RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.61□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 FZD6O60353 706 aa7.61□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 IGHA2P01877 340 aa7.61□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 DSC3Q14574 896 aa7.61□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 CCDC87Q9NVE4 849 aa7.61□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 BRPF3Q9ULD4 1205 aa7.61□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.6□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 TNFRSF10BO14763 440 aa7.6□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 MAPK8P45983 427 aa7.6□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 GDF10P55107 478 aa7.6□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 ERVK-9P63128 1117 aa7.6□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 C16orf46Q6P387 395 aa7.6□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa7.6□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.6□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.6□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 OSBPL3Q9H4L5 887 aa7.6□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 PARP2Q9UGN5 583 aa7.6□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 A0A1W2PRU2 124 aa7.59□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 WASLO00401 505 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 GPR182O15218 404 aa7.59□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 S1PR4O95977 384 aa7.59□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 LDHBP07195 334 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 EHHADHQ08426 723 aa7.59□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.59□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 ZNF516Q92618 1163 aa7.59□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.59□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.59□□□□□ -1.19
HERC3-209ENST00000504994 BACH1O14867 736 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 TMC1Q8TDI8 760 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 SPATA32Q96LK8 384 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 SETDB2Q96T68 719 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 FAM129BQ96TA1 746 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 ETNK1Q9HBU6 452 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 INHAP05111 366 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 TBCELQ5QJ74 424 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 COX20Q5RI15 118 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 TMC4Q7Z404 712 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 NT5DC4Q86YG4 428 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 TMEM87AQ8NBN3 555 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 CITED4Q96RK1 184 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 TINF2Q9BSI4 451 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 DAB2P98082 770 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 FANCCQ00597 558 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 FOXK2Q01167 660 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 PLCB3Q01970 1234 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 TJAP1Q5JTD0 557 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 FAM26DQ5JW98 314 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 MRS2Q9HD23 443 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 CYLDQ9NQC7 956 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 AAMPQ13685 434 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 IL21Q9HBE4 155 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 STIM2Q9P246 746 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 POTEMA6NI47 508 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 SORBS3O60504 671 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 PSMD2Q13200 908 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 POTEGQ6S5H5 508 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 ATCAYQ86WG3 371 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 VTI1BQ9UEU0 232 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 ZBTB39O15060 712 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 SKOR1P84550 965 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 FGD1P98174 961 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 NYAP1Q6ZVC0 841 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 STAG2Q8N3U4 1231 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 USP3Q9Y6I4 520 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-209ENST00000504994 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 FSHRP23945 695 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 VARSP26640 1264 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
HERC3-209ENST00000504994 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms