RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552253.1

PTPRB-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 2,373 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-211ENST00000552253 TSPYL4Q9UJ04 414 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 ZDHHC9Q9Y397 364 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 APBB1O00213 710 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 CCT4P50991 539 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 USP54Q70EL1 1684 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 ATP8B2P98198 1209 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 SLC4A10Q6U841 1118 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 IL17RAQ96F46 866 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 LMBRD1Q9NUN5 540 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 ERBB4Q15303 1308 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 HOXC9P31274 260 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 KLHL40Q2TBA0 621 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 STAP2Q9UGK3 403 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 ERC2O15083 957 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 HMMRO75330 724 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 GNAI2P04899 355 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 PTMSP20962 102 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 CLCN1P35523 988 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 FLIIQ13045 1269 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 USP44Q9H0E7 712 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 CACNA1FO60840 1977 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 AMPHP49418 695 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 TSHZ3Q63HK5 1081 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
PTPRB-211ENST00000552253 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 REC8O95072 547 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 NUCB2P80303 420 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 CCDC30Q5VVM6 783 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 UNC5CLQ8IV45 518 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 BABAM1Q9NWV8 329 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 ANKARQ7Z5J8 1434 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 CHMLP26374 656 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 NLRP6P59044 892 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 PPP1R9BQ96SB3 815 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 IL25Q9H293 177 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 PALD1Q9ULE6 856 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 EID1Q9Y6B2 187 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 MAP3K5Q99683 1374 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 GNAI3P08754 354 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 ZNF445P59923 1031 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 CUL4AQ13619 759 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 SSH3Q8TE77 659 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 LRRCC1Q9C099 1032 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 PXDNLA1KZ92 1463 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 KCNA6P17658 529 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 MX1P20591 662 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 POLA2Q14181 598 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 MCTP1Q6DN14 999 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 CASC1Q6TDU7 716 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 GPT2Q8TD30 523 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 NECTIN2Q92692 538 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 STK31Q9BXU1 1019 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 ESPNB1AK53 854 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 ST18O60284 1047 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 TMX3Q96JJ7 454 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 SPDYE4A6NLX3 237 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 NEK4P51957 841 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 AOX1Q06278 1338 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 BRD1O95696 1058 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 RBSNQ9H1K0 784 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 LGR6Q9HBX8 967 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 NFAT5O94916 1531 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 GOLGA6L22H0YM25 854 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 ANAPC15P60006 121 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 NBPF6Q5VWK0 638 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 PI4K2BQ8TCG2 481 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 NBPF4Q96M43 638 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-211ENST00000552253 KDM3BQ7LBC6 1761 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms