RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 KDM2BQ8NHM5 1336 aa7.47□□□□□ -1.21
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PTPRB-210ENST00000551525 CCDC191Q8NCU4 936 aa7.47□□□□□ -1.21
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PTPRB-210ENST00000551525 TXLNBQ8N3L3 684 aa7.43□□□□□ -1.22
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PTPRB-210ENST00000551525 UIMC1Q96RL1 719 aa7.43□□□□□ -1.22
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PTPRB-210ENST00000551525 NOS1P29475 1434 aa7.43□□□□□ -1.22
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PTPRB-210ENST00000551525 BIRC2Q13490 618 aa7.43□□□□□ -1.22
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
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PTPRB-210ENST00000551525 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 FCHSD2O94868 740 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 CASQ1P31415 396 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 RFC4P35249 363 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 RNF20Q5VTR2 975 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 DRC7Q8IY82 874 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 WDR66Q8TBY9 1149 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-210ENST00000551525 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
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