RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476860.1

MFSD1-211, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MFSD1, Length 460 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-211ENST00000476860 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
MFSD1-211ENST00000476860 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa7.64□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 PROCP04070 461 aa7.64□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.64□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.64□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 C1orf115Q9H7X2 142 aa7.64□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 NBPF15Q8N660 670 aa7.63□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.63□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 CEP126Q9P2H0 1117 aa7.63□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 MEN1O00255 615 aa7.62□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 ADAM23O75077 832 aa7.62□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 THBS1P07996 1170 aa7.62□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 SCTRP47872 440 aa7.62□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 POU4F2Q12837 409 aa7.62□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 RNF20Q5VTR2 975 aa7.62□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 MSTNO14793 375 aa7.61□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa7.61□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 CYP2U1Q7Z449 544 aa7.61□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 PHTF2Q8N3S3 785 aa7.61□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 OSBPL3Q9H4L5 887 aa7.61□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 OIP5O43482 229 aa7.6□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 SLFNL1Q499Z3 407 aa7.6□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.6□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 UCN2Q96RP3 112 aa7.6□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 CHIC2Q9UKJ5 165 aa7.6□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 PIK3CDO00329 1044 aa7.59□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 WASLO00401 505 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 F11P03951 625 aa7.59□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 MX2P20592 715 aa7.59□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.59□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 PODNQ7Z5L7 613 aa7.59□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 RNF135Q8IUD6 432 aa7.59□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 CCDC82Q8N4S0 544 aa7.59□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.59□□□□□ -1.19
MFSD1-211ENST00000476860 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.58□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 NEDD1Q8NHV4 660 aa7.58□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 NLRP3Q96P20 1036 aa7.58□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.58□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 MAP2K3P46734 347 aa7.57□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.57□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.57□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.57□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 GNRH1P01148 92 aa7.56□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa7.56□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 SERPINA10Q9UK55 444 aa7.56□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.55□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 IL2RAP01589 272 aa7.55□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 SKIP12755 728 aa7.55□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 LBRQ14739 615 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 XP32Q5T750 250 aa7.55□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.55□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.55□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.55□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 DOLKQ9UPQ8 538 aa7.55□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.55□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 USP17L5A8MUK1 530 aa7.54□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 ATP9BO43861 1147 aa7.54□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 TSGA10IPQ3SY00 556 aa7.54□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 A0A1B0GTH6 734 aa7.53□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 CENPCQ03188 943 aa7.53□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 CNKSR1Q969H4 720 aa7.53□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 ARID3AQ99856 593 aa7.53□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
MFSD1-211ENST00000476860 KRBA1A5PL33 1030 aa7.52□□□□□ -1.21
MFSD1-211ENST00000476860 USP17L3A6NCW0 530 aa7.52□□□□□ -1.21
MFSD1-211ENST00000476860 USP17L4A6NCW7 530 aa7.52□□□□□ -1.21
MFSD1-211ENST00000476860 MAP7D1Q3KQU3 841 aa7.52□□□□□ -1.21
MFSD1-211ENST00000476860 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.52□□□□□ -1.21
MFSD1-211ENST00000476860 CFAP70Q5T0N1 1121 aa7.52□□□□□ -1.21
MFSD1-211ENST00000476860 USP17L2Q6R6M4 530 aa7.52□□□□□ -1.21
MFSD1-211ENST00000476860 USP17L1Q7RTZ2 530 aa7.52□□□□□ -1.21
MFSD1-211ENST00000476860 KLRG1Q96E93 195 aa7.52□□□□□ -1.21
MFSD1-211ENST00000476860 XAGE2Q96GT9 111 aa7.52□□□□□ -1.21
MFSD1-211ENST00000476860 RAB6BQ9NRW1 208 aa7.52□□□□□ -1.21
MFSD1-211ENST00000476860 NDFIP2Q9NV92 336 aa7.52□□□□□ -1.21
MFSD1-211ENST00000476860 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
MFSD1-211ENST00000476860 COL8A1P27658 744 aa7.51□□□□□ -1.21
MFSD1-211ENST00000476860 NCOA4Q13772 614 aa7.51□□□□□ -1.21
MFSD1-211ENST00000476860 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa7.51□□□□□ -1.21
MFSD1-211ENST00000476860 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.51□□□□□ -1.21
MFSD1-211ENST00000476860 MKL2Q9ULH7 1088 aa7.51□□□□□ -1.21
MFSD1-211ENST00000476860 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms