RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		10.52	□□□□□ -0.72
RBM23-233	ENST00000557667	CDC45	O75419	566 aa		10.52	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM94	Q12767	1356 aa		10.52	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		10.52	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		10.52	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	REC8	O95072	547 aa		10.51	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	HIP1	O00291	1037 aa		10.51	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	MCM2	P49736	904 aa		10.51	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		10.51	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	DCTPP1	Q9H773	170 aa		10.51	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		10.5	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	MRC1	P22897	1456 aa		10.5	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		10.5	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		10.5	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	DCAF5	Q96JK2	942 aa		10.5	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		10.49	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	COL15A1	P39059	1388 aa		10.49	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	HSCB	Q8IWL3	235 aa		10.49	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		10.49	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		10.49	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	ARID3A	Q99856	593 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	PXDN	Q92626	1479 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	SLC4A2	P04920	1241 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	RGS3	P49796	1198 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	SNX21	Q969T3	373 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	ERC2	O15083	957 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	C8orf34	Q49A92	452 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	BTBD11	A6QL63	1104 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	FLII	Q13045	1269 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM23-233	ENST00000557667	ATP8B2	P98198	1209 aa		10.46	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		10.46	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	ERBB3	P21860	1342 aa		10.46	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	LRP6	O75581	1613 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	IGHD	P01880	384 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	SOCS7	O14512	581 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	RABEP1	Q15276	862 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	RGL2	O15211	777 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	RLBP1	P12271	317 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	BCL11A	Q9H165	835 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	ANAPC15	P60006	121 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	NUTM2F	A1L443	756 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	MCM10	Q7L590	875 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	KSR2	Q6VAB6	950 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	MTX1	Q13505	466 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	ST18	O60284	1047 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	CEP85	Q6P2H3	762 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-233	ENST00000557667	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms