RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488787.5

GTPBP1-212, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTPBP1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-212ENST00000488787 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
GTPBP1-212ENST00000488787 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
GTPBP1-212ENST00000488787 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
GTPBP1-212ENST00000488787 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP30.63■■■□□ 2.49
GTPBP1-212ENST00000488787 WDR63Q8IWG1 891 aa30.62■■■□□ 2.49
GTPBP1-212ENST00000488787 ZNF521Q96K83 1311 aa30.62■■■□□ 2.49
GTPBP1-212ENST00000488787 BTAF1O14981 1849 aa30.61■■■□□ 2.49
GTPBP1-212ENST00000488787 CCDC125Q86Z20 511 aa30.61■■■□□ 2.49
GTPBP1-212ENST00000488787 BABAM1Q9NWV8 329 aa30.6■■■□□ 2.49
GTPBP1-212ENST00000488787 IL16Q14005 1332 aa30.59■■■□□ 2.49
GTPBP1-212ENST00000488787 BTBD11A6QL63 1104 aa30.59■■■□□ 2.49
GTPBP1-212ENST00000488787 ATG3Q9NT62 314 aa30.58■■■□□ 2.49
GTPBP1-212ENST00000488787 ASAP1Q9ULH1 1129 aa30.58■■■□□ 2.49
GTPBP1-212ENST00000488787 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
GTPBP1-212ENST00000488787 CHL1O00533 1208 aa30.57■■■□□ 2.48
GTPBP1-212ENST00000488787 ZNF853P0CG23 659 aa30.57■■■□□ 2.48
GTPBP1-212ENST00000488787 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
GTPBP1-212ENST00000488787 CFAP44Q96MT7 982 aa30.57■■■□□ 2.48
GTPBP1-212ENST00000488787 APBA3O96018 575 aa30.56■■■□□ 2.48
GTPBP1-212ENST00000488787 IFT57Q9NWB7 429 aa30.56■■■□□ 2.48
GTPBP1-212ENST00000488787 SLC39A6Q13433 755 aa30.55■■■□□ 2.48
GTPBP1-212ENST00000488787 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP30.55■■■□□ 2.48
GTPBP1-212ENST00000488787 MIS18AQ9NYP9 233 aa30.55■■■□□ 2.48
GTPBP1-212ENST00000488787 PLSCR1O15162 318 aa30.54■■■□□ 2.48
GTPBP1-212ENST00000488787 GNAI1P63096 354 aa30.54■■■□□ 2.48
GTPBP1-212ENST00000488787 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
GTPBP1-212ENST00000488787 ZNF790Q6PG37 636 aa30.54■■■□□ 2.48
GTPBP1-212ENST00000488787 PAPPAQ13219 1627 aa30.54■■■□□ 2.48
GTPBP1-212ENST00000488787 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
GTPBP1-212ENST00000488787 EP400Q96L91 3159 aa30.53■■■□□ 2.48
GTPBP1-212ENST00000488787 TSPYL4Q9UJ04 414 aa30.52■■■□□ 2.48
GTPBP1-212ENST00000488787 KCNQ3O43525 872 aa30.51■■■□□ 2.47
GTPBP1-212ENST00000488787 PALLDQ8WX93 1383 aa30.51■■■□□ 2.47
GTPBP1-212ENST00000488787 KDM3BQ7LBC6 1761 aa30.51■■■□□ 2.47
GTPBP1-212ENST00000488787 ZBED9Q6R2W3 1325 aa30.5■■■□□ 2.47
GTPBP1-212ENST00000488787 GOLGA2Q08379 1002 aa30.5■■■□□ 2.47
GTPBP1-212ENST00000488787 TTC5Q8N0Z6 440 aa30.5■■■□□ 2.47
GTPBP1-212ENST00000488787 MBIPQ9NS73 344 aa30.48■■■□□ 2.47
GTPBP1-212ENST00000488787 BAG6P46379 1132 aa30.47■■■□□ 2.47
GTPBP1-212ENST00000488787 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
GTPBP1-212ENST00000488787 UBR2Q8IWV8 1755 aa30.46■■■□□ 2.47
GTPBP1-212ENST00000488787 LY75O60449 1722 aa30.46■■■□□ 2.47
GTPBP1-212ENST00000488787 KCPQ6ZWJ8 1503 aa30.46■■■□□ 2.47
GTPBP1-212ENST00000488787 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
GTPBP1-212ENST00000488787 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
GTPBP1-212ENST00000488787 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
GTPBP1-212ENST00000488787 FMNL2Q96PY5 1086 aa30.45■■■□□ 2.47
GTPBP1-212ENST00000488787 CAMKK2Q96RR4 588 aa30.45■■■□□ 2.47
GTPBP1-212ENST00000488787 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.46
GTPBP1-212ENST00000488787 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa30.45■■■□□ 2.46
GTPBP1-212ENST00000488787 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa30.44■■■□□ 2.46
GTPBP1-212ENST00000488787 E9PSI1 815 aa30.44■■■□□ 2.46
GTPBP1-212ENST00000488787 SIK1P57059 783 aa30.44■■■□□ 2.46
GTPBP1-212ENST00000488787 SLFN5Q08AF3 891 aa30.44■■■□□ 2.46
GTPBP1-212ENST00000488787 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
GTPBP1-212ENST00000488787 PROM2Q8N271 834 aa30.43■■■□□ 2.46
GTPBP1-212ENST00000488787 MYH16Q9H6N6 1097 aa30.43■■■□□ 2.46
GTPBP1-212ENST00000488787 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
GTPBP1-212ENST00000488787 DEFB132Q7Z7B7 95 aa30.42■■■□□ 2.46
GTPBP1-212ENST00000488787 VSIG10Q8N0Z9 540 aa30.42■■■□□ 2.46
GTPBP1-212ENST00000488787 CDCA7LQ96GN5 454 aa30.42■■■□□ 2.46
GTPBP1-212ENST00000488787 SLC4A9Q96Q91 983 aa30.42■■■□□ 2.46
GTPBP1-212ENST00000488787 HEG1Q9ULI3 1381 aa30.41■■■□□ 2.46
GTPBP1-212ENST00000488787 TXNRD1Q16881 649 aa30.41■■■□□ 2.46
GTPBP1-212ENST00000488787 SLC27A3Q5K4L6 730 aa30.41■■■□□ 2.46
GTPBP1-212ENST00000488787 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
GTPBP1-212ENST00000488787 ZNF831Q5JPB2 1677 aa30.4■■■□□ 2.46
GTPBP1-212ENST00000488787 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
GTPBP1-212ENST00000488787 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
GTPBP1-212ENST00000488787 FANCIQ9NVI1 1328 aa30.4■■■□□ 2.46
GTPBP1-212ENST00000488787 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
GTPBP1-212ENST00000488787 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
GTPBP1-212ENST00000488787 ATP6V1AP38606 617 aa30.38■■■□□ 2.45
GTPBP1-212ENST00000488787 LRRC4BQ9NT99 713 aa30.37■■■□□ 2.45
GTPBP1-212ENST00000488787 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
GTPBP1-212ENST00000488787 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
GTPBP1-212ENST00000488787 ITPK1Q13572 414 aa30.35■■■□□ 2.45
GTPBP1-212ENST00000488787 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
GTPBP1-212ENST00000488787 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
GTPBP1-212ENST00000488787 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
GTPBP1-212ENST00000488787 KCNQ4P56696 695 aa30.34■■■□□ 2.45
GTPBP1-212ENST00000488787 KRT24Q2M2I5 525 aa30.33■■■□□ 2.45
GTPBP1-212ENST00000488787 DNAJC10Q8IXB1 793 aa30.33■■■□□ 2.45
GTPBP1-212ENST00000488787 DUSP27Q5VZP5 1158 aa30.32■■■□□ 2.44
GTPBP1-212ENST00000488787 C8orf58Q8NAV2 365 aa30.32■■■□□ 2.44
GTPBP1-212ENST00000488787 TJP1Q07157 1748 aa30.32■■■□□ 2.44
GTPBP1-212ENST00000488787 RREB1Q92766 1687 aa30.3■■■□□ 2.44
GTPBP1-212ENST00000488787 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa30.3■■■□□ 2.44
GTPBP1-212ENST00000488787 HOXB7P09629 217 aa30.3■■■□□ 2.44
GTPBP1-212ENST00000488787 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
GTPBP1-212ENST00000488787 USP16Q9Y5T5 823 aa30.3■■■□□ 2.44
GTPBP1-212ENST00000488787 TAF1LQ8IZX4 1826 aa30.29■■■□□ 2.44
GTPBP1-212ENST00000488787 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
GTPBP1-212ENST00000488787 SOCS7O14512 581 aa30.29■■■□□ 2.44
GTPBP1-212ENST00000488787 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
GTPBP1-212ENST00000488787 LINC00116Q8NCU8 138 aa30.29■■■□□ 2.44
GTPBP1-212ENST00000488787 STARD3NLO95772 234 aa30.28■■■□□ 2.44
GTPBP1-212ENST00000488787 TSPYL6Q8N831 410 aa30.28■■■□□ 2.44
GTPBP1-212ENST00000488787 C5P01031 1676 aa30.27■■■□□ 2.44
GTPBP1-212ENST00000488787 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
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