RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532743.5

RAD51-208, Transcript of RAD51 recombinase, human

TSL 2 BASIC

Gene RAD51, Length 1,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD51-208	ENST00000532743	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		32.52	■■■□□ 2.8
RAD51-208	ENST00000532743	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		32.52	■■■□□ 2.8
RAD51-208	ENST00000532743	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
RAD51-208	ENST00000532743	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		32.51	■■■□□ 2.8
RAD51-208	ENST00000532743	TEF	Q10587	303 aa		32.51	■■■□□ 2.79
RAD51-208	ENST00000532743	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		32.5	■■■□□ 2.79
RAD51-208	ENST00000532743	NFE2L2	Q16236	605 aa		32.5	■■■□□ 2.79
RAD51-208	ENST00000532743	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		32.5	■■■□□ 2.79
RAD51-208	ENST00000532743	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		32.5	■■■□□ 2.79
RAD51-208	ENST00000532743	RUNDC1	Q96C34	613 aa		32.48	■■■□□ 2.79
RAD51-208	ENST00000532743	ATG3	Q9NT62	314 aa		32.48	■■■□□ 2.79
RAD51-208	ENST00000532743	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		32.47	■■■□□ 2.79
RAD51-208	ENST00000532743	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		32.47	■■■□□ 2.79
RAD51-208	ENST00000532743	KCNQ4	P56696	695 aa		32.46	■■■□□ 2.79
RAD51-208	ENST00000532743	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		32.46	■■■□□ 2.79
RAD51-208	ENST00000532743	MCM10	Q7L590	875 aa		32.46	■■■□□ 2.79
RAD51-208	ENST00000532743	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		32.45	■■■□□ 2.79
RAD51-208	ENST00000532743	C4B	P0C0L5	1744 aa		32.45	■■■□□ 2.79
RAD51-208	ENST00000532743	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
RAD51-208	ENST00000532743	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.78
RAD51-208	ENST00000532743	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.78
RAD51-208	ENST00000532743	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.78
RAD51-208	ENST00000532743	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
RAD51-208	ENST00000532743	STK32B	Q9NY57	414 aa		32.44	■■■□□ 2.78
RAD51-208	ENST00000532743	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		32.43	■■■□□ 2.78
RAD51-208	ENST00000532743	SIK1	P57059	783 aa		32.43	■■■□□ 2.78
RAD51-208	ENST00000532743	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
RAD51-208	ENST00000532743	DCTN1	Q14203	1278 aa		32.42	■■■□□ 2.78
RAD51-208	ENST00000532743	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
RAD51-208	ENST00000532743	TJP1	Q07157	1748 aa		32.42	■■■□□ 2.78
RAD51-208	ENST00000532743	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
RAD51-208	ENST00000532743	RIPK4	P57078	832 aa		32.41	■■■□□ 2.78
RAD51-208	ENST00000532743	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
RAD51-208	ENST00000532743	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
RAD51-208	ENST00000532743	NEUROD2	Q15784	382 aa		32.4	■■■□□ 2.78
RAD51-208	ENST00000532743	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
RAD51-208	ENST00000532743	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
RAD51-208	ENST00000532743	ATP6V1A	P38606	617 aa		32.39	■■■□□ 2.78
RAD51-208	ENST00000532743	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		32.38	■■■□□ 2.77
RAD51-208	ENST00000532743	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		32.38	■■■□□ 2.77
RAD51-208	ENST00000532743	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
RAD51-208	ENST00000532743	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		32.38	■■■□□ 2.77
RAD51-208	ENST00000532743	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		32.38	■■■□□ 2.77
RAD51-208	ENST00000532743	SLC39A6	Q13433	755 aa		32.37	■■■□□ 2.77
RAD51-208	ENST00000532743	SLC15A2	Q16348	729 aa		32.36	■■■□□ 2.77
RAD51-208	ENST00000532743	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		32.36	■■■□□ 2.77
RAD51-208	ENST00000532743	CASZ1	Q86V15	1759 aa		32.36	■■■□□ 2.77
RAD51-208	ENST00000532743	BTBD11	A6QL63	1104 aa		32.35	■■■□□ 2.77
RAD51-208	ENST00000532743	ZNF827	Q17R98	1081 aa		32.34	■■■□□ 2.77
RAD51-208	ENST00000532743	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
RAD51-208	ENST00000532743	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		32.32	■■■□□ 2.76
RAD51-208	ENST00000532743	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.76
RAD51-208	ENST00000532743	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		32.31	■■■□□ 2.76
RAD51-208	ENST00000532743	APAF1	O14727	1248 aa		32.31	■■■□□ 2.76
RAD51-208	ENST00000532743	ITPK1	Q13572	414 aa		32.31	■■■□□ 2.76
RAD51-208	ENST00000532743	ZNF790	Q6PG37	636 aa		32.31	■■■□□ 2.76
RAD51-208	ENST00000532743	AKT1S1	Q96B36	256 aa		32.3	■■■□□ 2.76
RAD51-208	ENST00000532743	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		32.29	■■■□□ 2.76
RAD51-208	ENST00000532743	AK7	Q96M32	723 aa		32.29	■■■□□ 2.76
RAD51-208	ENST00000532743	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		32.29	■■■□□ 2.76
RAD51-208	ENST00000532743	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
RAD51-208	ENST00000532743	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		32.26	■■■□□ 2.76
RAD51-208	ENST00000532743	CCER2	I3L3R5	266 aa		32.26	■■■□□ 2.75
RAD51-208	ENST00000532743	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		32.24	■■■□□ 2.75
RAD51-208	ENST00000532743	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
RAD51-208	ENST00000532743	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		32.22	■■■□□ 2.75
RAD51-208	ENST00000532743	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		32.22	■■■□□ 2.75
RAD51-208	ENST00000532743	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		32.22	■■■□□ 2.75
RAD51-208	ENST00000532743	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		32.21	■■■□□ 2.75
RAD51-208	ENST00000532743	C4A	P0C0L4	1744 aa		32.21	■■■□□ 2.75
RAD51-208	ENST00000532743	GNPAT	O15228	680 aa		32.21	■■■□□ 2.75
RAD51-208	ENST00000532743	KCNQ3	O43525	872 aa		32.21	■■■□□ 2.75
RAD51-208	ENST00000532743	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		32.2	■■■□□ 2.74
RAD51-208	ENST00000532743	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		32.2	■■■□□ 2.74
RAD51-208	ENST00000532743	LRP5	O75197	1615 aa		32.19	■■■□□ 2.74
RAD51-208	ENST00000532743	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		32.19	■■■□□ 2.74
RAD51-208	ENST00000532743	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		32.19	■■■□□ 2.74
RAD51-208	ENST00000532743	MSH5	O43196	834 aa		32.18	■■■□□ 2.74
RAD51-208	ENST00000532743	MIER1	Q8N108	512 aa		32.18	■■■□□ 2.74
RAD51-208	ENST00000532743	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
RAD51-208	ENST00000532743	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		32.18	■■■□□ 2.74
RAD51-208	ENST00000532743	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		32.17	■■■□□ 2.74
RAD51-208	ENST00000532743	PHF14	O94880	888 aa		32.17	■■■□□ 2.74
RAD51-208	ENST00000532743	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
RAD51-208	ENST00000532743	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
RAD51-208	ENST00000532743	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		32.16	■■■□□ 2.74
RAD51-208	ENST00000532743	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
RAD51-208	ENST00000532743	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
RAD51-208	ENST00000532743	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
RAD51-208	ENST00000532743	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
RAD51-208	ENST00000532743	ZBTB7A	O95365	584 aa		32.13	■■■□□ 2.73
RAD51-208	ENST00000532743	STARD3NL	O95772	234 aa		32.13	■■■□□ 2.73
RAD51-208	ENST00000532743	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
RAD51-208	ENST00000532743	SSFA2	P28290	1259 aa		32.12	■■■□□ 2.73
RAD51-208	ENST00000532743	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
RAD51-208	ENST00000532743	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RAD51-208	ENST00000532743	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
RAD51-208	ENST00000532743	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
RAD51-208	ENST00000532743	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		32.1	■■■□□ 2.73
RAD51-208	ENST00000532743	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		32.1	■■■□□ 2.73

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