RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 TPCN2Q8NHX9 752 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRM-208ENST00000578600 OSBPL3Q9H4L5 887 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRM-208ENST00000578600 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRM-208ENST00000578600 SFI1A8K8P3 1242 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRM-208ENST00000578600 LILRA1O75019 489 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRM-208ENST00000578600 SSFA2P28290 1259 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRM-208ENST00000578600 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC116Q8IYX3 515 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRM-208ENST00000578600 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRM-208ENST00000578600 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRM-208ENST00000578600 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRM-208ENST00000578600 M0R2N6 131 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRM-208ENST00000578600 PSME1Q06323 249 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRM-208ENST00000578600 CYLDQ9NQC7 956 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRM-208ENST00000578600 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRM-208ENST00000578600 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM229AB2RXF0 380 aa9□□□□□ -0.97
PTPRM-208ENST00000578600 MYT1Q01538 1121 aa9□□□□□ -0.97
PTPRM-208ENST00000578600 TRIM52Q96A61 297 aa9□□□□□ -0.97
PTPRM-208ENST00000578600 PRKD2Q9BZL6 878 aa9□□□□□ -0.97
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PTPRM-208ENST00000578600 ATP2B4P23634 1241 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRM-208ENST00000578600 ADD1P35611 737 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRM-208ENST00000578600 SCNN1DP51172 638 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRM-208ENST00000578600 OCLNQ16625 522 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRM-208ENST00000578600 TXNDC2Q86VQ3 553 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRM-208ENST00000578600 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF358Q9NW07 568 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRM-208ENST00000578600 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRM-208ENST00000578600 GDF9O60383 454 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRM-208ENST00000578600 ALDH1A1P00352 501 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRM-208ENST00000578600 FOXC1Q12948 553 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRM-208ENST00000578600 C1orf216Q8TAB5 229 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRM-208ENST00000578600 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRM-208ENST00000578600 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRM-208ENST00000578600 FGD5Q6ZNL6 1462 aa8.97□□□□□ -0.97
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PTPRM-208ENST00000578600 GNRH1P01148 92 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRM-208ENST00000578600 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPRM-208ENST00000578600 WEE1P30291 646 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRM-208ENST00000578600 GDF10P55107 478 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRM-208ENST00000578600 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.95□□□□□ -0.98
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PTPRM-208ENST00000578600 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.93□□□□□ -0.98
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PTPRM-208ENST00000578600 BACH1O14867 736 aa8.92□□□□□ -0.98
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PTPRM-208ENST00000578600 Q6ZVU0 165 aa8.92□□□□□ -0.98
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PTPRM-208ENST00000578600 ADH1AP07327 375 aa8.91□□□□□ -0.98
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PTPRM-208ENST00000578600 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
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PTPRM-208ENST00000578600 IGFBP4P22692 258 aa8.89□□□□□ -0.99
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