RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537075.2

KCNS1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-202ENST00000537075 STK31Q9BXU1 1019 aa28.12■■■□□ 2.09
KCNS1-202ENST00000537075 NPHP3Q7Z494 1330 aa28.11■■■□□ 2.09
KCNS1-202ENST00000537075 KCNH5Q8NCM2 988 aa28.11■■■□□ 2.09
KCNS1-202ENST00000537075 BABAM1Q9NWV8 329 aa28.11■■■□□ 2.09
KCNS1-202ENST00000537075 FLIIQ13045 1269 aa28.1■■■□□ 2.09
KCNS1-202ENST00000537075 CCDC30Q5VVM6 783 aa28.1■■■□□ 2.09
KCNS1-202ENST00000537075 SLIT3O75094 1523 aa28.1■■■□□ 2.09
KCNS1-202ENST00000537075 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
KCNS1-202ENST00000537075 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
KCNS1-202ENST00000537075 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.09■■■□□ 2.09
KCNS1-202ENST00000537075 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa28.09■■■□□ 2.09
KCNS1-202ENST00000537075 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
KCNS1-202ENST00000537075 KDM3BQ7LBC6 1761 aa28.07■■■□□ 2.08
KCNS1-202ENST00000537075 NBPF6Q5VWK0 638 aa28.07■■■□□ 2.08
KCNS1-202ENST00000537075 NBPF4Q96M43 638 aa28.07■■■□□ 2.08
KCNS1-202ENST00000537075 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.07■■■□□ 2.08
KCNS1-202ENST00000537075 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
KCNS1-202ENST00000537075 SLAIN2Q9P270 581 aa28.07■■■□□ 2.08
KCNS1-202ENST00000537075 BRINP3Q76B58 766 aa28.06■■■□□ 2.08
KCNS1-202ENST00000537075 CHMP5Q9NZZ3 219 aa28.06■■■□□ 2.08
KCNS1-202ENST00000537075 DDIT3P35638 169 aa28.05■■■□□ 2.08
KCNS1-202ENST00000537075 NECTIN2Q92692 538 aa28.05■■■□□ 2.08
KCNS1-202ENST00000537075 PXDNQ92626 1479 aa28.05■■■□□ 2.08
KCNS1-202ENST00000537075 HMMRO75330 724 aa28.04■■■□□ 2.08
KCNS1-202ENST00000537075 PXDNLA1KZ92 1463 aa28.04■■■□□ 2.08
KCNS1-202ENST00000537075 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
KCNS1-202ENST00000537075 APBB1O00213 710 aa28.03■■■□□ 2.08
KCNS1-202ENST00000537075 GCP02774 474 aa28.03■■■□□ 2.08
KCNS1-202ENST00000537075 GNAI2P04899 355 aa28.03■■■□□ 2.08
KCNS1-202ENST00000537075 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa28.02■■■□□ 2.08
KCNS1-202ENST00000537075 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.08
KCNS1-202ENST00000537075 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.01■■■□□ 2.07
KCNS1-202ENST00000537075 NCAPD2Q15021 1401 aa28■■■□□ 2.07
KCNS1-202ENST00000537075 SDSP20132 328 aa28■■■□□ 2.07
KCNS1-202ENST00000537075 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
KCNS1-202ENST00000537075 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.98■■■□□ 2.07
KCNS1-202ENST00000537075 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
KCNS1-202ENST00000537075 LGR6Q9HBX8 967 aa27.98■■■□□ 2.07
KCNS1-202ENST00000537075 GNAI3P08754 354 aa27.97■■■□□ 2.07
KCNS1-202ENST00000537075 PLEKHG5O94827 1062 aa27.97■■■□□ 2.07
KCNS1-202ENST00000537075 MCM4P33991 863 aa27.97■■■□□ 2.07
KCNS1-202ENST00000537075 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa27.97■■■□□ 2.07
KCNS1-202ENST00000537075 ARHGEF25Q86VW2 580 aa27.97■■■□□ 2.07
KCNS1-202ENST00000537075 OSBPL3Q9H4L5 887 aa27.97■■■□□ 2.07
KCNS1-202ENST00000537075 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa27.96■■■□□ 2.07
KCNS1-202ENST00000537075 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.95■■■□□ 2.07
KCNS1-202ENST00000537075 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27.95■■■□□ 2.07
KCNS1-202ENST00000537075 SALL3Q9BXA9 1300 aa27.95■■■□□ 2.06
KCNS1-202ENST00000537075 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
KCNS1-202ENST00000537075 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
KCNS1-202ENST00000537075 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa27.94■■■□□ 2.06
KCNS1-202ENST00000537075 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
KCNS1-202ENST00000537075 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa27.94■■■□□ 2.06
KCNS1-202ENST00000537075 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa27.94■■■□□ 2.06
KCNS1-202ENST00000537075 USP26Q9BXU7 913 aa27.94■■■□□ 2.06
KCNS1-202ENST00000537075 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
KCNS1-202ENST00000537075 PDE1AP54750 535 aa27.93■■■□□ 2.06
KCNS1-202ENST00000537075 ATP8B2P98198 1209 aa27.93■■■□□ 2.06
KCNS1-202ENST00000537075 NHSL1Q5SYE7 1610 aa27.93■■■□□ 2.06
KCNS1-202ENST00000537075 USP44Q9H0E7 712 aa27.92■■■□□ 2.06
KCNS1-202ENST00000537075 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
KCNS1-202ENST00000537075 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
KCNS1-202ENST00000537075 AKAP4Q5JQC9 854 aa27.91■■■□□ 2.06
KCNS1-202ENST00000537075 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
KCNS1-202ENST00000537075 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
KCNS1-202ENST00000537075 HOXB7P09629 217 aa27.9■■■□□ 2.06
KCNS1-202ENST00000537075 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
KCNS1-202ENST00000537075 RGPD5Q99666 1765 aa27.9■■■□□ 2.06
KCNS1-202ENST00000537075 KCNQ3O43525 872 aa27.89■■■□□ 2.06
KCNS1-202ENST00000537075 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.05
KCNS1-202ENST00000537075 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
KCNS1-202ENST00000537075 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
KCNS1-202ENST00000537075 LRRCC1Q9C099 1032 aa27.88■■■□□ 2.05
KCNS1-202ENST00000537075 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa27.87■■■□□ 2.05
KCNS1-202ENST00000537075 IL27Q8NEV9 243 aa27.86■■■□□ 2.05
KCNS1-202ENST00000537075 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
KCNS1-202ENST00000537075 RABEP1Q15276 862 aa27.86■■■□□ 2.05
KCNS1-202ENST00000537075 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa27.86■■■□□ 2.05
KCNS1-202ENST00000537075 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa27.86■■■□□ 2.05
KCNS1-202ENST00000537075 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
KCNS1-202ENST00000537075 AMOTQ4VCS5 1084 aa27.85■■■□□ 2.05
KCNS1-202ENST00000537075 CASC1Q6TDU7 716 aa27.85■■■□□ 2.05
KCNS1-202ENST00000537075 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.85■■■□□ 2.05
KCNS1-202ENST00000537075 CHPF2Q9P2E5 772 aa27.85■■■□□ 2.05
KCNS1-202ENST00000537075 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
KCNS1-202ENST00000537075 BRPF3Q9ULD4 1205 aa27.85■■■□□ 2.05
KCNS1-202ENST00000537075 TEFQ10587 303 aa27.84■■■□□ 2.05
KCNS1-202ENST00000537075 CABLES1Q8TDN4 633 aa27.84■■■□□ 2.05
KCNS1-202ENST00000537075 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.84■■■□□ 2.05
KCNS1-202ENST00000537075 BTBD11A6QL63 1104 aa27.83■■■□□ 2.05
KCNS1-202ENST00000537075 RNMTO43148 476 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
KCNS1-202ENST00000537075 TSHZ3Q63HK5 1081 aa27.83■■■□□ 2.05
KCNS1-202ENST00000537075 RAB3GAP1Q15042 981 aa27.83■■■□□ 2.05
KCNS1-202ENST00000537075 COL18A1P39060 1754 aa27.82■■■□□ 2.04
KCNS1-202ENST00000537075 SSH3Q8TE77 659 aa27.82■■■□□ 2.04
KCNS1-202ENST00000537075 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
KCNS1-202ENST00000537075 MX1P20591 662 aa27.82■■■□□ 2.04
KCNS1-202ENST00000537075 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa27.82■■■□□ 2.04
KCNS1-202ENST00000537075 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.81■■■□□ 2.04
KCNS1-202ENST00000537075 ERC2O15083 957 aa27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 374.4 ms