RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551887.2

ITGB7-211, Transcript of integrin subunit beta 7, humanhuman

TSL 4

Gene ITGB7, Length 760 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB7-211ENST00000551887 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 GSE1Q14687 1217 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 CABP2Q9NPB3 220 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 RAI14Q9P0K7 980 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 USP19O94966 1318 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 RINLQ6ZS11 566 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 MKL1Q969V6 931 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 TSPYL1Q9H0U9 437 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 CASZ1Q86V15 1759 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 CPDO75976 1380 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 TERF1P54274 439 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 NLRP6P59044 892 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 PTF1AQ7RTS3 328 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 CABP1Q9NZU7 370 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 MTMR7Q9Y216 660 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 ATP10DQ9P241 1426 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 ERCC3P19447 782 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 DDB1Q16531 1140 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 FAM161AQ3B820 660 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 TNS2Q63HR2 1409 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 PLSCR1O15162 318 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 KDM4AO75164 1064 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 ZBTB7AO95365 584 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 CLCN1P35523 988 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 DMTNQ08495 405 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 NBPF6Q5VWK0 638 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 PROM2Q8N271 834 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 WDR90Q96KV7 1748 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 NBPF4Q96M43 638 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 AXIN2Q9Y2T1 843 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 CRB1P82279 1406 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 SOX12O15370 315 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 PTGER2P43116 358 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 JMYQ8N9B5 988 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 NUB1Q9Y5A7 615 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 OVOS2Q6IE36 1432 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 FAM9BQ8IZU0 186 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 KLRG1Q96E93 195 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 MYH16Q9H6N6 1097 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGB7-211ENST00000551887 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 MYBPC2Q14324 1141 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 CCDC96Q2M329 555 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 WDR17Q8IZU2 1322 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 EXOC5O00471 708 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 SATB1Q01826 763 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 TXNRD1Q16881 649 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 ARHGEF25Q86VW2 580 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 TSPAN18Q96SJ8 248 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 STK32BQ9NY57 414 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 USP6P35125 1406 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa8.62□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa8.62□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 KCNH5Q8NCM2 988 aa8.62□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 LMO7Q8WWI1 1683 aa8.62□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 EVC2Q86UK5 1308 aa8.61□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 SLC15A2Q16348 729 aa8.61□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 MIER1Q8N108 512 aa8.61□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa8.61□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 MAP3K5Q99683 1374 aa8.61□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 PCNTO95613 3336 aa8.6□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 GRIN3BO60391 1043 aa8.6□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 LMOD3Q0VAK6 560 aa8.6□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 GORABQ5T7V8 394 aa8.6□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa8.6□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.6□□□□□ -1.03
ITGB7-211ENST00000551887 ACSBG1Q96GR2 724 aa8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms