RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491635.1

GTPBP4-205, Transcript of GTP binding protein 4, human

TSL 2

Gene GTPBP4, Length 2,220 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP4-205	ENST00000491635		F6X3S4	739 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	REC8	O95072	547 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	PDE1A	P54750	535 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	ERC2	O15083	957 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	IP6K1	Q92551	441 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	HOXB7	P09629	217 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	APBB1	O00213	710 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	ST18	O60284	1047 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	ATP8B2	P98198	1209 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	NCAPD2	Q15021	1401 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	AOX1	Q06278	1338 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	SLIT3	O75094	1523 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	MRE11	P49959	708 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		12.02	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	MX1	P20591	662 aa		12.02	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		12.02	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	STAP2	Q9UGK3	403 aa		12.02	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		12.02	□□□□□ -0.48
GTPBP4-205	ENST00000491635	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	NUCB2	P80303	420 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	AK9	Q5TCS8	1911 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	C14orf37	Q86TY3	774 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	USP44	Q9H0E7	712 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	SSFA2	P28290	1259 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	SSH3	Q8TE77	659 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	RAB11FIP3	O75154	756 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	ANAPC15	P60006	121 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	IL17RA	Q96F46	866 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	MCM2	P49736	904 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	NECTIN2	Q92692	538 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	NBPF4	Q96M43	638 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	KIF1A	Q12756	1690 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	MCC	P23508	829 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	PSME1	Q06323	249 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	POLA2	Q14181	598 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	MST1R	Q04912	1400 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	CHML	P26374	656 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	TEF	Q10587	303 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP4-205	ENST00000491635	PXDN	Q92626	1479 aa		11.96	□□□□□ -0.5
GTPBP4-205	ENST00000491635	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP4-205	ENST00000491635	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP4-205	ENST00000491635	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP4-205	ENST00000491635	BEND3	Q5T5X7	828 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP4-205	ENST00000491635	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		11.95	□□□□□ -0.5

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