RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537757.5

LMO3-217, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 516 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-217ENST00000537757 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
LMO3-217ENST00000537757 TMOD3Q9NYL9 352 aa16.14■□□□□ 0.17
LMO3-217ENST00000537757 GNAI1P63096 354 aa16.13■□□□□ 0.17
LMO3-217ENST00000537757 PTF1AQ7RTS3 328 aa16.13■□□□□ 0.17
LMO3-217ENST00000537757 BRWD3Q6RI45 1802 aa16.12■□□□□ 0.17
LMO3-217ENST00000537757 BTBD11A6QL63 1104 aa16.12■□□□□ 0.17
LMO3-217ENST00000537757 SLFN5Q08AF3 891 aa16.12■□□□□ 0.17
LMO3-217ENST00000537757 E9PSI1 815 aa16.11■□□□□ 0.17
LMO3-217ENST00000537757 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
LMO3-217ENST00000537757 ATG3Q9NT62 314 aa16.11■□□□□ 0.17
LMO3-217ENST00000537757 MIS18AQ9NYP9 233 aa16.11■□□□□ 0.17
LMO3-217ENST00000537757 DLG5Q8TDM6 1919 aa16.1■□□□□ 0.17
LMO3-217ENST00000537757 ZNF790Q6PG37 636 aa16.1■□□□□ 0.17
LMO3-217ENST00000537757 CDCA7LQ96GN5 454 aa16.1■□□□□ 0.17
LMO3-217ENST00000537757 MBIPQ9NS73 344 aa16.1■□□□□ 0.17
LMO3-217ENST00000537757 ASAP1Q9ULH1 1129 aa16.1■□□□□ 0.17
LMO3-217ENST00000537757 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa16.1■□□□□ 0.17
LMO3-217ENST00000537757 SCN11AQ9UI33 1791 aa16.1■□□□□ 0.17
LMO3-217ENST00000537757 TRIM37O94972 964 aa16.09■□□□□ 0.17
LMO3-217ENST00000537757 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
LMO3-217ENST00000537757 TSPYL4Q9UJ04 414 aa16.09■□□□□ 0.17
LMO3-217ENST00000537757 HEG1Q9ULI3 1381 aa16.09■□□□□ 0.17
LMO3-217ENST00000537757 KCNQ3O43525 872 aa16.08■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 SLC39A6Q13433 755 aa16.08■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 MYH16Q9H6N6 1097 aa16.08■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 DUSP27Q5VZP5 1158 aa16.07■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 FANCIQ9NVI1 1328 aa16.07■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 PLSCR1O15162 318 aa16.06■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 ILDR2Q71H61 639 aa16.06■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 CCDC125Q86Z20 511 aa16.06■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 NHSQ6T4R5 1651 aa16.05■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 TTC5Q8N0Z6 440 aa16.05■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 VSIG10Q8N0Z9 540 aa16.05■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 DOT1LQ8TEK3 1739 aa16.05■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 FMNL2Q96PY5 1086 aa16.04■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 SLC4A9Q96Q91 983 aa16.04■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 PALLDQ8WX93 1383 aa16.03■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 KCPQ6ZWJ8 1503 aa16.03■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa16.02■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 APBA3O96018 575 aa16.02■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 HOXB7P09629 217 aa16.02■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 SIK1P57059 783 aa16.02■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 PROM2Q8N271 834 aa16.02■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 C8orf58Q8NAV2 365 aa16.02■□□□□ 0.16
LMO3-217ENST00000537757 SBF2Q86WG5 1849 aa16.01■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 PAPPAQ13219 1627 aa16.01■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 ITGB4P16144 1822 aa16.01■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 KRT24Q2M2I5 525 aa16■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 TSPYL6Q8N831 410 aa16■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 CAMKK2Q96RR4 588 aa16■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 VAMP4O75379 141 aa15.99■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.99■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 KDM3BQ7LBC6 1761 aa15.98■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 ITPK1Q13572 414 aa15.98■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 ATP6V1AP38606 617 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 TXNRD1Q16881 649 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 LRRC4BQ9NT99 713 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 USP16Q9Y5T5 823 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 BTAF1O14981 1849 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 UBR2Q8IWV8 1755 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 DNAJC10Q8IXB1 793 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 ZNF428Q96B54 188 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 CHMP4AQ9BY43 222 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
LMO3-217ENST00000537757 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
LMO3-217ENST00000537757 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LMO3-217ENST00000537757 BAG6P46379 1132 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO3-217ENST00000537757 STARD3NLO95772 234 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO3-217ENST00000537757 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LMO3-217ENST00000537757 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LMO3-217ENST00000537757 LINC00116Q8NCU8 138 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO3-217ENST00000537757 ZNF831Q5JPB2 1677 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO3-217ENST00000537757 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LMO3-217ENST00000537757 KCNQ4P56696 695 aa15.93■□□□□ 0.14
LMO3-217ENST00000537757 PDIA6Q15084 440 aa15.93■□□□□ 0.14
LMO3-217ENST00000537757 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LMO3-217ENST00000537757 DEFB132Q7Z7B7 95 aa15.93■□□□□ 0.14
LMO3-217ENST00000537757 ERBB4Q15303 1308 aa15.93■□□□□ 0.14
LMO3-217ENST00000537757 KAT6BQ8WYB5 2073 aa15.92■□□□□ 0.14
LMO3-217ENST00000537757 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms