RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481414.5

KCNS3-205, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, human

TSL 4

Gene KCNS3, Length 560 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCNS3-205	ENST00000481414	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		32.05	■■■□□ 2.72
KCNS3-205	ENST00000481414	BAG6	P46379	1132 aa		32.04	■■■□□ 2.72
KCNS3-205	ENST00000481414	BTAF1	O14981	1849 aa		32.03	■■■□□ 2.72
KCNS3-205	ENST00000481414	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.72
KCNS3-205	ENST00000481414	CCDC27	Q2M243	656 aa		32	■■■□□ 2.71
KCNS3-205	ENST00000481414	NGEF	Q8N5V2	710 aa		32	■■■□□ 2.71
KCNS3-205	ENST00000481414	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
KCNS3-205	ENST00000481414	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		31.99	■■■□□ 2.71
KCNS3-205	ENST00000481414	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
KCNS3-205	ENST00000481414	ATG3	Q9NT62	314 aa		31.99	■■■□□ 2.71
KCNS3-205	ENST00000481414	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		31.98	■■■□□ 2.71
KCNS3-205	ENST00000481414	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		31.98	■■■□□ 2.71
KCNS3-205	ENST00000481414	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
KCNS3-205	ENST00000481414	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
KCNS3-205	ENST00000481414	PALLD	Q8WX93	1383 aa		31.94	■■■□□ 2.7
KCNS3-205	ENST00000481414	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
KCNS3-205	ENST00000481414	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		31.93	■■■□□ 2.7
KCNS3-205	ENST00000481414	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
KCNS3-205	ENST00000481414	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		31.92	■■■□□ 2.7
KCNS3-205	ENST00000481414	BTBD11	A6QL63	1104 aa		31.92	■■■□□ 2.7
KCNS3-205	ENST00000481414	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
KCNS3-205	ENST00000481414	WWC1	Q8IX03	1113 aa		31.92	■■■□□ 2.7
KCNS3-205	ENST00000481414	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	31.91	■■■□□ 2.7
KCNS3-205	ENST00000481414	PROM2	Q8N271	834 aa		31.91	■■■□□ 2.7
KCNS3-205	ENST00000481414	SLC39A6	Q13433	755 aa		31.9	■■■□□ 2.7
KCNS3-205	ENST00000481414	TXNRD1	Q16881	649 aa		31.9	■■■□□ 2.7
KCNS3-205	ENST00000481414	ZNF790	Q6PG37	636 aa		31.9	■■■□□ 2.7
KCNS3-205	ENST00000481414	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		31.9	■■■□□ 2.7
KCNS3-205	ENST00000481414	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		31.88	■■■□□ 2.69
KCNS3-205	ENST00000481414	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	31.88	■■■□□ 2.69
KCNS3-205	ENST00000481414	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		31.87	■■■□□ 2.69
KCNS3-205	ENST00000481414	SIK1	P57059	783 aa		31.87	■■■□□ 2.69
KCNS3-205	ENST00000481414	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		31.87	■■■□□ 2.69
KCNS3-205	ENST00000481414	PAPPA	Q13219	1627 aa		31.86	■■■□□ 2.69
KCNS3-205	ENST00000481414	LY75	O60449	1722 aa		31.86	■■■□□ 2.69
KCNS3-205	ENST00000481414	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		31.85	■■■□□ 2.69
KCNS3-205	ENST00000481414	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
KCNS3-205	ENST00000481414	CHL1	O00533	1208 aa		31.84	■■■□□ 2.69
KCNS3-205	ENST00000481414	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
KCNS3-205	ENST00000481414	WDR63	Q8IWG1	891 aa		31.84	■■■□□ 2.69
KCNS3-205	ENST00000481414	CFAP44	Q96MT7	982 aa		31.84	■■■□□ 2.69
KCNS3-205	ENST00000481414	KCNQ3	O43525	872 aa		31.83	■■■□□ 2.69
KCNS3-205	ENST00000481414	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
KCNS3-205	ENST00000481414	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		31.83	■■■□□ 2.69
KCNS3-205	ENST00000481414	IL16	Q14005	1332 aa		31.82	■■■□□ 2.68
KCNS3-205	ENST00000481414	ZNF853	P0CG23	659 aa		31.82	■■■□□ 2.68
KCNS3-205	ENST00000481414	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
KCNS3-205	ENST00000481414	IFT57	Q9NWB7	429 aa		31.82	■■■□□ 2.68
KCNS3-205	ENST00000481414	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		31.82	■■■□□ 2.68
KCNS3-205	ENST00000481414	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
KCNS3-205	ENST00000481414	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		31.81	■■■□□ 2.68
KCNS3-205	ENST00000481414	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		31.8	■■■□□ 2.68
KCNS3-205	ENST00000481414	ZNF521	Q96K83	1311 aa		31.8	■■■□□ 2.68
KCNS3-205	ENST00000481414	GNAI1	P63096	354 aa		31.8	■■■□□ 2.68
KCNS3-205	ENST00000481414	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		31.8	■■■□□ 2.68
KCNS3-205	ENST00000481414	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		31.8	■■■□□ 2.68
KCNS3-205	ENST00000481414	ATP6V1A	P38606	617 aa		31.79	■■■□□ 2.68
KCNS3-205	ENST00000481414	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
KCNS3-205	ENST00000481414	RREB1	Q92766	1687 aa		31.79	■■■□□ 2.68
KCNS3-205	ENST00000481414	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		31.78	■■■□□ 2.68
KCNS3-205	ENST00000481414	KCNQ4	P56696	695 aa		31.77	■■■□□ 2.68
KCNS3-205	ENST00000481414	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		31.76	■■■□□ 2.68
KCNS3-205	ENST00000481414	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.67
KCNS3-205	ENST00000481414	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		31.76	■■■□□ 2.67
KCNS3-205	ENST00000481414	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		31.76	■■■□□ 2.67
KCNS3-205	ENST00000481414	ITPK1	Q13572	414 aa		31.75	■■■□□ 2.67
KCNS3-205	ENST00000481414	MBIP	Q9NS73	344 aa		31.74	■■■□□ 2.67
KCNS3-205	ENST00000481414	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	31.73	■■■□□ 2.67
KCNS3-205	ENST00000481414	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		31.72	■■■□□ 2.67
KCNS3-205	ENST00000481414	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	31.71	■■■□□ 2.67
KCNS3-205	ENST00000481414	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	31.71	■■■□□ 2.67
KCNS3-205	ENST00000481414	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		31.7	■■■□□ 2.67
KCNS3-205	ENST00000481414	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		31.7	■■■□□ 2.67
KCNS3-205	ENST00000481414	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	31.7	■■■□□ 2.66
KCNS3-205	ENST00000481414	NBPF14	Q5TI25	921 aa		31.69	■■■□□ 2.66
KCNS3-205	ENST00000481414	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	31.68	■■■□□ 2.66
KCNS3-205	ENST00000481414	GOLGA2	Q08379	1002 aa		31.68	■■■□□ 2.66
KCNS3-205	ENST00000481414	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	31.67	■■■□□ 2.66
KCNS3-205	ENST00000481414	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	31.66	■■■□□ 2.66
KCNS3-205	ENST00000481414	AKT1S1	Q96B36	256 aa		31.66	■■■□□ 2.66
KCNS3-205	ENST00000481414	C5	P01031	1676 aa		31.66	■■■□□ 2.66
KCNS3-205	ENST00000481414	TJP1	Q07157	1748 aa		31.66	■■■□□ 2.66
KCNS3-205	ENST00000481414	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		31.65	■■■□□ 2.66
KCNS3-205	ENST00000481414	STARD3NL	O95772	234 aa		31.65	■■■□□ 2.66
KCNS3-205	ENST00000481414	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	31.65	■■■□□ 2.66
KCNS3-205	ENST00000481414	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		31.65	■■■□□ 2.66
KCNS3-205	ENST00000481414	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	31.65	■■■□□ 2.66
KCNS3-205	ENST00000481414	STK32B	Q9NY57	414 aa		31.65	■■■□□ 2.66
KCNS3-205	ENST00000481414	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	31.64	■■■□□ 2.66
KCNS3-205	ENST00000481414	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		31.64	■■■□□ 2.66
KCNS3-205	ENST00000481414	SLC15A2	Q16348	729 aa		31.63	■■■□□ 2.65
KCNS3-205	ENST00000481414	USP16	Q9Y5T5	823 aa		31.63	■■■□□ 2.65
KCNS3-205	ENST00000481414	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		31.62	■■■□□ 2.65
KCNS3-205	ENST00000481414		E9PSI1	815 aa		31.62	■■■□□ 2.65
KCNS3-205	ENST00000481414	ZNF827	Q17R98	1081 aa		31.62	■■■□□ 2.65
KCNS3-205	ENST00000481414	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		31.62	■■■□□ 2.65
KCNS3-205	ENST00000481414	C4B	P0C0L5	1744 aa		31.61	■■■□□ 2.65
KCNS3-205	ENST00000481414	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	31.61	■■■□□ 2.65
KCNS3-205	ENST00000481414	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	31.61	■■■□□ 2.65
KCNS3-205	ENST00000481414	SLFN5	Q08AF3	891 aa		31.61	■■■□□ 2.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms