RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483340.1

KIF1B-208, Transcript of kinesin family member 1B, humanhuman

TSL 2

Gene KIF1B, Length 839 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1B-208ENST00000483340 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa8.19□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 WASHC2AQ641Q2 1341 aa8.19□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 ATRNO75882 1429 aa8.19□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 HRO43593 1189 aa8.18□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 PDE3BQ13370 1112 aa8.18□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 BARGINQ6ZT62 677 aa8.18□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 KRT27Q7Z3Y8 459 aa8.18□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.18□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.18□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.18□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 MAP3K19Q56UN5 1328 aa8.18□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 NSD3Q9BZ95 1437 aa8.18□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 HOXC9P31274 260 aa8.17□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa8.17□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 WDR17Q8IZU2 1322 aa8.17□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 CCDC7Q96M83 1385 aa8.17□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 EXOC5O00471 708 aa8.16□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 POLKQ9UBT6 870 aa8.16□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 DDB1Q16531 1140 aa8.15□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.15□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.15□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.15□□□□□ -1.1
KIF1B-208ENST00000483340 ITSN1Q15811 1721 aa8.15□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa8.14□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 FAM196AQ6ZSG2 479 aa8.14□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 CCDC125Q86Z20 511 aa8.14□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 VSIG10Q8N0Z9 540 aa8.14□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa8.13□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 CRB1P82279 1406 aa8.13□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 OVOS2Q6IE36 1432 aa8.13□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 TK2O00142 265 aa8.13□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 IL2RBP14784 551 aa8.13□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 MTHFSP49914 203 aa8.13□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 FAM182BQ5T319 152 aa8.13□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 NBPF6Q5VWK0 638 aa8.13□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 NBPF4Q96M43 638 aa8.13□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 ALS2Q96Q42 1657 aa8.13□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa8.13□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 SLIT3O75094 1523 aa8.13□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 NSD2O96028 1365 aa8.12□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 TBC1D12O60347 775 aa8.12□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 RGS12O14924 1447 aa8.12□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 KIF24Q5T7B8 1368 aa8.11□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.11□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa8.11□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 INSRP06213 1382 aa8.1□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 FLT4P35916 1363 aa8.1□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 TATP17735 454 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 USHBP1Q8N6Y0 703 aa8.1□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.1□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 KCNK17Q96T54 332 aa8.1□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 EYA1Q99502 592 aa8.1□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.1□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 TRIM37O94972 964 aa8.09□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 PDE4AP27815 886 aa8.09□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 FOSBP53539 338 aa8.09□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 MFSD10Q14728 455 aa8.09□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
KIF1B-208ENST00000483340 RTL1A6NKG5 1358 aa8.09□□□□□ -1.12
KIF1B-208ENST00000483340 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa8.09□□□□□ -1.12
KIF1B-208ENST00000483340 NFAT5O94916 1531 aa8.08□□□□□ -1.12
KIF1B-208ENST00000483340 PIK3C2AO00443 1686 aa8.08□□□□□ -1.12
KIF1B-208ENST00000483340 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
KIF1B-208ENST00000483340 APBA3O96018 575 aa8.08□□□□□ -1.12
KIF1B-208ENST00000483340 IL13P35225 146 aa8.08□□□□□ -1.12
KIF1B-208ENST00000483340 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.08□□□□□ -1.12
KIF1B-208ENST00000483340 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa8.08□□□□□ -1.12
KIF1B-208ENST00000483340 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
KIF1B-208ENST00000483340 NRKQ7Z2Y5 1582 aa8.08□□□□□ -1.12
KIF1B-208ENST00000483340 BAG6P46379 1132 aa8.07□□□□□ -1.12
KIF1B-208ENST00000483340 SULT6B1Q6IMI4 303 aa8.07□□□□□ -1.12
KIF1B-208ENST00000483340 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
KIF1B-208ENST00000483340 CFAP53Q96M91 514 aa8.07□□□□□ -1.12
KIF1B-208ENST00000483340 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.07□□□□□ -1.12
KIF1B-208ENST00000483340 SPG7Q9UQ90 795 aa8.07□□□□□ -1.12
KIF1B-208ENST00000483340 AKAP12Q02952 1782 aa8.07□□□□□ -1.12
KIF1B-208ENST00000483340 EVI5O60447 810 aa8.06□□□□□ -1.12
KIF1B-208ENST00000483340 PPP2R1AP30153 589 aa8.06□□□□□ -1.12
KIF1B-208ENST00000483340 RALBP1Q15311 655 aa8.06□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms