RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578446.1

USP22-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, human

TSL 3

Gene USP22, Length 605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP22-208	ENST00000578446	GNAI1	P63096	354 aa		13.9	□□□□□ -0.18
USP22-208	ENST00000578446	GOLGA2	Q08379	1002 aa		13.9	□□□□□ -0.18
USP22-208	ENST00000578446	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
USP22-208	ENST00000578446	PIGB	Q92521	554 aa		13.9	□□□□□ -0.18
USP22-208	ENST00000578446	IFT57	Q9NWB7	429 aa		13.9	□□□□□ -0.18
USP22-208	ENST00000578446	NHS	Q6T4R5	1651 aa		13.9	□□□□□ -0.18
USP22-208	ENST00000578446	EP400	Q96L91	3159 aa		13.9	□□□□□ -0.18
USP22-208	ENST00000578446	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
USP22-208	ENST00000578446	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		13.89	□□□□□ -0.19
USP22-208	ENST00000578446	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		13.88	□□□□□ -0.19
USP22-208	ENST00000578446	CFAP44	Q96MT7	982 aa		13.88	□□□□□ -0.19
USP22-208	ENST00000578446	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		13.88	□□□□□ -0.19
USP22-208	ENST00000578446	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		13.88	□□□□□ -0.19
USP22-208	ENST00000578446		E9PSI1	815 aa		13.87	□□□□□ -0.19
USP22-208	ENST00000578446	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		13.87	□□□□□ -0.19
USP22-208	ENST00000578446	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		13.87	□□□□□ -0.19
USP22-208	ENST00000578446	CHL1	O00533	1208 aa		13.86	□□□□□ -0.19
USP22-208	ENST00000578446	SLC39A6	Q13433	755 aa		13.86	□□□□□ -0.19
USP22-208	ENST00000578446	ZNF790	Q6PG37	636 aa		13.86	□□□□□ -0.19
USP22-208	ENST00000578446	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
USP22-208	ENST00000578446	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
USP22-208	ENST00000578446	MBIP	Q9NS73	344 aa		13.86	□□□□□ -0.19
USP22-208	ENST00000578446	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		13.86	□□□□□ -0.19
USP22-208	ENST00000578446	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		13.86	□□□□□ -0.19
USP22-208	ENST00000578446	PALLD	Q8WX93	1383 aa		13.85	□□□□□ -0.19
USP22-208	ENST00000578446	ZNF853	P0CG23	659 aa		13.85	□□□□□ -0.19
USP22-208	ENST00000578446	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
USP22-208	ENST00000578446	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		13.85	□□□□□ -0.19
USP22-208	ENST00000578446	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
USP22-208	ENST00000578446	ATG3	Q9NT62	314 aa		13.85	□□□□□ -0.19
USP22-208	ENST00000578446	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
USP22-208	ENST00000578446	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
USP22-208	ENST00000578446	SLFN5	Q08AF3	891 aa		13.84	□□□□□ -0.19
USP22-208	ENST00000578446	ITGB4	P16144	1822 aa		13.83	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	PAPPA	Q13219	1627 aa		13.83	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	KCNQ3	O43525	872 aa		13.83	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	APBA3	O96018	575 aa		13.83	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		13.83	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	BTAF1	O14981	1849 aa		13.83	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	SBF2	Q86WG5	1849 aa		13.83	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		13.82	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	ILDR2	Q71H61	639 aa		13.82	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		13.81	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		13.8	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	SIK1	P57059	783 aa		13.8	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		13.8	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	CCDC125	Q86Z20	511 aa		13.8	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		13.8	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	BAG6	P46379	1132 aa		13.79	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	KRT24	Q2M2I5	525 aa		13.79	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	ATP6V1A	P38606	617 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP22-208	ENST00000578446	PLSCR1	O15162	318 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	HOXB7	P09629	217 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	KCNQ4	P56696	695 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	TXNRD1	Q16881	649 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	TSPYL6	Q8N831	410 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	STARD3NL	O95772	234 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	ITPK1	Q13572	414 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	NECTIN2	Q92692	538 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	LY75	O60449	1722 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	PROM2	Q8N271	834 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP22-208	ENST00000578446	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		13.72	□□□□□ -0.21

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