RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543125.5

PGA3-207, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PGA3, Length 968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-207ENST00000543125 RNMTO43148 476 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PGA3-207ENST00000543125 NPM3O75607 178 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PGA3-207ENST00000543125 SLC27A3Q5K4L6 730 aa12.06□□□□□ -0.48
PGA3-207ENST00000543125 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
PGA3-207ENST00000543125 PALLDQ8WX93 1383 aa12.05□□□□□ -0.48
PGA3-207ENST00000543125 MAP3K5Q99683 1374 aa12.05□□□□□ -0.48
PGA3-207ENST00000543125 GNAT3A8MTJ3 354 aa12.05□□□□□ -0.48
PGA3-207ENST00000543125 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP12.05□□□□□ -0.48
PGA3-207ENST00000543125 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PGA3-207ENST00000543125 LGR6Q9HBX8 967 aa12.05□□□□□ -0.48
PGA3-207ENST00000543125 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PGA3-207ENST00000543125 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PGA3-207ENST00000543125 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa12.04□□□□□ -0.48
PGA3-207ENST00000543125 KCNQ4P56696 695 aa12.04□□□□□ -0.48
PGA3-207ENST00000543125 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa12.04□□□□□ -0.48
PGA3-207ENST00000543125 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
PGA3-207ENST00000543125 LRRC4BQ9NT99 713 aa12.04□□□□□ -0.48
PGA3-207ENST00000543125 STK32BQ9NY57 414 aa12.04□□□□□ -0.48
PGA3-207ENST00000543125 ASAP1Q9ULH1 1129 aa12.04□□□□□ -0.48
PGA3-207ENST00000543125 PLEKHF1Q96S99 279 aa12.03□□□□□ -0.48
PGA3-207ENST00000543125 SLC52A2Q9HAB3 445 aa12.03□□□□□ -0.48
PGA3-207ENST00000543125 ATG3Q9NT62 314 aa12.03□□□□□ -0.48
PGA3-207ENST00000543125 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa12.03□□□□□ -0.48
PGA3-207ENST00000543125 DLG5Q8TDM6 1919 aa12.03□□□□□ -0.48
PGA3-207ENST00000543125 MRC1P22897 1456 aa12.02□□□□□ -0.48
PGA3-207ENST00000543125 PAPPAQ13219 1627 aa12.02□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 TAF1LQ8IZX4 1826 aa12.02□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 C5P01031 1676 aa12.01□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa12.01□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 SIK1P57059 783 aa12.01□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 TEFQ10587 303 aa12.01□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 SLC15A2Q16348 729 aa12.01□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 IL17REQ8NFR9 667 aa12.01□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 NFE2L2Q16236 605 aa12□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 CCDC184Q52MB2 194 aa12□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 ADAMTS8Q9UP79 889 aa12□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 ATP6V1AP38606 617 aa11.99□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 ZNF827Q17R98 1081 aa11.99□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 MCM10Q7L590 875 aa11.99□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 CCDC146Q8IYE0 955 aa11.99□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 AKT1S1Q96B36 256 aa11.99□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 SPON1Q9HCB6 807 aa11.99□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 MRS2Q9HD23 443 aa11.99□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa11.98□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa11.98□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 C1QTNF8P60827 252 aa11.98□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 SLC39A6Q13433 755 aa11.98□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 DCTN1Q14203 1278 aa11.98□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 RUNDC1Q96C34 613 aa11.98□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 C4BP0C0L5 1744 aa11.97□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 QSER1Q2KHR3 1735 aa11.97□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 ZNF831Q5JPB2 1677 aa11.97□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 ITPK1Q13572 414 aa11.97□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa11.97□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 DSG3P32926 999 aa11.96□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 TMPOP42166 694 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 RIPK4P57078 832 aa11.96□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 TTC5Q8N0Z6 440 aa11.96□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 LINC00116Q8NCU8 138 aa11.96□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 AK7Q96M32 723 aa11.96□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 SLC4A9Q96Q91 983 aa11.96□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 CASZ1Q86V15 1759 aa11.96□□□□□ -0.49
PGA3-207ENST00000543125 UBR2Q8IWV8 1755 aa11.95□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 BTBD11A6QL63 1104 aa11.95□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 NEUROD2Q15784 382 aa11.95□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 KCPQ6ZWJ8 1503 aa11.95□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 TJP1Q07157 1748 aa11.94□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa11.94□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 UBR3Q6ZT12 1888 aa11.94□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 LMOD3Q0VAK6 560 aa11.94□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 ZNF790Q6PG37 636 aa11.94□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 CAPN15O75808 1086 aa11.93□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 GNPATO15228 680 aa11.92□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 KCNQ3O43525 872 aa11.92□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 PHF14O94880 888 aa11.92□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 ZBTB7AO95365 584 aa11.92□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 DNAJC10Q8IXB1 793 aa11.92□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 FLAD1Q8NFF5 587 aa11.92□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa11.91□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 APAF1O14727 1248 aa11.91□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 CRKLP46109 303 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms