RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 LRSAM1Q6UWE0 723 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 TSPY26PQ9H489 355 aa19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 TRHP20396 242 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 KIF3AQ9Y496 699 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF853P0CG23 659 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 USHBP1Q8N6Y0 703 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 PDE4CQ08493 712 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 CASC1Q6TDU7 716 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 TSPYL4Q9UJ04 414 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 KIF20BQ96Q89 1820 aa19.68■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 VGLL3A8MV65 326 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 DMTNQ08495 405 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 MAP3K19Q56UN5 1328 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 NEK4P51957 841 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 SPC24Q8NBT2 197 aa19.67■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 PDCL2Q8N4E4 241 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 MEIS3Q99687 375 aa19.66■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 G2E3Q7L622 706 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa19.65■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP19.64■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 LMOD2Q6P5Q4 547 aa19.64■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP19.63■□□□□ 0.734e-9■■■■□ 19.9
CCSAP-204ENST00000483092 ATP2B3Q16720 1220 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF428Q96B54 188 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 GCC1Q96CN9 775 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 PDLIM2Q96JY6 352 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 MCM5P33992 734 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 MYRIPQ8NFW9 859 aa19.63■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 TSHZ3Q63HK5 1081 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 AK9Q5TCS8 1911 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 CHMP3Q9Y3E7 222 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa19.62■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 ABTB2Q8N961 1025 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 ABCC4O15439 1325 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGAP45Q92619 1136 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 AATKQ6ZMQ8 1374 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 AGLP35573 1532 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 EYA1Q99502 592 aa19.61■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 DLC1Q96QB1 1528 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 DTNBO60941 627 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 MBD3O95983 291 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa19.6■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 KCNA6P17658 529 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 ADCY5O95622 1261 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 DRC7Q8IY82 874 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 PLCD3Q8N3E9 789 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 CHL1O00533 1208 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB22O15209 634 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 MSH6P52701 1360 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 BCL2L12Q9HB09 334 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 PLEKHG3A1L390 1219 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF592Q92610 1267 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 PTPRUQ92729 1446 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF710Q8N1W2 664 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 USP6P35125 1406 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 STK31Q9BXU1 1019 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 PHF14O94880 888 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 CEP85Q6P2H3 762 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 PRIMPOLQ96LW4 560 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 TRERF1Q96PN7 1200 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 USP26Q9BXU7 913 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 PTCH1Q13635 1447 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 ZDHHC9Q9Y397 364 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 REC8O95072 547 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 ANO2Q9NQ90 1003 aa19.53■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 FIBPO43427 364 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 RILPL2Q969X0 211 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 SIRT1Q96EB6 747 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 ERICH4A6NGS2 130 aa19.52■□□□□ 0.72
CCSAP-204ENST00000483092 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms