RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567820.1

LMF1-AS1-201, LMF1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene LMF1-AS1, Length 1,064 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF1-AS1-201ENST00000567820 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.4■■□□□ 1.18
LMF1-AS1-201ENST00000567820 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
LMF1-AS1-201ENST00000567820 APBA3O96018 575 aa22.39■■□□□ 1.17
LMF1-AS1-201ENST00000567820 NEUROD2Q15784 382 aa22.39■■□□□ 1.17
LMF1-AS1-201ENST00000567820 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.39■■□□□ 1.17
LMF1-AS1-201ENST00000567820 PLSCR1O15162 318 aa22.38■■□□□ 1.17
LMF1-AS1-201ENST00000567820 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
LMF1-AS1-201ENST00000567820 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.37■■□□□ 1.17
LMF1-AS1-201ENST00000567820 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
LMF1-AS1-201ENST00000567820 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.37■■□□□ 1.17
LMF1-AS1-201ENST00000567820 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.36■■□□□ 1.17
LMF1-AS1-201ENST00000567820 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
LMF1-AS1-201ENST00000567820 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.36■■□□□ 1.17
LMF1-AS1-201ENST00000567820 ATG3Q9NT62 314 aa22.36■■□□□ 1.17
LMF1-AS1-201ENST00000567820 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.36■■□□□ 1.17
LMF1-AS1-201ENST00000567820 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.36■■□□□ 1.17
LMF1-AS1-201ENST00000567820 BAG6P46379 1132 aa22.35■■□□□ 1.17
LMF1-AS1-201ENST00000567820 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
LMF1-AS1-201ENST00000567820 TEFQ10587 303 aa22.35■■□□□ 1.17
LMF1-AS1-201ENST00000567820 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.35■■□□□ 1.17
LMF1-AS1-201ENST00000567820 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.34■■□□□ 1.17
LMF1-AS1-201ENST00000567820 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.34■■□□□ 1.17
LMF1-AS1-201ENST00000567820 CCDC27Q2M243 656 aa22.34■■□□□ 1.17
LMF1-AS1-201ENST00000567820 PALLDQ8WX93 1383 aa22.34■■□□□ 1.17
LMF1-AS1-201ENST00000567820 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.33■■□□□ 1.17
LMF1-AS1-201ENST00000567820 PROM2Q8N271 834 aa22.33■■□□□ 1.17
LMF1-AS1-201ENST00000567820 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.33■■□□□ 1.16
LMF1-AS1-201ENST00000567820 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
LMF1-AS1-201ENST00000567820 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
LMF1-AS1-201ENST00000567820 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
LMF1-AS1-201ENST00000567820 SLC39A6Q13433 755 aa22.3■■□□□ 1.16
LMF1-AS1-201ENST00000567820 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
LMF1-AS1-201ENST00000567820 TJP1Q07157 1748 aa22.29■■□□□ 1.16
LMF1-AS1-201ENST00000567820 WWC1Q8IX03 1113 aa22.29■■□□□ 1.16
LMF1-AS1-201ENST00000567820 C5P01031 1676 aa22.29■■□□□ 1.16
LMF1-AS1-201ENST00000567820 BTBD11A6QL63 1104 aa22.28■■□□□ 1.16
LMF1-AS1-201ENST00000567820 TXNRD1Q16881 649 aa22.28■■□□□ 1.16
LMF1-AS1-201ENST00000567820 NGEFQ8N5V2 710 aa22.28■■□□□ 1.16
LMF1-AS1-201ENST00000567820 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
LMF1-AS1-201ENST00000567820 ZNF790Q6PG37 636 aa22.27■■□□□ 1.16
LMF1-AS1-201ENST00000567820 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.27■■□□□ 1.16
LMF1-AS1-201ENST00000567820 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.27■■□□□ 1.16
LMF1-AS1-201ENST00000567820 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.26■■□□□ 1.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 KCNQ3O43525 872 aa22.26■■□□□ 1.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 SIK1P57059 783 aa22.26■■□□□ 1.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.26■■□□□ 1.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 ZNF521Q96K83 1311 aa22.26■■□□□ 1.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 ZNF853P0CG23 659 aa22.25■■□□□ 1.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.25■■□□□ 1.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.25■■□□□ 1.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 CHL1O00533 1208 aa22.24■■□□□ 1.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 KCNQ4P56696 695 aa22.24■■□□□ 1.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 CFAP44Q96MT7 982 aa22.22■■□□□ 1.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 C4BP0C0L5 1744 aa22.21■■□□□ 1.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 ITPK1Q13572 414 aa22.21■■□□□ 1.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 WDR63Q8IWG1 891 aa22.21■■□□□ 1.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.21■■□□□ 1.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 IFT57Q9NWB7 429 aa22.21■■□□□ 1.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 IL16Q14005 1332 aa22.21■■□□□ 1.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.21■■□□□ 1.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
LMF1-AS1-201ENST00000567820 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.2■■□□□ 1.14
LMF1-AS1-201ENST00000567820 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.2■■□□□ 1.14
LMF1-AS1-201ENST00000567820 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.2■■□□□ 1.14
LMF1-AS1-201ENST00000567820 ATP6V1AP38606 617 aa22.19■■□□□ 1.14
LMF1-AS1-201ENST00000567820 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.19■■□□□ 1.14
LMF1-AS1-201ENST00000567820 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
LMF1-AS1-201ENST00000567820 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.18■■□□□ 1.14
LMF1-AS1-201ENST00000567820 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.18■■□□□ 1.14
LMF1-AS1-201ENST00000567820 MBIPQ9NS73 344 aa22.18■■□□□ 1.14
LMF1-AS1-201ENST00000567820 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.17■■□□□ 1.14
LMF1-AS1-201ENST00000567820 GNAI1P63096 354 aa22.17■■□□□ 1.14
LMF1-AS1-201ENST00000567820 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
LMF1-AS1-201ENST00000567820 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
LMF1-AS1-201ENST00000567820 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.17■■□□□ 1.14
LMF1-AS1-201ENST00000567820 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
LMF1-AS1-201ENST00000567820 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.15■■□□□ 1.14
LMF1-AS1-201ENST00000567820 AKT1S1Q96B36 256 aa22.15■■□□□ 1.14
LMF1-AS1-201ENST00000567820 LRP5O75197 1615 aa22.15■■□□□ 1.14
LMF1-AS1-201ENST00000567820 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.14■■□□□ 1.13
LMF1-AS1-201ENST00000567820 ZNF827Q17R98 1081 aa22.14■■□□□ 1.13
LMF1-AS1-201ENST00000567820 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
LMF1-AS1-201ENST00000567820 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
LMF1-AS1-201ENST00000567820 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
LMF1-AS1-201ENST00000567820 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
LMF1-AS1-201ENST00000567820 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
LMF1-AS1-201ENST00000567820 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
LMF1-AS1-201ENST00000567820 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.11■■□□□ 1.13
LMF1-AS1-201ENST00000567820 KRT24Q2M2I5 525 aa22.11■■□□□ 1.13
LMF1-AS1-201ENST00000567820 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.1■■□□□ 1.13
LMF1-AS1-201ENST00000567820 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LMF1-AS1-201ENST00000567820 GOLGA2Q08379 1002 aa22.1■■□□□ 1.13
LMF1-AS1-201ENST00000567820 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LMF1-AS1-201ENST00000567820 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms