18089 450 aa26.54■■□□□ 1.84
PSME3-209ENST00000589469 DCTN1Q14203 1278 aa26.54■■□□□ 1.84
PSME3-209ENST00000589469 TRAPPC3LQ5T215 181 aa26.54■■□□□ 1.84
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PSME3-209ENST00000589469 COL24A1Q17RW2 1714 aa26.52■■□□□ 1.84
PSME3-209ENST00000589469 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
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PSME3-209ENST00000589469 YY1P25490 414 aa26.47■■□□□ 1.83
PSME3-209ENST00000589469 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
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PSME3-209ENST00000589469 STARD3NLO95772 234 aa26.46■■□□□ 1.83
PSME3-209ENST00000589469 KLHL34Q8N239 644 aa26.46■■□□□ 1.83
PSME3-209ENST00000589469 RUNDC1Q96C34 613 aa26.46■■□□□ 1.83
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PSME3-209ENST00000589469 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
PSME3-209ENST00000589469 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.44■■□□□ 1.82
PSME3-209ENST00000589469 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
PSME3-209ENST00000589469 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.43■■□□□ 1.82
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