RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489835.6

PRRT4-205, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-205ENST00000489835 PHKG2P15735 406 aa21.94■■□□□ 1.1
PRRT4-205ENST00000489835 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.94■■□□□ 1.1
PRRT4-205ENST00000489835 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PRRT4-205ENST00000489835 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.94■■□□□ 1.1
PRRT4-205ENST00000489835 CYP27B1O15528 508 aa21.94■■□□□ 1.1
PRRT4-205ENST00000489835 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.93■■□□□ 1.1
PRRT4-205ENST00000489835 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.92■■□□□ 1.1
PRRT4-205ENST00000489835 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.92■■□□□ 1.1
PRRT4-205ENST00000489835 ADAMTS2O95450 1211 aa21.91■■□□□ 1.1
PRRT4-205ENST00000489835 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PRRT4-205ENST00000489835 G2E3Q7L622 706 aa21.91■■□□□ 1.1
PRRT4-205ENST00000489835 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
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PRRT4-205ENST00000489835 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.91■■□□□ 1.1
PRRT4-205ENST00000489835 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.91■■□□□ 1.1
PRRT4-205ENST00000489835 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PRRT4-205ENST00000489835 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PRRT4-205ENST00000489835 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PRRT4-205ENST00000489835 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PRRT4-205ENST00000489835 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
PRRT4-205ENST00000489835 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PRRT4-205ENST00000489835 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.89■■□□□ 1.09
PRRT4-205ENST00000489835 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.89■■□□□ 1.09
PRRT4-205ENST00000489835 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
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PRRT4-205ENST00000489835 IL2RBP14784 551 aa21.88■■□□□ 1.09
PRRT4-205ENST00000489835 SLC39A6Q13433 755 aa21.88■■□□□ 1.09
PRRT4-205ENST00000489835 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.87■■□□□ 1.09
PRRT4-205ENST00000489835 STK31Q9BXU1 1019 aa21.87■■□□□ 1.09
PRRT4-205ENST00000489835 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa21.87■■□□□ 1.09
PRRT4-205ENST00000489835 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PRRT4-205ENST00000489835 ABCC4O15439 1325 aa21.86■■□□□ 1.09
PRRT4-205ENST00000489835 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.86■■□□□ 1.09
PRRT4-205ENST00000489835 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PRRT4-205ENST00000489835 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.86■■□□□ 1.09
PRRT4-205ENST00000489835 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.85■■□□□ 1.09
PRRT4-205ENST00000489835 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.85■■□□□ 1.09
PRRT4-205ENST00000489835 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.84■■□□□ 1.09
PRRT4-205ENST00000489835 F6X3S4 739 aa21.84■■□□□ 1.09
PRRT4-205ENST00000489835 AAMPQ13685 434 aa21.84■■□□□ 1.09
PRRT4-205ENST00000489835 DCAF5Q96JK2 942 aa21.84■■□□□ 1.09
PRRT4-205ENST00000489835 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PRRT4-205ENST00000489835 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PRRT4-205ENST00000489835 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.83■■□□□ 1.09
PRRT4-205ENST00000489835 SCN11AQ9UI33 1791 aa21.83■■□□□ 1.09
PRRT4-205ENST00000489835 C1orf115Q9H7X2 142 aa21.83■■□□□ 1.08
PRRT4-205ENST00000489835 RGS12O14924 1447 aa21.82■■□□□ 1.08
PRRT4-205ENST00000489835 PTPRCP08575 1304 aa21.82■■□□□ 1.08
PRRT4-205ENST00000489835 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.81■■□□□ 1.08
PRRT4-205ENST00000489835 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.81■■□□□ 1.08
PRRT4-205ENST00000489835 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.81■■□□□ 1.08
PRRT4-205ENST00000489835 ANXA1P04083 346 aa21.81■■□□□ 1.08
PRRT4-205ENST00000489835 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.81■■□□□ 1.08
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PRRT4-205ENST00000489835 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
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PRRT4-205ENST00000489835 FLIIQ13045 1269 aa21.8■■□□□ 1.08
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF790Q6PG37 636 aa21.8■■□□□ 1.08
PRRT4-205ENST00000489835 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
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PRRT4-205ENST00000489835 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.79■■□□□ 1.08
PRRT4-205ENST00000489835 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PRRT4-205ENST00000489835 IL27Q8NEV9 243 aa21.79■■□□□ 1.08
PRRT4-205ENST00000489835 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PRRT4-205ENST00000489835 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PRRT4-205ENST00000489835 RGS3P49796 1198 aa21.77■■□□□ 1.08
PRRT4-205ENST00000489835 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.76■■□□□ 1.07
PRRT4-205ENST00000489835 HOXB7P09629 217 aa21.76■■□□□ 1.07
PRRT4-205ENST00000489835 FAM161AQ3B820 660 aa21.75■■□□□ 1.07
PRRT4-205ENST00000489835 CERKQ8TCT0 537 aa21.75■■□□□ 1.07
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
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PRRT4-205ENST00000489835 PROSER3Q2NL68 480 aa21.74■■□□□ 1.07
PRRT4-205ENST00000489835 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.74■■□□□ 1.07
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PRRT4-205ENST00000489835 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PRRT4-205ENST00000489835 C8orf34Q49A92 452 aa21.72■■□□□ 1.07
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PRRT4-205ENST00000489835 SLC4A3P48751 1232 aa21.72■■□□□ 1.07
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PRRT4-205ENST00000489835 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PRRT4-205ENST00000489835 MRC1P22897 1456 aa21.7■■□□□ 1.06
PRRT4-205ENST00000489835 NFKBIBQ15653 356 aa21.7■■□□□ 1.06
PRRT4-205ENST00000489835 USP16Q9Y5T5 823 aa21.7■■□□□ 1.06
PRRT4-205ENST00000489835 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.69■■□□□ 1.06
PRRT4-205ENST00000489835 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.69■■□□□ 1.06
PRRT4-205ENST00000489835 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PRRT4-205ENST00000489835 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PRRT4-205ENST00000489835 C8orf37Q96NL8 207 aa21.68■■□□□ 1.06
PRRT4-205ENST00000489835 KAT6BQ8WYB5 2073 aa21.68■■□□□ 1.06
PRRT4-205ENST00000489835 EXOC5O00471 708 aa21.68■■□□□ 1.06
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