RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 ATP10DQ9P241 1426 aa20.96■□□□□ 0.95
TOM1-216ENST00000492723 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.95■□□□□ 0.95
TOM1-216ENST00000492723 TNS3Q68CZ2 1445 aa20.95■□□□□ 0.94
TOM1-216ENST00000492723 SLC4A3P48751 1232 aa20.95■□□□□ 0.94
TOM1-216ENST00000492723 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.95■□□□□ 0.94
TOM1-216ENST00000492723 CEP85Q6P2H3 762 aa20.94■□□□□ 0.94
TOM1-216ENST00000492723 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
TOM1-216ENST00000492723 BTBD11A6QL63 1104 aa20.94■□□□□ 0.94
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TOM1-216ENST00000492723 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.93■□□□□ 0.94
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TOM1-216ENST00000492723 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
TOM1-216ENST00000492723 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
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TOM1-216ENST00000492723 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.83■□□□□ 0.92
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TOM1-216ENST00000492723 CPDO75976 1380 aa20.82■□□□□ 0.92
TOM1-216ENST00000492723 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa20.82■□□□□ 0.92
TOM1-216ENST00000492723 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
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TOM1-216ENST00000492723 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
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TOM1-216ENST00000492723 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
TOM1-216ENST00000492723 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
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TOM1-216ENST00000492723 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
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TOM1-216ENST00000492723 PI4KAP2A4QPH2 592 aa20.78■□□□□ 0.92
TOM1-216ENST00000492723 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.78■□□□□ 0.92
TOM1-216ENST00000492723 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa20.78■□□□□ 0.92
TOM1-216ENST00000492723 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.78■□□□□ 0.92
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TOM1-216ENST00000492723 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
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TOM1-216ENST00000492723 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.77■□□□□ 0.91
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TOM1-216ENST00000492723 TTC22Q5TAA0 569 aa20.76■□□□□ 0.91
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TOM1-216ENST00000492723 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.72■□□□□ 0.91
TOM1-216ENST00000492723 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.72■□□□□ 0.91
TOM1-216ENST00000492723 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.72■□□□□ 0.91
TOM1-216ENST00000492723 WDR17Q8IZU2 1322 aa20.72■□□□□ 0.91
TOM1-216ENST00000492723 HYPKQ9NX55 129 aa20.71■□□□□ 0.91
TOM1-216ENST00000492723 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.71■□□□□ 0.91
TOM1-216ENST00000492723 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
TOM1-216ENST00000492723 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.71■□□□□ 0.91
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