RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576589.1

NOMO3-217, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 5

Gene NOMO3, Length 683 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-217ENST00000576589 LGR6Q9HBX8 967 aa37.63■■■■□ 3.61
NOMO3-217ENST00000576589 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP37.62■■■■□ 3.61
NOMO3-217ENST00000576589 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa37.62■■■■□ 3.61
NOMO3-217ENST00000576589 PHACTR3Q96KR7 559 aa37.62■■■■□ 3.61
NOMO3-217ENST00000576589 SYT17Q9BSW7 474 aa37.62■■■■□ 3.61
NOMO3-217ENST00000576589 RNMTO43148 476 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
NOMO3-217ENST00000576589 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa37.6■■■■□ 3.61
NOMO3-217ENST00000576589 SIK1P57059 783 aa37.6■■■■□ 3.61
NOMO3-217ENST00000576589 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
NOMO3-217ENST00000576589 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP37.58■■■■□ 3.61
NOMO3-217ENST00000576589 ARXQ96QS3 562 aa37.57■■■■□ 3.6
NOMO3-217ENST00000576589 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa37.57■■■■□ 3.6
NOMO3-217ENST00000576589 SLC52A2Q9HAB3 445 aa37.56■■■■□ 3.6
NOMO3-217ENST00000576589 GNAT3A8MTJ3 354 aa37.55■■■■□ 3.6
NOMO3-217ENST00000576589 MAP3K5Q99683 1374 aa37.55■■■■□ 3.6
NOMO3-217ENST00000576589 ATP6V1AP38606 617 aa37.53■■■■□ 3.6
NOMO3-217ENST00000576589 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP37.52■■■■□ 3.6
NOMO3-217ENST00000576589 ITPK1Q13572 414 aa37.49■■■■□ 3.59
NOMO3-217ENST00000576589 SLC16A10Q8TF71 515 aa37.49■■■■□ 3.59
NOMO3-217ENST00000576589 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa37.48■■■■□ 3.59
NOMO3-217ENST00000576589 NEFMP07197 916 aa37.48■■■■□ 3.59
NOMO3-217ENST00000576589 IL17REQ8NFR9 667 aa37.48■■■■□ 3.59
NOMO3-217ENST00000576589 SCN11AQ9UI33 1791 aa37.47■■■■□ 3.59
NOMO3-217ENST00000576589 LINC00116Q8NCU8 138 aa37.47■■■■□ 3.59
NOMO3-217ENST00000576589 SLC4A9Q96Q91 983 aa37.47■■■■□ 3.59
NOMO3-217ENST00000576589 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP37.46■■■■□ 3.59
NOMO3-217ENST00000576589 MRC1P22897 1456 aa37.45■■■■□ 3.59
NOMO3-217ENST00000576589 AK7Q96M32 723 aa37.45■■■■□ 3.59
NOMO3-217ENST00000576589 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP37.44■■■■□ 3.58
NOMO3-217ENST00000576589 TEFQ10587 303 aa37.43■■■■□ 3.58
NOMO3-217ENST00000576589 PLEKHF1Q96S99 279 aa37.43■■■■□ 3.58
NOMO3-217ENST00000576589 C5P01031 1676 aa37.43■■■■□ 3.58
NOMO3-217ENST00000576589 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa37.42■■■■□ 3.58
NOMO3-217ENST00000576589 SLC39A6Q13433 755 aa37.42■■■■□ 3.58
NOMO3-217ENST00000576589 POLD1P28340 1107 aa37.4■■■■□ 3.58
NOMO3-217ENST00000576589 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP37.4■■■■□ 3.58
NOMO3-217ENST00000576589 QSER1Q2KHR3 1735 aa37.39■■■■□ 3.58
NOMO3-217ENST00000576589 MSH5O43196 834 aa37.39■■■■□ 3.58
NOMO3-217ENST00000576589 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
NOMO3-217ENST00000576589 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa37.38■■■■□ 3.57
NOMO3-217ENST00000576589 C4BP0C0L5 1744 aa37.38■■■■□ 3.57
NOMO3-217ENST00000576589 FLAD1Q8NFF5 587 aa37.37■■■■□ 3.57
NOMO3-217ENST00000576589 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa37.36■■■■□ 3.57
NOMO3-217ENST00000576589 TAF1LQ8IZX4 1826 aa37.36■■■■□ 3.57
NOMO3-217ENST00000576589 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
NOMO3-217ENST00000576589 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP37.35■■■■□ 3.57
NOMO3-217ENST00000576589 MCM10Q7L590 875 aa37.35■■■■□ 3.57
NOMO3-217ENST00000576589 GNPATO15228 680 aa37.34■■■■□ 3.57
NOMO3-217ENST00000576589 AMIGO3Q86WK7 504 aa37.34■■■■□ 3.57
NOMO3-217ENST00000576589 PHF14O94880 888 aa37.33■■■■□ 3.57
NOMO3-217ENST00000576589 KLHL34Q8N239 644 aa37.33■■■■□ 3.57
NOMO3-217ENST00000576589 DCTN1Q14203 1278 aa37.32■■■■□ 3.56
NOMO3-217ENST00000576589 NFE2L2Q16236 605 aa37.32■■■■□ 3.56
NOMO3-217ENST00000576589 SMIM5Q71RC9 77 aa37.32■■■■□ 3.56
NOMO3-217ENST00000576589 TTC5Q8N0Z6 440 aa37.32■■■■□ 3.56
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP37.32■■■■□ 3.56
NOMO3-217ENST00000576589 UTRNP46939 3433 aa37.32■■■■□ 3.56
NOMO3-217ENST00000576589 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
NOMO3-217ENST00000576589 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
NOMO3-217ENST00000576589 SSFA2P28290 1259 aa37.3■■■■□ 3.56
NOMO3-217ENST00000576589 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa37.3■■■■□ 3.56
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF831Q5JPB2 1677 aa37.29■■■■□ 3.56
NOMO3-217ENST00000576589 GPR162Q16538 588 aa37.29■■■■□ 3.56
NOMO3-217ENST00000576589 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa37.29■■■■□ 3.56
NOMO3-217ENST00000576589 COL24A1Q17RW2 1714 aa37.28■■■■□ 3.56
NOMO3-217ENST00000576589 ANP32CO43423 234 aa37.28■■■■□ 3.56
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF790Q6PG37 636 aa37.28■■■■□ 3.56
NOMO3-217ENST00000576589 BTBD11A6QL63 1104 aa37.27■■■■□ 3.56
NOMO3-217ENST00000576589 DNAJC10Q8IXB1 793 aa37.27■■■■□ 3.56
NOMO3-217ENST00000576589 ADAMTS8Q9UP79 889 aa37.27■■■■□ 3.56
NOMO3-217ENST00000576589 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP37.27■■■■□ 3.56
NOMO3-217ENST00000576589 KCPQ6ZWJ8 1503 aa37.26■■■■□ 3.55
NOMO3-217ENST00000576589 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
NOMO3-217ENST00000576589 CRKLP46109 303 aaKnown RBP37.24■■■■□ 3.55
NOMO3-217ENST00000576589 CCDC146Q8IYE0 955 aa37.24■■■■□ 3.55
NOMO3-217ENST00000576589 VSIG10Q8N0Z9 540 aa37.23■■■■□ 3.55
NOMO3-217ENST00000576589 RPS6KA4O75676 772 aa37.22■■■■□ 3.55
NOMO3-217ENST00000576589 MSL1Q68DK7 614 aa37.22■■■■□ 3.55
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
NOMO3-217ENST00000576589 TRAPPC3LQ5T215 181 aa37.21■■■■□ 3.55
NOMO3-217ENST00000576589 KCNQ3O43525 872 aa37.2■■■■□ 3.55
NOMO3-217ENST00000576589 NLGN2Q8NFZ4 835 aa37.2■■■■□ 3.55
NOMO3-217ENST00000576589 RUNDC1Q96C34 613 aa37.2■■■■□ 3.55
NOMO3-217ENST00000576589 RIPK4P57078 832 aa37.19■■■■□ 3.54
NOMO3-217ENST00000576589 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
NOMO3-217ENST00000576589 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP37.19■■■■□ 3.54
NOMO3-217ENST00000576589 UBR3Q6ZT12 1888 aa37.18■■■■□ 3.54
NOMO3-217ENST00000576589 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP37.18■■■■□ 3.54
NOMO3-217ENST00000576589 TMPOP42166 694 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
NOMO3-217ENST00000576589 FMNL2Q96PY5 1086 aa37.18■■■■□ 3.54
NOMO3-217ENST00000576589 CHD4Q14839 1912 aa37.18■■■■□ 3.54
NOMO3-217ENST00000576589 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
NOMO3-217ENST00000576589 ADRA2BP18089 450 aa37.17■■■■□ 3.54
NOMO3-217ENST00000576589 CCDC184Q52MB2 194 aa37.17■■■■□ 3.54
NOMO3-217ENST00000576589 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
NOMO3-217ENST00000576589 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
NOMO3-217ENST00000576589 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
NOMO3-217ENST00000576589 HEG1Q9ULI3 1381 aa37.17■■■■□ 3.54
NOMO3-217ENST00000576589 TJP1Q07157 1748 aa37.16■■■■□ 3.54
NOMO3-217ENST00000576589 CCDC87Q9NVE4 849 aa37.16■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms