RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561405.1

UBE2CP4-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP4, Length 535 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP4-201ENST00000561405 AMOTQ4VCS5 1084 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 AEBP1Q8IUX7 1158 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 SPON1Q9HCB6 807 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 CREBZFQ9NS37 354 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 SULT6B1Q6IMI4 303 aa10.05□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 PIGBQ92521 554 aa10.05□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 TAF1LQ8IZX4 1826 aa10.05□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa10.05□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 PALLDQ8WX93 1383 aa10.04□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 VASPP50552 380 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 CHADLQ6NUI6 762 aa10.04□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa10.04□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 COL24A1Q17RW2 1714 aa10.04□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 ERVV-2B6SEH9 535 aa10.03□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 PTGER2P43116 358 aa10.03□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 KCNQ4P56696 695 aa10.03□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 DCAF5Q96JK2 942 aa10.03□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 SGIP1Q9BQI5 828 aa10.03□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa10.03□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 C5P01031 1676 aa10.02□□□□□ -0.8
UBE2CP4-201ENST00000561405 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC16A10Q8TF71 515 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 MTFR1LQ9H019 292 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMOD3Q9NYL9 352 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZBTB7AO95365 584 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 ASAP1Q9ULH1 1129 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF831Q5JPB2 1677 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 SCN11AQ9UI33 1791 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa10□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa10□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 PPP2R1AP30153 589 aa10□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 SIK1P57059 783 aa10□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 AKAP4Q5JQC9 854 aa10□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 ATG3Q9NT62 314 aa10□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 C4BP0C0L5 1744 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 HMOX1P09601 288 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 C1orf141Q5JVX7 400 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 UBR3Q6ZT12 1888 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 MRC1P22897 1456 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 MIER1Q8N108 512 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 FLAD1Q8NFF5 587 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 MAP3K5Q99683 1374 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 CABP4P57796 275 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 ITPK1Q13572 414 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 LINC00116Q8NCU8 138 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 CFAP53Q96M91 514 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC4A9Q96Q91 983 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
UBE2CP4-201ENST00000561405 RNMTO43148 476 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 AMIGO3Q86WK7 504 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 RSPH6AQ9H0K4 717 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 LGR6Q9HBX8 967 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 SSFA2P28290 1259 aa9.95□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 ATP6V1AP38606 617 aa9.95□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 PLCD3Q8N3E9 789 aa9.95□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 ARXQ96QS3 562 aa9.95□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC52A2Q9HAB3 445 aa9.95□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa9.94□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 FCHSD2O94868 740 aa9.94□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 GAS2L2Q8NHY3 880 aa9.94□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 AK7Q96M32 723 aa9.94□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 SYT17Q9BSW7 474 aa9.94□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 NUDCQ9Y266 331 aa9.94□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa9.93□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 POLD1P28340 1107 aa9.93□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 PRKAR2BP31323 418 aa9.93□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 PHACTR3Q96KR7 559 aa9.93□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 TJP1Q07157 1748 aa9.93□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 GNAT3A8MTJ3 354 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 RALBP1Q15311 655 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 IL17REQ8NFR9 667 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 UBR2Q8IWV8 1755 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2CP4-201ENST00000561405 KCPQ6ZWJ8 1503 aa9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms