RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496565.5

LPIN3-204, Transcript of lipin 3, human

TSL 3

Gene LPIN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LPIN3-204	ENST00000496565	SLIT2	O94813	1529 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LPIN3-204	ENST00000496565	PLEKHG5	O94827	1062 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LPIN3-204	ENST00000496565	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
LPIN3-204	ENST00000496565	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
LPIN3-204	ENST00000496565	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
LPIN3-204	ENST00000496565	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
LPIN3-204	ENST00000496565	LGR6	Q9HBX8	967 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LPIN3-204	ENST00000496565	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LPIN3-204	ENST00000496565	DISP2	A7MBM2	1401 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	EXOC5	O00471	708 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	CYP27B1	O15528	508 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	PLIN1	O60240	522 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	TSPYL6	Q8N831	410 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	CRBN	Q96SW2	442 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	STRN4	Q9NRL3	753 aa		11.95	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	TRIM27	P14373	513 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	LRP6	O75581	1613 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	ERBB4	Q15303	1308 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	CABP4	P57796	275 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	VPS72	Q15906	364 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF790	Q6PG37	636 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	ABCC4	O15439	1325 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	NRAP	Q86VF7	1730 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	SLC4A2	P04920	1241 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	HYPK	Q9NX55	129 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		11.9	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		11.9	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	NGLY1	Q96IV0	654 aa		11.9	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		11.9	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	COG6	Q9Y2V7	657 aa		11.9	□□□□□ -0.5
LPIN3-204	ENST00000496565	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		11.89	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	TNS2	Q63HR2	1409 aa		11.89	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	ADAMTS2	O95450	1211 aa		11.89	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	PANK1	Q8TE04	598 aa		11.89	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		11.89	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	DDB1	Q16531	1140 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	11.88	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		11.88	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	RLBP1	P12271	317 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	FLII	Q13045	1269 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		11.87	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	BCL9	O00512	1426 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		11.86	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	GNAI3	P08754	354 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	KRT24	Q2M2I5	525 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	USP21	Q9UK80	565 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	ATP10D	Q9P241	1426 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LPIN3-204	ENST00000496565	PAPPA	Q13219	1627 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	ALDH1L1	O75891	902 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	KSR2	Q6VAB6	950 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LPIN3-204	ENST00000496565	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52

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