RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560067.1

USP3-AS1-205, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 366 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-205ENST00000560067 MTFR1LQ9H019 292 aa16.52■□□□□ 0.24
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLC52A2Q9HAB3 445 aa16.52■□□□□ 0.24
USP3-AS1-205ENST00000560067 GNAT3A8MTJ3 354 aa16.51■□□□□ 0.23
USP3-AS1-205ENST00000560067 PHACTR3Q96KR7 559 aa16.51■□□□□ 0.23
USP3-AS1-205ENST00000560067 AK7Q96M32 723 aa16.51■□□□□ 0.23
USP3-AS1-205ENST00000560067 LRP5O75197 1615 aa16.51■□□□□ 0.23
USP3-AS1-205ENST00000560067 PAPPAQ13219 1627 aa16.51■□□□□ 0.23
USP3-AS1-205ENST00000560067 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa16.5■□□□□ 0.23
USP3-AS1-205ENST00000560067 NEFMP07197 916 aa16.5■□□□□ 0.23
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLC16A10Q8TF71 515 aa16.5■□□□□ 0.23
USP3-AS1-205ENST00000560067 LY75O60449 1722 aa16.5■□□□□ 0.23
USP3-AS1-205ENST00000560067 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-205ENST00000560067 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-205ENST00000560067 ITPK1Q13572 414 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-205ENST00000560067 LINC00116Q8NCU8 138 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-205ENST00000560067 FLAD1Q8NFF5 587 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-205ENST00000560067 MAP3K5Q99683 1374 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-205ENST00000560067 ITGB4P16144 1822 aa16.48■□□□□ 0.23
USP3-AS1-205ENST00000560067 TEFQ10587 303 aa16.47■□□□□ 0.23
USP3-AS1-205ENST00000560067 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
USP3-AS1-205ENST00000560067 IL17REQ8NFR9 667 aa16.47■□□□□ 0.23
USP3-AS1-205ENST00000560067 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
USP3-AS1-205ENST00000560067 PTGER2P43116 358 aa16.46■□□□□ 0.23
USP3-AS1-205ENST00000560067 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLC4A9Q96Q91 983 aa16.46■□□□□ 0.23
USP3-AS1-205ENST00000560067 GNPATO15228 680 aa16.45■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 PHF14O94880 888 aa16.45■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 CASZ1Q86V15 1759 aa16.45■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 POLD1P28340 1107 aa16.44■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLC39A6Q13433 755 aa16.44■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 SSFA2P28290 1259 aa16.43■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 TTC5Q8N0Z6 440 aa16.43■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 ARXQ96QS3 562 aa16.43■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 SGIP1Q9BQI5 828 aa16.43■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa16.43■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 PLEKHF1Q96S99 279 aa16.42■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 MRC1P22897 1456 aa16.42■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 SMIM5Q71RC9 77 aa16.41■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 AMIGO3Q86WK7 504 aa16.41■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa16.41■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 C5P01031 1676 aa16.4■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa16.4■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 C4BP0C0L5 1744 aa16.4■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP16.4■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRAPPC3LQ5T215 181 aa16.4■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 MSL1Q68DK7 614 aa16.4■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 MCM10Q7L590 875 aa16.4■□□□□ 0.22
USP3-AS1-205ENST00000560067 SCN11AQ9UI33 1791 aa16.39■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 BTBD11A6QL63 1104 aa16.39■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 RPS6KA4O75676 772 aa16.39■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 CRKLP46109 303 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 NFE2L2Q16236 605 aa16.39■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF790Q6PG37 636 aa16.39■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 DNAJC10Q8IXB1 793 aa16.39■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 VSIG10Q8N0Z9 540 aa16.39■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 ADRA2BP18089 450 aa16.38■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 DCTN1Q14203 1278 aa16.38■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 DCAF8L1A6NGE4 600 aa16.36■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 RFC4P35249 363 aa16.36■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 KLHL34Q8N239 644 aa16.36■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 FMNL2Q96PY5 1086 aa16.36■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 SYT17Q9BSW7 474 aa16.36■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCDC87Q9NVE4 849 aa16.36■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa16.36■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 QSER1Q2KHR3 1735 aa16.36■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 TAF1LQ8IZX4 1826 aa16.35■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 STARD3NLO95772 234 aa16.35■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 ANP32CO43423 234 aa16.34■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 KCNQ3O43525 872 aa16.34■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCDC146Q8IYE0 955 aa16.34■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 ADAMTS8Q9UP79 889 aa16.34■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF831Q5JPB2 1677 aa16.34■□□□□ 0.21
USP3-AS1-205ENST00000560067 RIPK4P57078 832 aa16.33■□□□□ 0.2
USP3-AS1-205ENST00000560067 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
USP3-AS1-205ENST00000560067 RUNDC1Q96C34 613 aa16.33■□□□□ 0.2
USP3-AS1-205ENST00000560067 HEG1Q9ULI3 1381 aa16.33■□□□□ 0.2
USP3-AS1-205ENST00000560067 KCPQ6ZWJ8 1503 aa16.33■□□□□ 0.2
USP3-AS1-205ENST00000560067 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa16.33■□□□□ 0.2
USP3-AS1-205ENST00000560067 LMOD3Q0VAK6 560 aa16.32■□□□□ 0.2
USP3-AS1-205ENST00000560067 NLGN1Q8N2Q7 840 aa16.32■□□□□ 0.2
USP3-AS1-205ENST00000560067 CANXP27824 592 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMPOP42166 694 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
USP3-AS1-205ENST00000560067 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
USP3-AS1-205ENST00000560067 MIS18AQ9NYP9 233 aa16.31■□□□□ 0.2
USP3-AS1-205ENST00000560067 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
USP3-AS1-205ENST00000560067 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
USP3-AS1-205ENST00000560067 NEUROD2Q15784 382 aa16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms