RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 KCNQ4P56696 695 aa32.3■■■□□ 2.76
PITX3-202ENST00000539804 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa32.3■■■□□ 2.76
PITX3-202ENST00000539804 RSPH6AQ9H0K4 717 aa32.3■■■□□ 2.76
PITX3-202ENST00000539804 SLC52A2Q9HAB3 445 aa32.3■■■□□ 2.76
PITX3-202ENST00000539804 SCN11AQ9UI33 1791 aa32.3■■■□□ 2.76
PITX3-202ENST00000539804 GNAT3A8MTJ3 354 aa32.29■■■□□ 2.76
PITX3-202ENST00000539804 RNMTO43148 476 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
PITX3-202ENST00000539804 ZBTB7AO95365 584 aa32.29■■■□□ 2.76
PITX3-202ENST00000539804 PRKAR2BP31323 418 aa32.29■■■□□ 2.76
PITX3-202ENST00000539804 MAP3K5Q99683 1374 aa32.28■■■□□ 2.76
PITX3-202ENST00000539804 ZNF831Q5JPB2 1677 aa32.27■■■□□ 2.76
PITX3-202ENST00000539804 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa32.26■■■□□ 2.76
PITX3-202ENST00000539804 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.76
PITX3-202ENST00000539804 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
PITX3-202ENST00000539804 TAF1LQ8IZX4 1826 aa32.25■■■□□ 2.75
PITX3-202ENST00000539804 MRC1P22897 1456 aa32.23■■■□□ 2.75
PITX3-202ENST00000539804 C4BP0C0L5 1744 aa32.23■■■□□ 2.75
PITX3-202ENST00000539804 POLD1P28340 1107 aa32.23■■■□□ 2.75
PITX3-202ENST00000539804 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
PITX3-202ENST00000539804 MSH5O43196 834 aa32.22■■■□□ 2.75
PITX3-202ENST00000539804 TEFQ10587 303 aa32.22■■■□□ 2.75
PITX3-202ENST00000539804 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
PITX3-202ENST00000539804 SSFA2P28290 1259 aa32.21■■■□□ 2.75
PITX3-202ENST00000539804 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
PITX3-202ENST00000539804 LGR6Q9HBX8 967 aa32.21■■■□□ 2.75
PITX3-202ENST00000539804 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa32.2■■■□□ 2.74
PITX3-202ENST00000539804 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
PITX3-202ENST00000539804 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
PITX3-202ENST00000539804 LINC00116Q8NCU8 138 aa32.18■■■□□ 2.74
PITX3-202ENST00000539804 PTGER2P43116 358 aa32.17■■■□□ 2.74
PITX3-202ENST00000539804 TTC5Q8N0Z6 440 aa32.17■■■□□ 2.74
PITX3-202ENST00000539804 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
PITX3-202ENST00000539804 DCAF8L1A6NGE4 600 aa32.16■■■□□ 2.74
PITX3-202ENST00000539804 PHACTR3Q96KR7 559 aa32.16■■■□□ 2.74
PITX3-202ENST00000539804 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
PITX3-202ENST00000539804 ITPK1Q13572 414 aa32.15■■■□□ 2.74
PITX3-202ENST00000539804 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
PITX3-202ENST00000539804 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa32.15■■■□□ 2.74
PITX3-202ENST00000539804 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa32.14■■■□□ 2.74
PITX3-202ENST00000539804 GNPATO15228 680 aa32.14■■■□□ 2.74
PITX3-202ENST00000539804 ADRA2BP18089 450 aa32.14■■■□□ 2.74
PITX3-202ENST00000539804 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
PITX3-202ENST00000539804 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa32.14■■■□□ 2.74
PITX3-202ENST00000539804 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
PITX3-202ENST00000539804 VSIG10Q8N0Z9 540 aa32.13■■■□□ 2.73
PITX3-202ENST00000539804 ARXQ96QS3 562 aa32.13■■■□□ 2.73
PITX3-202ENST00000539804 SGIP1Q9BQI5 828 aa32.12■■■□□ 2.73
PITX3-202ENST00000539804 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
PITX3-202ENST00000539804 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa32.11■■■□□ 2.73
PITX3-202ENST00000539804 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
PITX3-202ENST00000539804 IL17REQ8NFR9 667 aa32.11■■■□□ 2.73
PITX3-202ENST00000539804 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP32.09■■■□□ 2.73
PITX3-202ENST00000539804 TRAPPC3LQ5T215 181 aa32.09■■■□□ 2.73
PITX3-202ENST00000539804 UBR3Q6ZT12 1888 aa32.08■■■□□ 2.73
PITX3-202ENST00000539804 PHF14O94880 888 aa32.08■■■□□ 2.73
PITX3-202ENST00000539804 SLC4A9Q96Q91 983 aa32.08■■■□□ 2.73
PITX3-202ENST00000539804 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
PITX3-202ENST00000539804 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP32.07■■■□□ 2.72
PITX3-202ENST00000539804 RPS6KA4O75676 772 aa32.06■■■□□ 2.72
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PITX3-202ENST00000539804 PLEKHF1Q96S99 279 aa32.05■■■□□ 2.72
PITX3-202ENST00000539804 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
PITX3-202ENST00000539804 BTBD11A6QL63 1104 aa32.04■■■□□ 2.72
PITX3-202ENST00000539804 SLC39A6Q13433 755 aa32.04■■■□□ 2.72
PITX3-202ENST00000539804 STARD3NLO95772 234 aa32.02■■■□□ 2.72
PITX3-202ENST00000539804 CRKLP46109 303 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
PITX3-202ENST00000539804 NFE2L2Q16236 605 aa32.02■■■□□ 2.72
PITX3-202ENST00000539804 FMNL2Q96PY5 1086 aa32.02■■■□□ 2.72
PITX3-202ENST00000539804 RFC4P35249 363 aa32.01■■■□□ 2.71
PITX3-202ENST00000539804 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.71
PITX3-202ENST00000539804 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.71
PITX3-202ENST00000539804 LMOD3Q0VAK6 560 aa32■■■□□ 2.71
PITX3-202ENST00000539804 KCPQ6ZWJ8 1503 aa32■■■□□ 2.71
PITX3-202ENST00000539804 SYT17Q9BSW7 474 aa31.99■■■□□ 2.71
PITX3-202ENST00000539804 CCDC87Q9NVE4 849 aa31.99■■■□□ 2.71
PITX3-202ENST00000539804 DNAJC10Q8IXB1 793 aa31.98■■■□□ 2.71
PITX3-202ENST00000539804 NLGN1Q8N2Q7 840 aa31.98■■■□□ 2.71
PITX3-202ENST00000539804 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
PITX3-202ENST00000539804 UBR2Q8IWV8 1755 aa31.97■■■□□ 2.71
PITX3-202ENST00000539804 MCM10Q7L590 875 aa31.97■■■□□ 2.71
PITX3-202ENST00000539804 TJP1Q07157 1748 aa31.97■■■□□ 2.71
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PITX3-202ENST00000539804 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.71
PITX3-202ENST00000539804 MSL1Q68DK7 614 aa31.95■■■□□ 2.71
PITX3-202ENST00000539804 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.71
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PITX3-202ENST00000539804 AMIGO3Q86WK7 504 aa31.93■■■□□ 2.7
PITX3-202ENST00000539804 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
PITX3-202ENST00000539804 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
PITX3-202ENST00000539804 RUNDC1Q96C34 613 aa31.92■■■□□ 2.7
PITX3-202ENST00000539804 A0A087WZG4 1122 aa31.9■■■□□ 2.7
PITX3-202ENST00000539804 KLHL34Q8N239 644 aa31.9■■■□□ 2.7
PITX3-202ENST00000539804 CD2APQ9Y5K6 639 aa31.9■■■□□ 2.7
PITX3-202ENST00000539804 ZPR1O75312 459 aa31.89■■■□□ 2.7
PITX3-202ENST00000539804 RIPK4P57078 832 aa31.89■■■□□ 2.7
PITX3-202ENST00000539804 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
PITX3-202ENST00000539804 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
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