RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519070.5

FAM49B-211, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM49B, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49B-211ENST00000519070 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.51■■□□□ 1.03
FAM49B-211ENST00000519070 SLC15A2Q16348 729 aa21.51■■□□□ 1.03
FAM49B-211ENST00000519070 NBPF14Q5TI25 921 aa21.51■■□□□ 1.03
FAM49B-211ENST00000519070 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
FAM49B-211ENST00000519070 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.51■■□□□ 1.03
FAM49B-211ENST00000519070 C5P01031 1676 aa21.5■■□□□ 1.03
FAM49B-211ENST00000519070 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.5■■□□□ 1.03
FAM49B-211ENST00000519070 CABP4P57796 275 aa21.5■■□□□ 1.03
FAM49B-211ENST00000519070 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
FAM49B-211ENST00000519070 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
FAM49B-211ENST00000519070 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.49■■□□□ 1.03
FAM49B-211ENST00000519070 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.49■■□□□ 1.03
FAM49B-211ENST00000519070 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.49■■□□□ 1.03
FAM49B-211ENST00000519070 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM49B-211ENST00000519070 SIK1P57059 783 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM49B-211ENST00000519070 ITPK1Q13572 414 aa21.48■■□□□ 1.03
FAM49B-211ENST00000519070 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
FAM49B-211ENST00000519070 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM49B-211ENST00000519070 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM49B-211ENST00000519070 STK32BQ9NY57 414 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM49B-211ENST00000519070 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM49B-211ENST00000519070 C4BP0C0L5 1744 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM49B-211ENST00000519070 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM49B-211ENST00000519070 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
FAM49B-211ENST00000519070 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM49B-211ENST00000519070 LRP5O75197 1615 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM49B-211ENST00000519070 TJP1Q07157 1748 aa21.43■■□□□ 1.02
FAM49B-211ENST00000519070 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
FAM49B-211ENST00000519070 SLC39A6Q13433 755 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM49B-211ENST00000519070 DCTN1Q14203 1278 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM49B-211ENST00000519070 NFE2L2Q16236 605 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM49B-211ENST00000519070 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM49B-211ENST00000519070 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.41■■□□□ 1.02
FAM49B-211ENST00000519070 MCM10Q7L590 875 aa21.41■■□□□ 1.02
FAM49B-211ENST00000519070 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
FAM49B-211ENST00000519070 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.39■■□□□ 1.01
FAM49B-211ENST00000519070 ANP32CO43423 234 aa21.39■■□□□ 1.01
FAM49B-211ENST00000519070 ATP6V1AP38606 617 aa21.39■■□□□ 1.01
FAM49B-211ENST00000519070 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
FAM49B-211ENST00000519070 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM49B-211ENST00000519070 KCNQ3O43525 872 aa21.37■■□□□ 1.01
FAM49B-211ENST00000519070 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
FAM49B-211ENST00000519070 SMIM5Q71RC9 77 aa21.37■■□□□ 1.01
FAM49B-211ENST00000519070 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
FAM49B-211ENST00000519070 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
FAM49B-211ENST00000519070 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
FAM49B-211ENST00000519070 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
FAM49B-211ENST00000519070 SGIP1Q9BQI5 828 aa21.36■■□□□ 1.01
FAM49B-211ENST00000519070 TEFQ10587 303 aa21.35■■□□□ 1.01
FAM49B-211ENST00000519070 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
FAM49B-211ENST00000519070 ZNF790Q6PG37 636 aa21.35■■□□□ 1.01
FAM49B-211ENST00000519070 RUNDC1Q96C34 613 aa21.35■■□□□ 1.01
FAM49B-211ENST00000519070 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
FAM49B-211ENST00000519070 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.34■■□□□ 1.01
FAM49B-211ENST00000519070 PTGER2P43116 358 aa21.34■■□□□ 1.01
FAM49B-211ENST00000519070 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
FAM49B-211ENST00000519070 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.34■■□□□ 1.01
FAM49B-211ENST00000519070 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.33■■□□□ 1.01
FAM49B-211ENST00000519070 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
FAM49B-211ENST00000519070 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
FAM49B-211ENST00000519070 ZBTB7AO95365 584 aa21.32■■□□□ 1
FAM49B-211ENST00000519070 DNAJC10Q8IXB1 793 aa21.32■■□□□ 1
FAM49B-211ENST00000519070 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.32■■□□□ 1
FAM49B-211ENST00000519070 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.32■■□□□ 1
FAM49B-211ENST00000519070 NEFMP07197 916 aa21.31■■□□□ 1
FAM49B-211ENST00000519070 RIPK4P57078 832 aa21.31■■□□□ 1
FAM49B-211ENST00000519070 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
FAM49B-211ENST00000519070 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
FAM49B-211ENST00000519070 BTBD11A6QL63 1104 aa21.3■■□□□ 1
FAM49B-211ENST00000519070 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
FAM49B-211ENST00000519070 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
FAM49B-211ENST00000519070 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.3■■□□□ 1
FAM49B-211ENST00000519070 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.3■■□□□ 1
FAM49B-211ENST00000519070 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
FAM49B-211ENST00000519070 CRKLP46109 303 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
FAM49B-211ENST00000519070 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.29■■□□□ 1
FAM49B-211ENST00000519070 AK7Q96M32 723 aa21.29■■□□□ 1
FAM49B-211ENST00000519070 MTFR1LQ9H019 292 aa21.29■■□□□ 1
FAM49B-211ENST00000519070 SPON1Q9HCB6 807 aa21.29■■□□□ 1
FAM49B-211ENST00000519070 MRS2Q9HD23 443 aa21.29■■□□□ 1
FAM49B-211ENST00000519070 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
FAM49B-211ENST00000519070 SSFA2P28290 1259 aa21.28■■□□□ 1
FAM49B-211ENST00000519070 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.28■■□□□ 1
FAM49B-211ENST00000519070 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
FAM49B-211ENST00000519070 GNPATO15228 680 aa21.27■■□□□ 1
FAM49B-211ENST00000519070 RPS6KA4O75676 772 aa21.27■■□□□ 1
FAM49B-211ENST00000519070 APAF1O14727 1248 aa21.26■□□□□ 0.99
FAM49B-211ENST00000519070 C4AP0C0L4 1744 aa21.26■□□□□ 0.99
FAM49B-211ENST00000519070 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.25■□□□□ 0.99
FAM49B-211ENST00000519070 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.25■□□□□ 0.99
FAM49B-211ENST00000519070 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.25■□□□□ 0.99
FAM49B-211ENST00000519070 PHF14O94880 888 aa21.24■□□□□ 0.99
FAM49B-211ENST00000519070 NEUROD2Q15784 382 aa21.24■□□□□ 0.99
FAM49B-211ENST00000519070 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.24■□□□□ 0.99
FAM49B-211ENST00000519070 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
FAM49B-211ENST00000519070 CCDC87Q9NVE4 849 aa21.23■□□□□ 0.99
FAM49B-211ENST00000519070 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.23■□□□□ 0.99
FAM49B-211ENST00000519070 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
FAM49B-211ENST00000519070 USP16Q9Y5T5 823 aa21.22■□□□□ 0.99
FAM49B-211ENST00000519070 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms