RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570569.1

TMEM256-PLSCR3-201, Transcript of TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 3

Gene TMEM256-PLSCR3, Length 562 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
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TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
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TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.58■■□□□ 1.21
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.58■■□□□ 1.2
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.57■■□□□ 1.2
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.57■■□□□ 1.2
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 DCTN1Q14203 1278 aa22.56■■□□□ 1.2
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
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