RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511439.5

TOPBP1-208, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene TOPBP1, Length 1,142 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1-208ENST00000511439 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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TOPBP1-208ENST00000511439 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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TOPBP1-208ENST00000511439 TLR1Q15399 786 aa7.2□□□□□ -1.26
TOPBP1-208ENST00000511439 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.2□□□□□ -1.26
TOPBP1-208ENST00000511439 EFHC2Q5JST6 749 aa7.2□□□□□ -1.26
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TOPBP1-208ENST00000511439 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa7.18□□□□□ -1.26
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TOPBP1-208ENST00000511439 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.16□□□□□ -1.26
TOPBP1-208ENST00000511439 C14orf37Q86TY3 774 aa7.16□□□□□ -1.26
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TOPBP1-208ENST00000511439 SMTNP53814 917 aa7.13□□□□□ -1.27
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TOPBP1-208ENST00000511439 UBTFP17480 764 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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TOPBP1-208ENST00000511439 EML3Q32P44 896 aa7.12□□□□□ -1.27
TOPBP1-208ENST00000511439 GALNT6Q8NCL4 622 aa7.12□□□□□ -1.27
TOPBP1-208ENST00000511439 MKL2Q9ULH7 1088 aa7.12□□□□□ -1.27
TOPBP1-208ENST00000511439 BACH1O14867 736 aa7.11□□□□□ -1.27
TOPBP1-208ENST00000511439 STAU1O95793 577 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TOPBP1-208ENST00000511439 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.11□□□□□ -1.27
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