RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 APLP1P51693 650 aa7.72□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMF1P82094 1093 aa7.72□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRR14Q9BWN1 585 aa7.72□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.72□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa7.72□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ST8SIA5O15466 376 aa7.72□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CFHP08603 1231 aa7.72□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AMHR2Q16671 573 aa7.72□□□□□ -1.17
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RDH13Q8NBN7 331 aa7.72□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRAK1Q9UPV9 953 aa7.72□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KMT5BQ4FZB7 885 aa7.71□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPRYD7Q5W111 196 aa7.71□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZMYND15Q9H091 742 aa7.71□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POGKQ9P215 609 aa7.71□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STK26Q9P289 416 aa7.71□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARHGAP23Q9P227 1491 aa7.71□□□□□ -1.18
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 QRICH2Q9H0J4 1663 aa7.7□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DIP2AQ14689 1571 aa7.69□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LTKP29376 864 aa7.69□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TBX22Q9Y458 520 aa7.69□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC7Q96M83 1385 aa7.68□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KNDC1Q76NI1 1749 aa7.68□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa7.68□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADGRB1O14514 1584 aa7.68□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC26A8Q96RN1 970 aa7.67□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa7.67□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIF7Q2M1P5 1343 aa7.67□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WASHC2AQ641Q2 1341 aa7.67□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EVC2Q86UK5 1308 aa7.67□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CD46P15529 392 aa7.66□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF697Q5TEC3 545 aa7.66□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PARP9Q8IXQ6 854 aa7.66□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CRIPAKQ8N1N5 446 aa7.66□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DLC1Q96QB1 1528 aa7.66□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABCC11Q96J66 1382 aa7.66□□□□□ -1.18
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GCGRP47871 477 aa7.66□□□□□ -1.18
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.65□□□□□ -1.18
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TNFRSF10AO00220 468 aa7.64□□□□□ -1.19
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COPS2P61201 443 aa7.64□□□□□ -1.19
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RSPH6AQ9H0K4 717 aa7.64□□□□□ -1.19
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7.64□□□□□ -1.19
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 METP08581 1390 aa7.64□□□□□ -1.19
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa7.64□□□□□ -1.19
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM135BQ49AJ0 1406 aa7.63□□□□□ -1.19
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.63□□□□□ -1.19
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CPS1P31327 1500 aa7.63□□□□□ -1.19
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DISP3Q9P2K9 1392 aa7.62□□□□□ -1.19
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZPR1O75312 459 aa7.62□□□□□ -1.19
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WAPLQ7Z5K2 1190 aa7.62□□□□□ -1.19
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMC1Q8TDI8 760 aa7.62□□□□□ -1.19
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TECPR2O15040 1411 aa7.62□□□□□ -1.19
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HSPA2P54652 639 aa7.61□□□□□ -1.19
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANKLE1Q8NAG6 615 aa7.61□□□□□ -1.19
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.61□□□□□ -1.19
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KDM4AO75164 1064 aa7.61□□□□□ -1.19
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCNA6P17658 529 aa7.61□□□□□ -1.19
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATP6V1AP38606 617 aa7.61□□□□□ -1.19
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDK19Q9BWU1 502 aa7.61□□□□□ -1.19
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KNSTRNQ9Y448 316 aa7.61□□□□□ -1.19
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LMTK3Q96Q04 1460 aa7.6□□□□□ -1.19
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PTCH1Q13635 1447 aa7.6□□□□□ -1.19
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