RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517194.1

RNU6-1261P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1261, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1261P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1261P-201ENST00000517194 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CCDC27Q2M243 656 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TNFRSF10AO00220 468 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ABL1P00519 1130 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ADH1AP07327 375 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 IGFBP4P22692 258 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 EPHA4P54764 986 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CYP4X1Q8N118 509 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ITPKCQ96DU7 683 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SEPT3Q9UH03 358 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SOWAHDA6NJG2 315 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 IL2RAP01589 272 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 WDR4P57081 412 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TBCELQ5QJ74 424 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 XAGE2Q96GT9 111 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ANO2Q9NQ90 1003 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 A0A1W2PRU2 124 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 A6NJY4 79 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 C21orf2O43822 256 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SMTNP53814 917 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 Q6ZVU0 165 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CNKSR1Q969H4 720 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TOR4AQ9NXH8 423 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 FOXO3O43524 673 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 PTGIRP43119 386 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TIMP2P16035 220 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SMPD1P17405 629 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 FOXK2Q01167 660 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 MTFR1Q15390 333 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TLR1Q15399 786 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-1261P-201ENST00000517194 MEN1O00255 615 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CDK2AP1O14519 115 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 RELBQ01201 579 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CENPCQ03188 943 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CLN3Q13286 438 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TRIM67Q6ZTA4 783 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 HPS1Q92902 700 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 COL26A1Q96A83 441 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 USP3Q9Y6I4 520 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 H3BRB1 525 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ICMTO60725 284 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 MTMR3Q13615 1198 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 NLRP3Q96P20 1036 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 PRR20EP86478 221 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 PRR20CP86479 221 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 PRR20DP86480 221 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 PRR20BP86481 221 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 PRR20AP86496 221 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 STAG2Q8N3U4 1231 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 MEIOBQ8N635 442 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 HELQQ8TDG4 1101 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CABP1Q9NZU7 370 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SERTM1A2A2V5 107 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 MARSP56192 900 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TEAD4Q15561 434 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ECM1Q16610 540 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 C16orf46Q6P387 395 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 NBPF15Q8N660 670 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms