RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 IL17REQ8NFR9 667 aa27.92■■■□□ 2.06
ACTB-211ENST00000480301 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa27.92■■■□□ 2.06
ACTB-211ENST00000480301 LRP5O75197 1615 aa27.92■■■□□ 2.06
ACTB-211ENST00000480301 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa27.92■■■□□ 2.06
ACTB-211ENST00000480301 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa27.91■■■□□ 2.06
ACTB-211ENST00000480301 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
ACTB-211ENST00000480301 SLC4A9Q96Q91 983 aa27.91■■■□□ 2.06
ACTB-211ENST00000480301 MRC1P22897 1456 aa27.9■■■□□ 2.06
ACTB-211ENST00000480301 ATP6V1AP38606 617 aa27.9■■■□□ 2.06
ACTB-211ENST00000480301 ITPK1Q13572 414 aa27.9■■■□□ 2.06
ACTB-211ENST00000480301 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa27.9■■■□□ 2.06
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHF1Q96S99 279 aa27.89■■■□□ 2.06
ACTB-211ENST00000480301 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
ACTB-211ENST00000480301 C5P01031 1676 aa27.88■■■□□ 2.05
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB7AO95365 584 aa27.88■■■□□ 2.05
ACTB-211ENST00000480301 LINC00116Q8NCU8 138 aa27.88■■■□□ 2.05
ACTB-211ENST00000480301 SPON1Q9HCB6 807 aa27.88■■■□□ 2.05
ACTB-211ENST00000480301 TAF1LQ8IZX4 1826 aa27.87■■■□□ 2.05
ACTB-211ENST00000480301 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
ACTB-211ENST00000480301 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa27.85■■■□□ 2.05
ACTB-211ENST00000480301 SLC39A6Q13433 755 aa27.84■■■□□ 2.05
ACTB-211ENST00000480301 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
ACTB-211ENST00000480301 MTFR1LQ9H019 292 aa27.83■■■□□ 2.05
ACTB-211ENST00000480301 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
ACTB-211ENST00000480301 QSER1Q2KHR3 1735 aa27.83■■■□□ 2.05
ACTB-211ENST00000480301 C4BP0C0L5 1744 aa27.82■■■□□ 2.04
ACTB-211ENST00000480301 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
ACTB-211ENST00000480301 AK7Q96M32 723 aa27.82■■■□□ 2.04
ACTB-211ENST00000480301 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
ACTB-211ENST00000480301 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa27.82■■■□□ 2.04
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ACTB-211ENST00000480301 NEFMP07197 916 aa27.81■■■□□ 2.04
ACTB-211ENST00000480301 TEFQ10587 303 aa27.81■■■□□ 2.04
ACTB-211ENST00000480301 AMIGO3Q86WK7 504 aa27.81■■■□□ 2.04
ACTB-211ENST00000480301 PTGER2P43116 358 aa27.8■■■□□ 2.04
ACTB-211ENST00000480301 SLC16A10Q8TF71 515 aa27.8■■■□□ 2.04
ACTB-211ENST00000480301 ZNF831Q5JPB2 1677 aa27.8■■■□□ 2.04
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ACTB-211ENST00000480301 SGIP1Q9BQI5 828 aa27.78■■■□□ 2.04
ACTB-211ENST00000480301 DCTN1Q14203 1278 aa27.77■■■□□ 2.04
ACTB-211ENST00000480301 NFE2L2Q16236 605 aa27.77■■■□□ 2.04
ACTB-211ENST00000480301 SMIM5Q71RC9 77 aa27.77■■■□□ 2.04
ACTB-211ENST00000480301 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.76■■■□□ 2.03
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ACTB-211ENST00000480301 MSH5O43196 834 aa27.75■■■□□ 2.03
ACTB-211ENST00000480301 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.75■■■□□ 2.03
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ACTB-211ENST00000480301 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
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ACTB-211ENST00000480301 ZNF790Q6PG37 636 aa27.74■■■□□ 2.03
ACTB-211ENST00000480301 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.74■■■□□ 2.03
ACTB-211ENST00000480301 PHF14O94880 888 aa27.73■■■□□ 2.03
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ACTB-211ENST00000480301 TTC5Q8N0Z6 440 aa27.73■■■□□ 2.03
ACTB-211ENST00000480301 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
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ACTB-211ENST00000480301 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
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ACTB-211ENST00000480301 TJP1Q07157 1748 aa27.7■■■□□ 2.03
ACTB-211ENST00000480301 ANP32CO43423 234 aa27.7■■■□□ 2.02
ACTB-211ENST00000480301 KCNQ3O43525 872 aa27.7■■■□□ 2.02
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ACTB-211ENST00000480301 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.7■■■□□ 2.02
ACTB-211ENST00000480301 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
ACTB-211ENST00000480301 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
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ACTB-211ENST00000480301 RIPK4P57078 832 aa27.67■■■□□ 2.02
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ACTB-211ENST00000480301 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.65■■■□□ 2.02
ACTB-211ENST00000480301 MSL1Q68DK7 614 aa27.65■■■□□ 2.02
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ACTB-211ENST00000480301 ADRA2BP18089 450 aa27.64■■■□□ 2.02
ACTB-211ENST00000480301 POLD1P28340 1107 aa27.64■■■□□ 2.02
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ACTB-211ENST00000480301 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
ACTB-211ENST00000480301 MIS18AQ9NYP9 233 aa27.62■■■□□ 2.01
ACTB-211ENST00000480301 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
ACTB-211ENST00000480301 STARD3NLO95772 234 aa27.59■■■□□ 2.01
ACTB-211ENST00000480301 NEUROD2Q15784 382 aa27.59■■■□□ 2.01
ACTB-211ENST00000480301 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
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