RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475241.1

PKDCC-204, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 3

Gene PKDCC, Length 773 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-204ENST00000475241 ZNF827Q17R98 1081 aa22.47■■□□□ 1.19
PKDCC-204ENST00000475241 LGR6Q9HBX8 967 aa22.47■■□□□ 1.19
PKDCC-204ENST00000475241 NEFMP07197 916 aa22.46■■□□□ 1.19
PKDCC-204ENST00000475241 KCNQ4P56696 695 aa22.46■■□□□ 1.19
PKDCC-204ENST00000475241 MRC1P22897 1456 aa22.46■■□□□ 1.19
PKDCC-204ENST00000475241 CASZ1Q86V15 1759 aa22.45■■□□□ 1.18
PKDCC-204ENST00000475241 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.44■■□□□ 1.18
PKDCC-204ENST00000475241 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.44■■□□□ 1.18
PKDCC-204ENST00000475241 SPON1Q9HCB6 807 aa22.44■■□□□ 1.18
PKDCC-204ENST00000475241 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.44■■□□□ 1.18
PKDCC-204ENST00000475241 C5P01031 1676 aa22.43■■□□□ 1.18
PKDCC-204ENST00000475241 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PKDCC-204ENST00000475241 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.43■■□□□ 1.18
PKDCC-204ENST00000475241 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.43■■□□□ 1.18
PKDCC-204ENST00000475241 ATP6V1AP38606 617 aa22.42■■□□□ 1.18
PKDCC-204ENST00000475241 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.41■■□□□ 1.18
PKDCC-204ENST00000475241 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.41■■□□□ 1.18
PKDCC-204ENST00000475241 IL17REQ8NFR9 667 aa22.41■■□□□ 1.18
PKDCC-204ENST00000475241 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.41■■□□□ 1.18
PKDCC-204ENST00000475241 MTFR1LQ9H019 292 aa22.4■■□□□ 1.18
PKDCC-204ENST00000475241 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PKDCC-204ENST00000475241 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.39■■□□□ 1.18
PKDCC-204ENST00000475241 TEFQ10587 303 aa22.39■■□□□ 1.17
PKDCC-204ENST00000475241 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PKDCC-204ENST00000475241 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PKDCC-204ENST00000475241 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PKDCC-204ENST00000475241 C4BP0C0L5 1744 aa22.38■■□□□ 1.17
PKDCC-204ENST00000475241 ITPK1Q13572 414 aa22.38■■□□□ 1.17
PKDCC-204ENST00000475241 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.38■■□□□ 1.17
PKDCC-204ENST00000475241 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-204ENST00000475241 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-204ENST00000475241 AK7Q96M32 723 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-204ENST00000475241 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-204ENST00000475241 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-204ENST00000475241 ZBTB7AO95365 584 aa22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-204ENST00000475241 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-204ENST00000475241 SSFA2P28290 1259 aa22.34■■□□□ 1.17
PKDCC-204ENST00000475241 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
PKDCC-204ENST00000475241 NFE2L2Q16236 605 aa22.34■■□□□ 1.17
PKDCC-204ENST00000475241 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.34■■□□□ 1.17
PKDCC-204ENST00000475241 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.34■■□□□ 1.17
PKDCC-204ENST00000475241 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.33■■□□□ 1.17
PKDCC-204ENST00000475241 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PKDCC-204ENST00000475241 ANP32CO43423 234 aa22.32■■□□□ 1.16
PKDCC-204ENST00000475241 PTGER2P43116 358 aa22.32■■□□□ 1.16
PKDCC-204ENST00000475241 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.32■■□□□ 1.16
PKDCC-204ENST00000475241 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PKDCC-204ENST00000475241 SLC39A6Q13433 755 aa22.31■■□□□ 1.16
PKDCC-204ENST00000475241 ZNF790Q6PG37 636 aa22.31■■□□□ 1.16
PKDCC-204ENST00000475241 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.31■■□□□ 1.16
PKDCC-204ENST00000475241 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
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PKDCC-204ENST00000475241 MCM10Q7L590 875 aa22.3■■□□□ 1.16
PKDCC-204ENST00000475241 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PKDCC-204ENST00000475241 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.3■■□□□ 1.16
PKDCC-204ENST00000475241 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
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PKDCC-204ENST00000475241 ADRA2BP18089 450 aa22.29■■□□□ 1.16
PKDCC-204ENST00000475241 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
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PKDCC-204ENST00000475241 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PKDCC-204ENST00000475241 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.28■■□□□ 1.16
PKDCC-204ENST00000475241 RPS6KA4O75676 772 aa22.28■■□□□ 1.16
PKDCC-204ENST00000475241 RUNDC1Q96C34 613 aa22.28■■□□□ 1.16
PKDCC-204ENST00000475241 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PKDCC-204ENST00000475241 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.28■■□□□ 1.16
PKDCC-204ENST00000475241 MSH5O43196 834 aa22.27■■□□□ 1.16
PKDCC-204ENST00000475241 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PKDCC-204ENST00000475241 TJP1Q07157 1748 aa22.26■■□□□ 1.15
PKDCC-204ENST00000475241 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.26■■□□□ 1.15
PKDCC-204ENST00000475241 POLD1P28340 1107 aa22.26■■□□□ 1.15
PKDCC-204ENST00000475241 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PKDCC-204ENST00000475241 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.26■■□□□ 1.15
PKDCC-204ENST00000475241 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.26■■□□□ 1.15
PKDCC-204ENST00000475241 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PKDCC-204ENST00000475241 DCTN1Q14203 1278 aa22.25■■□□□ 1.15
PKDCC-204ENST00000475241 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.25■■□□□ 1.15
PKDCC-204ENST00000475241 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.25■■□□□ 1.15
PKDCC-204ENST00000475241 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.25■■□□□ 1.15
PKDCC-204ENST00000475241 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PKDCC-204ENST00000475241 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PKDCC-204ENST00000475241 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.25■■□□□ 1.15
PKDCC-204ENST00000475241 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PKDCC-204ENST00000475241 RIPK4P57078 832 aa22.24■■□□□ 1.15
PKDCC-204ENST00000475241 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PKDCC-204ENST00000475241 PHF14O94880 888 aa22.23■■□□□ 1.15
PKDCC-204ENST00000475241 STARD3NLO95772 234 aa22.23■■□□□ 1.15
PKDCC-204ENST00000475241 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PKDCC-204ENST00000475241 ARXQ96QS3 562 aa22.23■■□□□ 1.15
PKDCC-204ENST00000475241 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.23■■□□□ 1.15
PKDCC-204ENST00000475241 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.2■■□□□ 1.14
PKDCC-204ENST00000475241 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PKDCC-204ENST00000475241 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.2■■□□□ 1.14
PKDCC-204ENST00000475241 RFC4P35249 363 aa22.19■■□□□ 1.14
PKDCC-204ENST00000475241 KCNQ3O43525 872 aa22.18■■□□□ 1.14
PKDCC-204ENST00000475241 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PKDCC-204ENST00000475241 SMIM5Q71RC9 77 aa22.18■■□□□ 1.14
PKDCC-204ENST00000475241 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PKDCC-204ENST00000475241 CCDC184Q52MB2 194 aa22.17■■□□□ 1.14
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