RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PXDNQ92626 1479 aa30.12■■■□□ 2.41
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LMO7Q8WWI1 1683 aa30.11■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa30.11■■■□□ 2.41
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SIRT2Q8IXJ6 389 aa30.1■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C1orf141Q5JVX7 400 aa30.1■■■□□ 2.41
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BRINP3Q76B58 766 aa30.08■■■□□ 2.41
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC4A10Q6U841 1118 aa30.07■■■□□ 2.4
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LNPKQ9C0E8 428 aa30.07■■■□□ 2.4
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NLRP2Q9NX02 1062 aa30.06■■■□□ 2.4
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GCC1Q96CN9 775 aa30.06■■■□□ 2.4
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C22orf23Q9BZE7 217 aa30.06■■■□□ 2.4
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHD1LQ86WJ1 897 aa30.05■■■□□ 2.4
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa30.03■■■□□ 2.4
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANKRD45Q5TZF3 282 aa30.03■■■□□ 2.4
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BTBD11A6QL63 1104 aa30.02■■■□□ 2.4
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KDM3BQ7LBC6 1761 aa30.02■■■□□ 2.4
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COL18A1P39060 1754 aa30.01■■■□□ 2.39
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANKRD44Q8N8A2 993 aa29.96■■■□□ 2.39
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CEP85Q6P2H3 762 aa29.96■■■□□ 2.39
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa29.95■■■□□ 2.38
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TATP17735 454 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHMP4AQ9BY43 222 aa29.84■■■□□ 2.37
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PI4KAP2A4QPH2 592 aa29.77■■■□□ 2.36
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WDR17Q8IZU2 1322 aa29.77■■■□□ 2.36
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa29.76■■■□□ 2.36
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