RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-223ENST00000512131 MSL1Q68DK7 614 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2-223ENST00000512131 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2-223ENST00000512131 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2-223ENST00000512131 NUDCQ9Y266 331 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2-223ENST00000512131 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2-223ENST00000512131 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.14■■□□□ 1.3
SH3BP2-223ENST00000512131 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
SH3BP2-223ENST00000512131 PALLDQ8WX93 1383 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP2-223ENST00000512131 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-223ENST00000512131 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-223ENST00000512131 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-223ENST00000512131 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-223ENST00000512131 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-223ENST00000512131 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-223ENST00000512131 DCAF5Q96JK2 942 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-223ENST00000512131 FCHSD2O94868 740 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2-223ENST00000512131 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2-223ENST00000512131 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2-223ENST00000512131 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2-223ENST00000512131 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-223ENST00000512131 C5P01031 1676 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-223ENST00000512131 ITGB4P16144 1822 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-223ENST00000512131 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-223ENST00000512131 PRKAR2BP31323 418 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-223ENST00000512131 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-223ENST00000512131 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-223ENST00000512131 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-223ENST00000512131 PIGBQ92521 554 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-223ENST00000512131 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-223ENST00000512131 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-223ENST00000512131 AK7Q96M32 723 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-223ENST00000512131 ATP10DQ9P241 1426 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-223ENST00000512131 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-223ENST00000512131 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-223ENST00000512131 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-223ENST00000512131 C4BP0C0L5 1744 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-223ENST00000512131 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-223ENST00000512131 SMIM5Q71RC9 77 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-223ENST00000512131 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-223ENST00000512131 PHF14O94880 888 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-223ENST00000512131 SCN11AQ9UI33 1791 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-223ENST00000512131 ADCY9O60503 1353 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-223ENST00000512131 PLEKHF1Q96S99 279 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-223ENST00000512131 LGR6Q9HBX8 967 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-223ENST00000512131 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-223ENST00000512131 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-223ENST00000512131 SSFA2P28290 1259 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-223ENST00000512131 SIK1P57059 783 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-223ENST00000512131 CABP4P57796 275 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-223ENST00000512131 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-223ENST00000512131 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-223ENST00000512131 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-223ENST00000512131 ATG3Q9NT62 314 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-223ENST00000512131 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-223ENST00000512131 MRC1P22897 1456 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-223ENST00000512131 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-223ENST00000512131 IL17REQ8NFR9 667 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-223ENST00000512131 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-223ENST00000512131 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-223ENST00000512131 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-223ENST00000512131 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-223ENST00000512131 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-223ENST00000512131 ANP32CO43423 234 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-223ENST00000512131 ITPK1Q13572 414 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-223ENST00000512131 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-223ENST00000512131 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-223ENST00000512131 GNPATO15228 680 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-223ENST00000512131 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-223ENST00000512131 ATP6V1AP38606 617 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2-223ENST00000512131 CCDC184Q52MB2 194 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2-223ENST00000512131 IFFO2Q5TF58 517 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2-223ENST00000512131 NEFMP07197 916 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2-223ENST00000512131 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2-223ENST00000512131 HSPA6P17066 643 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2-223ENST00000512131 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2-223ENST00000512131 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2-223ENST00000512131 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2-223ENST00000512131 MMP10P09238 476 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2-223ENST00000512131 NFE2L2Q16236 605 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2-223ENST00000512131 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-223ENST00000512131 TEFQ10587 303 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-223ENST00000512131 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-223ENST00000512131 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-223ENST00000512131 MCM10Q7L590 875 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-223ENST00000512131 RUNDC1Q96C34 613 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-223ENST00000512131 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-223ENST00000512131 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-223ENST00000512131 KIF3CO14782 793 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-223ENST00000512131 SLC39A6Q13433 755 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-223ENST00000512131 DCTN1Q14203 1278 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-223ENST00000512131 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-223ENST00000512131 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-223ENST00000512131 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-223ENST00000512131 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-223ENST00000512131 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-223ENST00000512131 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-223ENST00000512131 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-223ENST00000512131 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-223ENST00000512131 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-223ENST00000512131 TGFB2P61812 414 aa22.81■■□□□ 1.24
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